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【二分类因变量机器学习】Python03-决策树机器学习模型(标准化代码)

【二分类因变量机器学习】Python03-决策树机器学习模型(标准化代码) 医学统计数据分析
2025-10-21
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导读:【二分类因变量机器学习】Python03-决策树机器学习模型(标准化代码)




二分类因变量机器学习



03-决策树机器学习模型

Python教程(标准化代码)

01

概念、原理、思想、应用

概念:决策树是一种模拟人类决策过程的树形结构模型,通过一系列规则对实例进行分类。

原理:从根节点开始,根据某个特征的值对数据进行划分,每个内部节点代表一个特征测试,每个分支代表测试结果,每个叶节点代表一个类别标签。划分标准通常基于信息增益、基尼不纯度等指标。

思想:通过递归地分割数据,构建一个树形结构,使得每个子集内的样本尽可能属于同一类别,即“分而治之”。

应用:因其可解释性强,常用于需要清晰规则的应用,如客户分群、医疗诊断辅助系统等。


进一步阐释:

 概念:基于树状结构的分类模型,通过一系列if-then规则进行决策

 原理:

- 节点分裂:选择最佳特征和分割点(基尼系数、信息增益)

- 递归分割:直到满足停止条件(深度限制、节点样本数等)

- 叶节点:包含最终的类别标签

 思想:

"分而治之"策略,将复杂问题分解为简单子问题

 应用:

- 客户细分

- 疾病诊断

- 金融欺诈检测

02

操作流程

一、设置环境和中文字体支持。

二、创建结果文件夹。

三、数据准备:读取Excel数据,预处理分类变量。

四、数据划分:分层抽样划分训练集和测试集。

五、模型构建:使用DecisionTreeClassifier构建决策树。

六、模型可视化:使用plot_tree和graphviz绘制决策树图。

七、模型评估:预测、计算准确率、灵敏度、特异性、AUC、ROC曲线。

八、变量重要性分析:提取并可视化特征重要性。

九、结果保存:保存预测结果、变量重要性、性能指标、混淆矩阵为Excel文件。

十、报告生成:使用python-docx生成Word报告,包含数据概览、方法、参数、性能、变量重要性、可视化等。

03

代码及操作演示

Python代码实现了一个完整的决策树机器学习分析流程,专门用于处理二元分类问题,涵盖了从数据准备到报告生成的自动化过程。

# pip install pandas numpy matplotlib seaborn scikit-learn graphviz python-docx openpyxl

# -*- coding: utf-8 -*-
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.tree import DecisionTreeClassifier, plot_tree, export_text
from sklearn.metrics import accuracy_score, confusion_matrix, roc_curve, auc, classification_report
from sklearn.preprocessing import LabelEncoder
from sklearn import tree
import graphviz
import os
from docx import Document
from docx.shared import Inches, Pt
from docx.enum.text import WD_ALIGN_PARAGRAPH
import warnings
warnings.filterwarnings('ignore')

# 设置中文字体支持
plt.rcParams['font.sans-serif'] = ['SimHei']  # 用来正常显示中文标签
plt.rcParams['axes.unicode_minus'] = False  # 用来正常显示负号

# 创建结果文件夹
results_dir = os.path.expanduser("~/Desktop/Results模型-dt")
if not os.path.exists(results_dir):
    os.makedirs(results_dir)

# 1. 数据准备
# 读取Excel数据
data = pd.read_excel("~/Desktop/示例数据.xlsx")

# 数据预处理 - 将分类变量转换为数值
categorical_cols = ['指标8''肥胖程度''教育水平''血型']
label_encoders = {}
for col in categorical_cols:
    le = LabelEncoder()
    data[col] = le.fit_transform(data[col].astype(str))
    label_encoders[col] = le

# 准备自变量和因变量
X = data.drop(['序号''结局'], axis=1)
y = data['结局']




plt.title('决策树模型')
plt.tight_layout()
plt.savefig(os.path.join(results_dir, 'decision_tree.jpg'), dpi=300, bbox_inches='tight')
plt.savefig(os.path.join(results_dir, 'decision_tree.pdf'), bbox_inches='tight')
plt.close()


# 使用graphviz绘制更美观的决策树
dot_data = tree.export_graphviz(
    dt_model,
    out_file=None,
    feature_names=X.columns,
    class_names=['0''1'],
    filled=True,
    rounded=True,
    special_characters=True
)
graph = graphviz.Source(dot_data)
graph.render(os.path.join(results_dir, 'decision_tree_graphviz'), format='pdf', cleanup=True)
graph.render(os.path.join(results_dir, 'decision_tree_graphviz'), format='png', cleanup=True)


