作物抗逆、畜禽抗病、土壤污染修复等科研难题,背后核心都是基因表达的动态调控。转录组测序作为最通用的核心组学工具,能够快速锁定抗病、耐逆关键基因,解析代谢与信号调控通路。2026年凌恩生物合作客户持续发力,在植物、环境等领域连发多篇转录组相关高水平成果。本期汇总4篇高分文章,带你解锁农口转录组高分发文思路!
发表期刊:Advanced Science(IF=14.1)
研究对象:海洋耐盐菌株Halomonas sp. D47
组学技术:细菌完成图+原核链特异性转录组
实验设计:
主要结果:
该研究采用原核链特异性转录组解析二甲基巯基丙酸内盐(DMSP)裂解与二甲基硫(DMS)合成的转录调控机制。转录组结果表明,DMSP可显著诱导dddD、dddT、acuN、acuK等核心代谢基因上调,证实Halomonas sp. D47菌株拥有完整的DMSP降解通路。鉴定出AcuR(TetR家族)与AcuZ(LysR家族)两个关键转录调控因子。
图 Halomonas sp. D47中DMSP代谢的调控策略
发表期刊:ACS Nano(IF=16.1)
研究对象:枯草芽孢杆菌
组学技术:原核链特异性转录组
实验设计:
主要结果:
研究模拟淡水环境的营养胁迫特征,结合转录组技术分析枯草芽孢杆菌的基因表达谱。转录组结果显示,纳米塑料可显著调控氨基酸代谢、能量代谢与氧化应激通路,放大营养胁迫对菌株生长的抑制作用。并鉴定出sodA、katA等氧化应激标志基因与脂肪酸代谢差异基因,揭示了纳米塑料通过诱导氧化损伤、干扰物质能量代谢发挥毒性的分子机制。
图 营养胁迫下细菌对20 nm PS-NH₂纳米塑料的响应机制
发表期刊:Advanced Science(IF=14.1)
研究对象:拟南芥野生型、PHR转录因子突变体植株
组学技术:TRAP-seq+DMS-MaPseq+植物基因组+真核有参转录组+重测序
实验设计:
主要结果:
本研究依托嫁接材料开展转录组与TRAP翻译组测序,鉴定出大量缺磷特异移动mRNA;转录组对比突变体证明PHR不调控其转录,只负责介导长距离转运,且这类mRNA抵达受体组织后不再翻译。转录组联合RNA结构分析发现其5'UTR结构松散,是转运特有特征,从转录层面揭示PHR调控的移动mRNA以非编码形式介导植物缺磷响应的新型机制。
图 缺磷胁迫诱导植物体内mRNA的长距离运输
发表期刊:Environmental Science & Technology(IF=11.3)
研究对象:耐受型和敏感型粳稻
组学技术:酸类靶向代谢组学+真核有参转录组+WGBS
实验设计:
主要结果:
该研究利用转录组测序技术解析了不同抗性水稻在溴系阻燃剂胁迫下的基因表达特征。发现胁迫环境会显著重塑水稻转录组图谱,耐受品种中苯丙烷生物合成、细胞色素P450解毒、谷胱甘肽代谢等抗逆通路基因大量上调,而敏感品种的核糖体合成、DNA复制与损伤修复相关基因表达受到明显抑制。两类水稻不同的基因表达模式,最终造成品种间抗逆能力的显著差异。
图 水稻全基因组DNA甲基化变化及转录组响应特征
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