用来展示多个样品之间的关系或相关性,支持行列聚类显示、样品名称的显示、以及单元格宽高调整、样式调整。
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单元格样式 |
正方形、颜色、椭圆、数字 |
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聚类显示 |
可对行列、仅行、仅列进行聚类,也可选择不聚类。 |
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名称显示 |
与聚类显示类似,可灵活设置行列、仅行、仅列的名称显示,或选择不显示。 |
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单元格宽高设置 |
根据合理需求调整单元格的宽高 |
以环形布局展示数据,通过调整半径大小、圆环缺口、以及聚类树的显示;分析参数:标准化处理、行/列聚类方法等。
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分析参数 |
1.标准化:log10、none、row、col |
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2.行 / 列聚类方法:average、complete、single、ward.D2、ward.D |
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图表调整 |
1.边框颜色:给单元格边框添加任意颜色,建议添加白色或者跟图表相关颜色 |
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2.圆环半径 / 缺口:根据图表可自行选择合适的范围 |
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3.聚类树:是否显示在图表中,以及聚类树的颜色 |
用于直观呈现多个样品之间关联程度或相关性的图表类型,能够快速洞察数据样本间的潜在联系。图表调整方面提供图表类型切换与单元格样式调整。在分析配置上,支持选择不同的相关性算法、排序方式、系数阈值,并支持添加显著性标识。
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图表调整 |
1.图表类型:提供 7 种不同的图表类型 |
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2.单元格样式:支持切换 7 种风格的单元格样式 |
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3.图表字体设置(主标题、标签、图例) |
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分析参数 |
1.相关性算法:pearson(经典算法)、kendal、spearman |
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2.排序方式:original(原始)、AOE(特定)、FPC(逻辑)、hclust(聚类)、alphabet(字母) |
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3.系数值:颜色、大小等 |
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4.显著性标识:显著性水平、标识类型、大小、颜色 |
展示多样本间的关系或相关性。它提供了丰富的样式自定义功能,包括图表颜色、单元格宽高、聚类显示以及行列标签的显示控制。在参数层面,支持选择不同的相关性算法、聚类方法、距离度量及数据处理方式。
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图表样式 |
1.图表颜色:热图颜色和分组颜色支持修改 |
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2.单元格宽高:可拉伸单元格宽高来适配图表画布,达到理想效果 |
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3.图表分组:控制是否在图中显示分组信息 |
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4.热图单元格的数值:可编辑字体颜色和大小 |
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5.聚类显示:控制聚类树在图表行列中的显示 |
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6.行列名称显示:行列名称是否在图表中显示,行名字体样式:支持倾斜或正常 |
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参数调整 |
1.相关性算法:pearson(经典算法)、kendal、spearman |
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2.聚类方式:none、single、complete、average |
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3.距离算法:euclidean、manhattan |
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4.数据处理:none、log10 |
用于展示多个变量之间的相关性,通过颜色和数值直观呈现相关性强弱。图表提供7种单元格样式,参数设置:支持相关性算法的选择、自定义显著性标识(星标)以及按P值/R值筛选数据,满足深度分析需求。
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图表样式 |
1.单元格样式:圆形、颜色、椭圆、数字、饼图、阴影、正方形 |
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2.单元格大小:可合理调整 |
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参数设置(绘图之前设置) |
1.相关性算法:pearson、kendall、spearman |
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2.星标设置:水平、大小、颜色 |
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3.根据范围合理选择:P值筛选、R值筛选、物种数目 |
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4.未鉴定物种:删除、不删除 |
当绘图遇到下方展示的问题,可切换其它相关性算法、将相关性系数R值调整小一些,p值筛选选大一点的数值,放宽条件后如果还是不行,那就说明数据本身在设定参数条件下,没有显著关联的数据记录。
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供稿 | 大数据研发部
编辑 | 市场部
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