大数跨境
0
0

计算方法用于配体-蛋白质相互作用排序和结合亲和力预测——哪种方法适合您?

计算方法用于配体-蛋白质相互作用排序和结合亲和力预测——哪种方法适合您? 墨灵格信息科技
2025-10-20
5
导读:本文系统综述了计算化学在药物发现中用于评估配体–蛋白相互作用和优化配体的主要方法。合理运用这些方法可显著降低实验成本、加速决策进程,推动药物研发向“先计算、后实验”范式演进。
这篇最近发表在J. Med. Chem.(J. Med. Chem. 2025, 68, 19, 19795–19799)文章系统综述了计算化学在药物发现中用于评估配体–蛋白相互作用和优化配体的主要方法。首先介绍了分子对接和静电互补性(EC)等快速、低成本的初筛技术,适用于项目早期配体优先级排序。随后讨论了基于实验构效关系(SAR)的3D-QSAR与Activity Atlas等定量/定性模型,强调其对数据质量和配体多样性依赖性强。文章重点阐述了自由能微扰(FEP)作为结合自由能预测的金标准,包括相对FEP(高精度,适用于同系列优化)与绝对FEP(适用于新骨架识别),并指出其计算成本高但预测能力优越。最后,文章提出应根据项目阶段、可用数据、目标及计算资源,合理选择或组合不同策略,并展望了AI/ML与主动学习在提升计算效率中的潜力。合理运用这些方法可显著降低实验成本、加速决策进程,推动药物研发向“先计算、后实验”范式演进。详细内容,请点击左下角阅读原文。

【声明】内容源于网络
0
0
墨灵格信息科技
1234
内容 359
粉丝 0
墨灵格信息科技 1234
总阅读555
粉丝0
内容359