SCI级PCA图表合集（静态 | 交互 | 3D）

一

主成分图

主成分图通常指的是二维散点图，它使用第一主成分作为X轴，第二主成分作为Y轴，将每个样本点绘制在这个二维平面上。

图表解读

• 在图上位置相近的点，意味着它们在原始多变量空间中的特征相似。

• 在图上位置相距很远的点，则特征差异很大。

• X轴和Y轴旁边的百分比，表示该主成分能够解释原始数据总变异的比例。通常希望前两个主成分的累计贡献率越高越好。

二

交互PCA分析

图表解读

1. x轴为第一主成分，y轴为第二主成分。

2. 在图中不同的颜色表示不同的分组，根据基因表达值对各样品进行 PCA 主成分分析。

3. PCA 分析可以把相似的样本聚到一起，距离越近表明样本间相似性越高。

三

3D主成分图

3D主成分图是主成分图的自然延伸，它使用第一、第二和第三主成分分别作为X、Y、Z轴，在三维空间中展示数据点的分布。

图表解读

1. 解读方式与主成分图类似，但增加了一个维度。

2. 可以观察数据点在三维空间中的聚类、分离趋势和异常值。

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END

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