直接的回答是：可以，但有严格的条件限制。 核心原则是，这笔结算必须具有真实的跨境交易背景。
简单来说，国内企业与保税区外资企业之间的交易，不能被简单地视为“国内交易”。外汇管理局会根据交易的“实质”而非“形式”来判断是否允许外汇结算。
下面我们分两种情况来详细解释：
情况一：交易被视为“跨境贸易”（允许外汇结算）
这是最常见的情况。当交易的货物或服务流涉及“一线”（国境线）时，允许甚至鼓励使用外汇结算。
核心条件： 交易必须具有真实的跨境性。
典型场景举例：
货物贸易（最典型）：
场景：国内企业A向保税区内的外资企业B出口一批原材料。B企业将这批材料加工后，全部复出口到国外。
结算方式：企业A与企业B之间可以（也通常必须）用外汇（如美元）结算。
逻辑：虽然货物物理上从境内运到了保税区，但因其最终目的地是境外，这笔交易被视为出口。企业A可以凭出口报关单等凭证办理出口退税，并与B企业进行外汇结算。反之，如果B企业从国外采购货物，卖给国内企业A并进入国内市场，这也被视为进口，可以用外汇结算。
服务贸易：
场景：保税区内的外资企业C（如研发中心）为国内企业D在境外的项目提供技术服务。
结算方式：企业D可以向企业C支付外汇。
逻辑：服务的实际接受方和受益方在境外，具有跨境性质。
在这种情况下的流程：
国内企业需要像对待任何其他进出口贸易一样，进行报关（出口或进口），并凭借完整的单证（合同、发票、报关单等）通过银行办理收付汇。对于服务贸易，超过一定金额可能需要向税务部门进行备案。
情况二：交易被视为“国内贸易”（不适用外汇结算）
当交易完全发生在“二线”（保税区与国内非保税区之间），且货物或服务是用于国内市场最终消费时，则被视为国内贸易，必须使用人民币结算。
典型场景举例：
货物内销：
场景：保税区内的外资企业E将一批完税后的商品（例如，红酒已缴纳了关税和增值税）销售给国内的一家超市F。
结算方式：必须使用人民币结算。
逻辑：这批货物已经完成了进口清关手续，进入了中国市场流通。企业E和超市F之间的交易是标准的国内贸易，与两家都在区外的公司没有区别。
纯粹的区内消费服务：
场景：国内企业G为保税区内的外资企业H提供办公室保洁、国内法律咨询等完全在境内消费的服务。
结算方式：通常应使用人民币结算。
逻辑：服务的发生和消费都在中国境内，不具备跨境因素。
总结与决策关键点
判断交易实质：在签订合同前，必须明确货物的最终流向或服务的消费地。这是决定能否用外汇结算的根本。
咨询专业人士：务必提前与您的开户银行（国际业务部）和报关行进行沟通。他们会根据您的具体业务模式，给出最准确的结算和通关方案。
准备完整单证：如果确定可以外汇结算，务必保留好全套真实合法的单证（合同、发票、报关单等），以备银行和外汇管理局审核。
总而言之，“境内关外”的特殊性质决定了结算方式的灵活性。关键在于您的交易是“跨境”的还是“国内”的。