# 4. 模型评估

# 5. 变量重要性分析
feature_importance = dt_model.feature_importances_
feature_importance_df = pd.DataFrame({
    'Variable': X.columns,
    'Importance': feature_importance
}).sort_values('Importance', ascending=False)

# 绘制变量重要性图
plt.figure(figsize=(12, 8))
plt.barh(range(len(feature_importance_df)), feature_importance_df['Importance'], align='center')
plt.yticks(range(len(feature_importance_df)), feature_importance_df['Variable'])
plt.xlabel('重要性')
plt.title('变量重要性')
plt.tight_layout()
plt.savefig(os.path.join(results_dir, 'variable_importance.jpg'), dpi=300, bbox_inches='tight')
plt.savefig(os.path.join(results_dir, 'variable_importance.pdf'), bbox_inches='tight')
plt.close()


# 绘制前10个最重要变量
top_10 = feature_importance_df.head(10)
plt.figure(figsize=(12, 6))
plt.barh(range(len(top_10)), top_10['Importance'], align='center')
plt.yticks(range(len(top_10)), top_10['Variable'])
plt.xlabel('重要性')
plt.title('前10个最重要变量')
plt.tight_layout()
plt.savefig(os.path.join(results_dir, 'variable_importance_top10.jpg'), dpi=300, bbox_inches='tight')
plt.savefig(os.path.join(results_dir, 'variable_importance_top10.pdf'), bbox_inches='tight')
plt.close()

# 6. 保存结果表格
# 保存预测结果
predictions = pd.DataFrame({
    'Actual': y_test.values,
    'Predicted_Class': y_pred,
    'Predicted_Probability': y_pred_prob
})
predictions.to_excel(os.path.join(results_dir, 'predictions.xlsx'), index=False)

# 保存变量重要性
feature_importance_df.to_excel(os.path.join(results_dir, 'variable_importance.xlsx'), index=False)

# 保存性能指标
performance_metrics = pd.DataFrame({
    'Metric': ['准确率''灵敏度''特异性''AUC'],
    'Value': [accuracy, sensitivity, specificity, roc_auc]
})
performance_metrics.to_excel(os.path.join(results_dir, 'performance_metrics.xlsx'), index=False)

# 保存混淆矩阵
conf_matrix_df = pd.DataFrame(conf_matrix,
                             index=['实际0''实际1'],
                             columns=['预测0''预测1'])
conf_matrix_df.to_excel(os.path.join(results_dir, 'confusion_matrix.xlsx'))

# 7. 生成Word报告
doc = Document()

# 添加标题
title = doc.add_heading('决策树模型分析报告', 0)
title.alignment = WD_ALIGN_PARAGRAPH.CENTER

doc.add_paragraph(f'生成日期: {pd.Timestamp.now().strftime("%Y-%m-%d")}')
doc.add_paragraph()

# 添加数据概览
doc.add_heading('数据概览', level=1)
doc.add_paragraph(f'总样本量: {len(data)}')
doc.add_paragraph(f'训练集样本量: {len(X_train)}')
doc.add_paragraph(f'测试集样本量: {len(X_test)}')
doc.add_paragraph(f'结局变量分布 - 0: {sum(y == 0)}, 1: {sum(y == 1)}')
doc.add_paragraph()

# 添加方法说明
doc.add_heading('分析方法', level=1)
doc.add_paragraph('本报告使用了决策树分类方法:')
doc.add_paragraph('- 使用所有变量构建决策树模型')
doc.add_paragraph('- 采用分层抽样划分训练集和测试集')
doc.add_paragraph('- 所有分类变量已转换为数值进行处理')
doc.add_paragraph()

# 添加模型参数
doc.add_heading('模型参数', level=1)
doc.add_paragraph(f'最大深度: {dt_model.get_params()["max_depth"]}')
doc.add_paragraph(f'最小分裂样本数: {dt_model.get_params()["min_samples_split"]}')
doc.add_paragraph(f'最小叶节点样本数: {dt_model.get_params()["min_samples_leaf"]}')
doc.add_paragraph(f'随机种子: {dt_model.get_params()["random_state"]}')
doc.add_paragraph()

# 添加模型性能
doc.add_heading('模型性能', level=1)
doc.add_paragraph(f'准确率: {accuracy:.4f}')
doc.add_paragraph(f'灵敏度: {sensitivity:.4f}')
doc.add_paragraph(f'特异性: {specificity:.4f}')
doc.add_paragraph(f'AUC: {roc_auc:.4f}')
doc.add_paragraph()

# 添加变量重要性说明
doc.add_heading('变量重要性', level=1)
doc.add_paragraph('基于决策树的特征重要性,前10个最重要变量排序如下:')

for i, (_, row) in enumerate(feature_importance_df.head(10).iterrows(), 1):
    doc.add_paragraph(f'{i}. {row["Variable"]} ({row["Importance"]:.4f})')

doc.add_paragraph()
doc.add_paragraph('完整变量重要性图表已保存至Results模型-dt文件夹。')

