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搞定相关性分析:用对这5种热图就行了

搞定相关性分析:用对这5种热图就行了 派森诺基因云
2025-09-30
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导读:让数据更优雅的说话 让图表更具审美质量

热图图表类型适用场景优势特点:

交互热图:常规相关性分析直观简单;

交互环形热图:环形适合大数据集展示空间利用率高,视觉效果佳;

相关系数图:适合统计分析,可对显著性进行标识,多种排序功能;

交互相关系数图:分析参数丰富,图表样式多样化。

交互关联热图:用于展示多个变量之间的相关性,通过颜色和数值直观呈现相关性强弱。

这5类图表构成了完整的相关性分析可视化工具,满足从快速查看到底层分析的不同需求层次。

一、交互热图

用来展示多个样品之间的关系或相关性,支持行列聚类显示、样品名称的显示、以及单元格宽高调整、样式调整。

单元格样式

正方形、颜色、椭圆、数字

聚类显示

可对行列、仅行、仅列进行聚类,也可选择不聚类。

名称显示

与聚类显示类似,可灵活设置行列、仅行、仅列的名称显示,或选择不显示。

单元格宽高设置

根据合理需求调整单元格的宽高


二、交互环形热图

以环形布局展示数据,通过调整半径大小、圆环缺口、以及聚类树的显示;分析参数:标准化处理、行/列聚类方法等。

分析参数

1.标准化:log10、none、row、col

2.行 / 列聚类方法:average、complete、single、ward.D2、ward.D

图表调整

1.边框颜色:给单元格边框添加任意颜色,建议添加白色或者跟图表相关颜色

2.圆环半径 / 缺口:根据图表可自行选择合适的范围

3.聚类树:是否显示在图表中,以及聚类树的颜色


三、相关系数图

用于直观呈现多个样品之间关联程度或相关性的图表类型,能够快速洞察数据样本间的潜在联系。图表调整方面提供图表类型切换与单元格样式调整。在分析配置上,支持选择不同的相关性算法、排序方式、系数阈值,并支持添加显著性标识。

图表调整

1.图表类型:提供 7 种不同的图表类型

2.单元格样式:支持切换 7 种风格的单元格样式

3.图表字体设置(主标题、标签、图例)

分析参数

1.相关性算法:pearson(经典算法)、kendal、spearman

2.排序方式:original(原始)、AOE(特定)、FPC(逻辑)、hclust(聚类)、alphabet(字母)

3.系数值:颜色、大小等

4.显著性标识:显著性水平、标识类型、大小、颜色


四、交互相关系数图

展示多样本间的关系或相关性。它提供了丰富的样式自定义功能,包括图表颜色、单元格宽高、聚类显示以及行列标签的显示控制。在参数层面,支持选择不同的相关性算法、聚类方法、距离度量及数据处理方式。

图表样式

1.图表颜色:热图颜色和分组颜色支持修改

2.单元格宽高:可拉伸单元格宽高来适配图表画布,达到理想效果

3.图表分组:控制是否在图中显示分组信息

4.热图单元格的数值:可编辑字体颜色和大小

5.聚类显示:控制聚类树在图表行列中的显示

6.行列名称显示:行列名称是否在图表中显示,行名字体样式:支持倾斜或正常

参数调整

1.相关性算法:pearson(经典算法)、kendal、spearman

2.聚类方式:none、single、complete、average

3.距离算法:euclidean、manhattan

4.数据处理:none、log10


五、交互关联热图

用于展示多个变量之间的相关性,通过颜色和数值直观呈现相关性强弱。图表提供7种单元格样式,参数设置:支持相关性算法的选择、自定义显著性标识(星标)以及按P值/R值筛选数据,满足深度分析需求。

图表样式

1.单元格样式:圆形、颜色、椭圆、数字、饼图、阴影、正方形

2.单元格大小:可合理调整

参数设置(绘图之前设置)

1.相关性算法:pearson、kendall、spearman

2.星标设置:水平、大小、颜色

3.根据范围合理选择:P值筛选、R值筛选、物种数目

4.未鉴定物种:删除、不删除

当绘图遇到下方展示的问题,可切换其它相关性算法、将相关性系数R值调整小一些,p值筛选选大一点的数值,放宽条件后如果还是不行,那就说明数据本身在设定参数条件下,没有显著关联的数据记录。

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供稿  | 大数据研发部

编辑  | 市场部


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派森诺基因云,由国内外精英硕博团队倾力打造,凭借阿里云的强大的计算与存储优势,致力于为全球科研与医疗领域提供生物信息大数据分析与可视化解决方案。我们整合微生物组、转录组、基因组学、代谢组学、单细胞组学,以及多组学联合等多领域的分析研究,通过个性化定制服务和“一键式”简单操作,降低数据分析的复杂度,加速科研创新的步伐。

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