实现电子化政府采购是发展的趋势，各地也做了一些有益的探索，取得了一定的成效，但也存在一些问题，使电子化政府采购发展进入“瓶颈”阶段，有些还因收费问题，造成市场主体怨声载道，综其原因，还是因为电子化政府采购的两个发展路径出现了问题，进入了误区。
《深化政府采购制度改革方案》强调，要建立技术支撑先进的现代政府采购制度。对于该要求有人的基本理解就是建立电子化政府采购平台或系统，让“人跑”变“网跑”，极大地方便了政府采购参与人。那么，电子化政府采购的平台或系统该由谁来建、谁来管呢？
搞电子化政府采购，是管理者提出和要求的，并非是被管理者要求的，电子化政府采购平台或系统它是一个管理模式的提升或换代，哪怕是方便了被管理者，为被管理者节省了时间、节约了相关费用，但与被管理者没有“丝毫关系”。管理者搞电子化政府采购，无论是开发、还是维运，都属于管理费用，理应由管理者承担。
因此，政府采购监督管理部门或公共资源交易中心应是建设者或管理者。如他们没有能力开发或管理，可以通过购买服务的方式解决。
那么，平台是如何收费的呢？现在大多数营运的基本模式是，政府采购监管部门或公共资源交易中心委托信息化网络公司开发政府采购管理交易系统（电子化采购平台，下同），支付一定的开发费用或不付费，政府采购管理交易系统的所有权依付费的多少决定，而后期的管理、维护由网络公司负责。为此，采购代理机构、供应商甚至采购人要在管理交易系统中的电子化采购平台上进行操作（采购代理机构组织采购活动、供应商参与政府采购活动竞争），必须先注册，然后购买“密钥”，再支付参与活动的费用（年费或每次的费用或评审专家的注册登记与变更费用），只有获得了相对应的密码后，才可以上线操作，或线上代理采购活动、或线上报名获得采购文件等。至于框架协议采购（原协议采购）则是集中采购机构在线上操作，供应商也需注册、报名，采购人在线上采购也需注册，购买“密钥”（有些地方不收采购人的费用）。
这种做法是违背《全国政府采购管理交易系统建设总体规划》总体要求的：该规划强调，全国政府采购管理交易系统建设及运维经费，由中央和地方分别承担，统一纳入部门预算管理，与财政信息化工作统筹安排。
所以，这类收费是没有依据的，是将政府的负担转嫁给了市场主体。因此，政府采购有些参与人说“加重了市场主体的负担”是有道理的。
而网络平台或电子化政府采购平台或系统，为政府采购参与人提供政府采购知识培训服务、为供应商提供定点定时资讯推送、在线解答政府采购中的疑惑等，这属于市场行为，是一种增值服务，收取适当的费用是允许的。市场主体是能够接受和支持的。
