产品简介：
阔然生物围绕胶质瘤患者术后靶向/免疫治疗及遗传筛查临床需求，提供治疗、预后相关基因检测，实现指南推荐的常见靶向基因全覆盖；指导患者的靶向、免疫治疗与遗传筛查，旨在全方位助力临床精准诊疗!
IDH1 突变胶质瘤患者接受个性化肽疫苗接种后诱导的新抗原特异性 T 细胞的深入表征
研究背景：
异柠檬酸脱氢酶（IDH）突变神经胶质瘤是一种在成人中诊断的恶性原发性脑肿瘤。FDA于 2024 年 8 月批准了第一个靶向 IDH 抑制剂用于治疗 2 级神经胶质瘤。但3 级和 4 级 IDH 突变神经胶质瘤的靶向治疗方案仍然缺失。
研究结论：
研究组纳入52名在新诊断和复发环境中确诊IDH1突变的神经胶质瘤（2-4级）患者，他们除了接受标准护理外，还接受了个性化的新抗原靶向肽疫苗。通过WES分析每个肿瘤的体细胞突变，并设计、制造和接种含有潜在新表位的肽疫苗。免疫监测显示，疫苗具有免疫原性，主要诱导CD4+ T和CD8+ T细胞反应。对mut-IDH1的免疫原性高（89%）。随后的T细胞受体（TCR）库测序显示，对mut-IDH1刺激反应的CD4+T细胞是多克隆细胞。值得注意的是，3例不同的患者被检测到两种mut-IDH1特异性TCRβ候选序列。这3例患者具有相同的HLA DQA-DQB等位基因。所获得的TCRβ序列可在自体体外单细胞转录组数据中追踪。该研究结果为针对IDH1的疫苗接种和T细胞转移策略提供了理论依据。
产品简介：
阔然生物推出的一站式NGP检测方案可对肾癌的肿瘤微环境进行全面解析，检测方案可纳入CD20、CD21、CD23、CD8、PDL1、IRF4、DAPI等指标深入研究肾癌患者肿瘤微环境中的TLS，提示患者预后和疗效。
IRF4 调控 ccRCC 三级淋巴结构成熟的机制
研究背景：
三级淋巴样结构（TLS）对肿瘤的进展和治疗反应有重要影响，但其在肾透明细胞癌（ccRCC）中的潜在调控机制尚不清楚。
研究结论：
该研究整合了928例ccRCC患者的转录组学和临床数据，构建了可分层预后并关联临床参数、肿瘤微环境及免疫治疗反应的TLS相关预后RiskScore（包括CCL22、LOXL1、LIPA、ADAM8和SAA1）。通过IHC和mIHC表征TLS成熟的异质性，scRNA-seq和空间转录组学分析发现IRF4 可增强 ccRCC 细胞恶性表型，高表达与未成熟 TLS 为主、CD8+T 细胞浸润少及不良预后相关。该研究强调了TLS信号和IRF4作为有前景的预后标志物和治疗靶点，为完善ccRCC的免疫治疗策略提供了新的途径。
产品简介：
阔然生物推出的一站式NGP检测方案可对肿瘤的肿瘤微环境进行全面解析，检测方案可纳入CD3、CD68、PD-1、PD-L1、CD8等指标深入研究胰腺腺鳞癌肿瘤微环境。
胰腺腺鳞癌鳞状细胞转化过程中免疫监视减弱为癌症干预提供新治疗机会
研究背景：
胰腺腺鳞癌（PASC）是一种罕见的胰腺癌亚型，与更常见的胰腺导管腺癌（PDAC）相比，预后更差、转移率更高。目前PASC肿瘤免疫微环境（TIME）的相应改变尚未充分阐明，缺乏针对性的免疫治疗策略。
研究结论：
PASC 的肿瘤免疫微环境比 PDAC 更具免疫抑制性，表现为 T 细胞（尤其是细胞毒性 T 细胞、记忆 T 细胞）数量减少，而免疫抑制性巨噬细胞增多，且鳞状细胞（SQC）区比腺癌细胞（ADC）区的 T 细胞耗竭更明显。PASC 中 PD-1/PD-L1 和 TIGIT/CD155 通路的表达模式与患者生存相关，其中 TIGIT⁺CD8⁺T 细胞和 CD155⁺CD68⁺巨噬细胞及其与肿瘤细胞的空间 proximity 可作为独立预后指标。总的来说，针对 PD-1/PD-L1 和 TIGIT/CD155 通路的免疫检查点抑制剂联合治疗可能成为 PASC 的潜在治疗策略。
产品简介：
阔然生物推出的一站式NGP检测方案可对肿瘤微环境进行全面解析，检测方案可纳入pan-CK、CD3、CD20、CD66b和CD68等指标，深入研究基于mIHC图像的自动化细胞注释和分类。
基于深度学习的mIHC图像自动化细胞注释和分类
研究背景：
HE染色是临床病理诊断的常规手段。组织病理学的单细胞分析为理解疾病进展和治疗反应背后的复杂细胞相互作用提供了一种强大的工具。然而，现有的努力受到低效且容易出错的人工注释的阻碍。
研究结论：
该研究没有使用人工注释，而是利用多重荧光免疫组化（mIHC）根据细胞谱系蛋白标记来定义细胞类型。通过在单细胞水平上将HE图像与同一组织切片的mIHC图像进行共配准，创建了一个包含1,127,252个细胞的高质量注释数据集，这些细胞来自组织微阵列核心。训练了一个深度学习模型，该模型结合了自监督学习和领域适应，能够在HE图像上对四种细胞类型进行分类，总体准确率为86%-89%，并且该细胞分类模型适用于全切片图像。还发现肿瘤微环境中特定免疫细胞之间的空间相互作用与患者的生存率和对免疫检查点抑制剂的反应有关。该研究为标准组织病理学的单细胞分析提供了一种可扩展的方法，并可能有助于发现用于精准肿瘤学的新空间生物标志物。
产品简介：
阔然生物脑膜瘤产品全面，包含指南共识推荐检测的重要分型（基因+染色体）、靶向、免疫、遗传等相关基因，连续多年满分通过NCCL、CAP等权威机构组织的室间质评，提供分型、预后、靶向和免疫治疗及遗传筛查等检测信息，全方位助力临床精准诊疗！
cIMPACT-NOW update 8：染色体CNV是风险评估标准
研究背景：
CNS肿瘤分类的分子和实用方法联盟（cIMPACT-NOW），由神经病理学专家和临床专家组成的工作小组，解决脑肿瘤分类和分级问题，总结目前的认识并提出建议。
研究结论：
此更新中，除了再次明确2021 WHO CNS5 中以形态学特征结合分子标志物（TERT启动子变异和CDKN2A/B纯合缺失）的脑膜瘤分级标准外，还提到：1）建议1p完全或节段缺失并同时伴有22q单体和/或NF2致癌变异的脑膜瘤至少应被分级为CNS WHO 2级，，即使组织学上看起来是良性的脑膜瘤；2）建议染色体6、10、14、18上发生≥2个全臂缺失并同时甲基化/RNA分型表明风险较高(MM-UNFAV；MC int A/int B；MC mal；RNA高风险)至少应被分级为CNS WHO 2级，即使组织学上看起来是良性的脑膜瘤。
END
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