新个人所得税法将于2019年1月1日起施行，但为了为让人民群众尽早享受减税红利，将先行对纳税人在2018年10月1日（含）后实际取得的工资、薪金所得，按每月5000元进行扣除，并适用新税率表。对纳税人在2018年9月30日（含）前实际取得的工资、薪金所得，减除费用按照税法修改前规定执行，即按每月3500元进行扣除。国庆节后上班的第一天，很多单位在发放工资计算应扣缴的个人所得税时不清楚到底是按3500元扣除，还是按5000元扣除，在一定程度上造成了混乱。
其实这个问题的产生在于一些单位的工资发放日期及扣缴个人所得税申报日期并不统一，有的单位是本月发放上个月工资，有的是本月发放本月工资；有的单位是本月发工资后下个月申报，有的单位是本月发工资后本月15日前就申报。其实，根据税法规定，扣缴义务人每月或者每次预扣、代扣的税款，应当在次月15日内缴入国库，并向税务机关报送扣缴个人所得税申报表。单位在当月发工资后当月即申报扣缴，实际是提前了一个月进行申报。
个人所得税法中的工资“实际取得”时期并非会计意义上的工资所属时期。为了避免个人所得税申报时工资所属时期的口径不一，财税〔2018〕98号规定，发放的工资不论所属时期是哪个月份，只要是10月1日后“实际取得”的，在计算个人所得税时按5000元扣除；“实际取得”是10月1日前的，按3500元扣除。比如，10月8日发放会计所属时期为9月份的工资，按5000元扣除，应当在11月15日前申报入库；10月8日发放所属时期为10月份的工资，也应当按5000元扣除，并在11月15日前申报入库。10月份发放的工资，10月份一般在网上申报不了，全国只有少数省份可以网报。甘肃不行，但可以在大厅申报。另外，按照总局口径，9月底发放10月份的工资也视10月份为“实际取得”时期，可以按5000元进行扣除。
企业在申报时要注意申报系统中“所得期间”是指税法意义上工资的“实际取得”时期，而并不是会计意义上的工资所属时期。