# 添加混淆矩阵
doc.add_heading('混淆矩阵', level=1)
table = doc.add_table(rows=3, cols=3)
table.style = 'Table Grid'

# 设置表头
hdr_cells = table.rows[0].cells
hdr_cells[0].text = ''
hdr_cells[1].text = '预测0'
hdr_cells[2].text = '预测1'

# 设置第一列
table.rows[1].cells[0].text = '实际0'
table.rows[2].cells[0].text = '实际1'

# 填充数据
table.rows[1].cells[1].text = str(tn)
table.rows[1].cells[2].text = str(fp)
table.rows[2].cells[1].text = str(fn)
table.rows[2].cells[2].text = str(tp)

doc.add_paragraph()

# 添加图片说明
doc.add_heading('模型可视化', level=1)
doc.add_paragraph('决策树结构图展示了模型的决策路径和规则:')
doc.add_picture(os.path.join(results_dir, 'decision_tree.jpg'), width=Inches(6))
doc.add_paragraph()

doc.add_paragraph('ROC曲线展示了模型在不同阈值下的性能表现:')
doc.add_picture(os.path.join(results_dir, 'roc_curve.jpg'), width=Inches(5))
doc.add_paragraph()

doc.add_paragraph('变量重要性图展示了各特征对预测结果的贡献程度:')
doc.add_picture(os.path.join(results_dir, 'variable_importance_top10.jpg'), width=Inches(5))
doc.add_paragraph()

doc.add_paragraph('所有可视化图表已保存至Results模型-dt文件夹。')

# 保存Word文档
doc.save(os.path.join(results_dir, 'decision_tree_analysis_report.docx'))

print("分析完成!所有结果已保存到Results模型-dt文件夹中,包括:")
print("- 决策树结构图 (JPG和PDF格式)")
print("- ROC曲线图 (JPG和PDF格式)")
print("- 变量重要性图 (JPG和PDF格式)")
print("- 预测结果表格 (Excel格式)")
print("- 变量重要性表格 (Excel格式)")
print("- 性能指标表格 (Excel格式)")
print("- 混淆矩阵表格 (Excel格式)")
print("- 完整分析报告 (Word格式)")




代码功能解析
代码主要实现了以下功能:

- 环境设置与数据准备:初始化分析环境,设置中文字体支持,并创建结果文件夹;随后读取Excel格式的示例数据,对分类变量(如指标8、肥胖程度)进行标签编码转换为数值,并划分数据为训练集和测试集。  

  - 模型构建与可视化:使用决策树算法(设置最大深度、最小分裂样本数等参数)训练模型,并通过matplotlib和graphviz生成决策树结构图,保存为多种格式(如JPG、PDF)。  

  - 模型评估与性能分析:在测试集上进行预测,计算准确率、灵敏度、特异性等指标,绘制ROC曲线并计算AUC值,同时生成混淆矩阵以评估模型性能。  

  - 变量重要性分析:提取特征重要性排名,绘制条形图展示所有变量及前10个最重要变量的贡献程度,并将结果保存为Excel表格。  

  - 结果保存与报告生成:自动化输出预测结果、性能指标和混淆矩阵为Excel文件,并使用python-docx库创建Word报告,整合数据概览、模型参数、性能摘要、可视化图表和变量排序。


各个包在代码中扮演特定角色:

  - pandas:用于数据读取(如Excel文件)、数据处理和DataFrame操作,支持数据清洗和转换。  

  - numpy:提供数值计算支持,辅助数组操作和数学运算。  

  - matplotlib.pyplot 和 seaborn:负责数据可视化,如绘制决策树图、ROC曲线和变量重要性图,并设置中文字体显示。  

  - scikit-learn:核心机器学习库,其中train_test_split用于数据划分,DecisionTreeClassifier构建模型,metrics模块计算评估指标,preprocessing处理标签编码。  

  - graphviz:生成更美观的决策树可视化图形,增强可读性。  

  - python-docx:创建和格式化Word报告,插入表格、图片和文本内容。  

  - os:处理文件路径和文件夹创建,确保输出结果有序保存。  

  - warnings:忽略运行时警告,保持代码输出整洁。

应用场景

- 整段代码的应用:  

- 该代码适用于需要透明、可解释的分类预测场景,例如在医疗诊断中预测疾病结局、金融领域评估客户风险,或社会科学研究中分析变量影响。  

  - 自动化流程提高了分析效率性和可重复性,适合快速生成学术论文、商业分析报告或教学演示材料,降低人工操作错误。  

  - 决策树的直观可视化特性便于向非技术人员解释模型决策过程,支持决策制定和模型优化迭代。


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