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一是从《个人所得税法》来看，工资薪金与劳务报酬根本区别在于任职或受雇。
①根据《中华人民共和国个人所得税法实施条例》第六条第一项第二项：
工资、薪金所得，是指个人因任职或者受雇取得的工资、薪金、奖金、年终加薪、劳动分红、津贴、补贴以及与任职或者受雇有关的其他所得。
劳务报酬所得，是指个人从事劳务取得的所得，包括从事设计、装潢、安装、制图、化验、测试、医疗、法律、会计、咨询、讲学、翻译、审稿、书画、雕刻、影视、录音、录像、演出、表演、广告、展览、技术服务、介绍服务、经纪服务、代办服务以及其他劳务取得的所得。
②从个人所得税税负来看，区分二者没有实质意义。
个人所得税综合所得包括工资、薪金，劳务报酬，稿酬，特许权使用费四项，区分劳务报酬与工资、薪金，只有预扣预缴的区别，因为二者年度汇算清缴均并入综合所得，没有实质上的意义。
二是从《劳动合同法》来看，工资薪金与劳务报酬根本区别在于是否建立劳动关系
①《中华人民共和国劳动合同法》第七条：用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系。用人单位应当建立职工名册备查。
②《劳动合同法》第十条建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。
已建立劳动关系，未同时订立书面劳动合同的，应当自用工之日起一个月内订立书面劳动合同。
用人单位与劳动者在用工前订立劳动合同的，劳动关系自用工之日起建立。
三是从财务核算来看，会计核算科目不同。
根据《会计准则》及《小企业会计准则》工资报酬的支付一般通过“应付职工薪酬”科目核算；劳务报酬一般通过成本费用类等科目核算。
四是从企业所得税扣除凭证看，工资薪金使用工资表形式内部凭证，劳务报酬一般使用劳务发票。
根据国家税务总局公告2018年第28号《企业所得税税前扣除凭证管理办法》第九条： 企业在境内发生的支出项目属于增值税应税项目（以下简称“应税项目”）的，对方为依法无需办理税务登记的单位或者从事小额零星经营业务的个人，其支出以税务机关代开的发票或者收款凭证及内部凭证作为税前扣除凭证，收款凭证应载明收款单位名称、个人姓名及身份证号、支出项目、收款金额等相关信息。
小额零星经营业务的判断标准是个人从事应税项目经营业务的销售额不超过增值税相关政策规定的起征点。
综上所述，农民工工资发放是否用专户，税法上没有明确规定。是否应开劳务发票，取决于是否任职受雇、是否建立劳动关系，增值税起征点以下的小额零星劳务不用开劳务发票。农民工工资也应依据个人所得税相关规定申报。请网友“佳小白”参考，以税务答复为准。