鼻病毒和肠道病毒型别众多、重组频繁,常规短片段扩增与短读长测序在复杂样本中面临组装和区分难题。
柏熠科技推出两款独立的病毒全基因组捕获试剂盒:一款面向鼻病毒,一款面向肠道病毒。两款产品均围绕全长扩增设计,配合高通量测序平台,为精细分型、混合感染和重组分析提供更连续的基因组信息。
病毒结构
肠道病毒与鼻病毒均属于小 RNA 病毒科肠道病毒属,具有无包膜、正链 RNA 基因组等特征。型别多、序列差异大,使“如何获得完整且可区分的基因组信息”成为全基因组研究的关键。
鼻病毒常见于呼吸道感染;EV-D68 等肠道病毒也可引起呼吸道疾病。对科研、病原监测与分子流行病学工作而言,全长序列能够提供比局部片段更完整的分型与进化分析依据。
从“叠瓦式扩增”到“全长扩增方案”
实验端需要同时应对型别多样、病毒载量偏低、RNA 降解和宿主核酸背景;分析端则要处理重组、混合感染及参考基因组不完整等问题。当多个近缘型别同时存在时,只有短片段信息,往往难以保留序列之间的长程关联。
全长扩增的主要价值
柏熠推出肠道病毒全基因组捕获试剂盒(BK-EV024A)与鼻病毒全基因组捕获试剂盒(BK-HRV024),两套方案以全长扩增为核心,从目标病毒出发,获得更连续的基因组信息,为后续分型、混合样本与重组研究提供基础。
柏熠鼻病毒与肠道病毒全基因组捕获试剂盒
肠道病毒全基因组捕获试剂盒(BK-EV024A)面向肠道病毒,覆盖 EV-A 至 EV-D 所有分型。
鼻病毒全基因组捕获试剂盒(BK-HRV024)面向鼻病毒,覆盖 RV-A、RV-B 和 RV-C 所有分型。
实测结果一览
PacBio 测试:25 份鼻病毒样本实现高覆盖
测试流程使用柏熠全自动柔性核酸纯化仪(BJNAP-240)进行提取,使用鼻病毒全基因组捕获试剂盒(BK-HRV024)进行扩增,随后使用PacBio 平台测序。
鼻病毒方案已完成 25 份样本测试,样本均获得全长扩增结果,覆盖 RV-A、RV-B 和 RV-C。
25 份鼻病毒样本全长扩增验证
混合样本测试
在特定混合样本测试中使用 BJNAP-240 提取、BK-HRV024 与 BK-EV024A 扩增并结合 ONT 测序后,可同时观察鼻病毒与肠道病毒信号,为复杂样本研究提供更多信息。
混合样本应用测试
总结
从局部片段走向全基因组,意义不仅在于获得更长的序列,更在于保留病毒基因组的连续信息,为精细分型、混合感染识别和重组分析提供更完整的研究基础。
围绕核酸提取、全长扩增与长读长测序,柏熠科技推出鼻病毒和肠道病毒两套解决方案,助力病原监测与分子流行病学研究。
——订购信息——
●
●
关于柏熠
杭州柏熠科技有限公司成立于2020年,是一家基于测序技术进行自动化工作站、生信分析平台、配套试剂等整体解决方案的研发以及转化的国家高新技术企业。现已开发上市的产品超100款,其中包括7款自动化工作站、20余款生信分析系统和80余款测序配套试剂,通过“设备-软件-试剂”三位一体服务链,推动测序技术高效适配多元化应用需求,简化并加速整个测序周期。
公司官网:www.baiyi-tech.cn
咨询邮箱:support@baiyi-tech.cn
电话:0571-87707730
手机:19957893257
- end -

