刚刚,Hugging Face 上出现了 NVIDIA 标签的 RFD4-Proteína。
但先纠偏:它不是「又一个只出蛋白骨干的扩散模型」,也不是简单把 RFdiffusion换皮改名。它做的是用 flow matching(流匹配)在同一潜空间里,联合生成蛋白序列和全原子结构,并按你要保留的靶点、酶 motif、配体等分子语境来条件化。
宣布窗口大约在 2026 年 10 月 19 日(权重日期);Diffusers 支持于 10 月 20 日合并进主仓。对价不适用:这是研究发布与开源权重,不是收购交易,金额写「不适用/未披露收购对价」。正式论文预印本项目页写明 forthcoming,先别把项目页当成已见刊全文。
图 1. HuggingPapers 配图。来源:X @HuggingPapers。
图 2. 来源:rfd4-proteina.org。
谁对谁:Baker Lab × NVIDIA GenAIR
一端是华盛顿大学 Institute for Protein Design(Baker Lab):蛋白设计顶流实验室,RFdiffusion 一系的学术源头。另一端是 NVIDIA GenAIR:芯片与生成式 AI 基础设施上的生命科学生成团队。通讯作者口径里,NVIDIA 侧可见 Kieran Didi,Baker 侧为 David Baker。
资本戏剧这里要克制:公开材料是联合研究与 BSD 开源权重,不是「某基金几亿美元买下实验室」。融资轮次、交易估值 未披露/不适用。可核的是机构对位:IPD 的湿实验叙事 × NVIDIA 的工程与 Hugging Face/Diffusers 分发。
更早的 NVIDIA Proteína(约 2025)主打骨干级 flow matching;RFdiffusion 主打结构扩散。RFD4-Proteína 名字像两者联姻,产品主张却是「序列 + 全原子 + 多分子类型 + 可加长思考与搜索」的同一采样器。
一个故事讲透机制
药化里常见痛点:你能生成很多看起来像蛋白的骨干,但侧链、修饰残基、糖和核酸不在同一个表示里;采样步数固定,约束只能事后过滤。
RFD4-Proteína 把标准/修饰氨基酸、糖、DNA、RNA 放进约 32维共享潜空间,用力场能量拉一把;生成时序列和全原子一起出。难的去噪步多算几轮(项目里叫 thinking/recycling);需要时用能量或结构预测分数做搜索。人负责标注「固定什么、设计什么」,模型负责在潜空间里采样,实验室再验证。
图 3. 共享潜空间示意。来源:项目页。
买方拼图:权重进 HF,故事进湿实验
NVIDIA/生态侧补的是可下载、可进 Diffusers 的工程入口:约 4.356 亿参数,词表 147类,许可 BSD 3-Clause。Baker/IPD 侧补的是湿实验漏斗,而不是只发基准分数。
公开口径里最容易刷屏的几组数:无约束人 TrkA 158/188亚微摩尔;磷酸化酯酶 89/288活性;lenacapavir 合成一步连接酶 4/67高于背景(更早 RFD3 战役 0/72)。计算机侧还称蛋白结合通过率 9.8%对 BindCraft **5.9%**,吞吐约 58倍。这些数字服务传播,细节与边界见项目页,正式预印本未出前勿当终审结论。
图 4. TrkA 湿实验战役节选。来源:项目页。
图 5. API 合成步骤连接酶概念验证。来源:项目页。
巨头/机构对位(软)
一边是学术顶流实验室把 de novo 设计推进到结合、糖基、磷酸化识别和催化,甚至点到原料药合成一步;一边是算力与框架厂商把同一模型送进 Hugging Face 和 Diffusers,降低复现门槛。
这和「只卖 API 推理」不是同一叙事,也和「某 AI 云收购一家靶点公司」不是同一叙事。对位轴是:谁掌握可复现的设计到验证闭环,谁掌握分发与算力入口。两边目标可以同句收束:都不想停在演示视频。
阻力与边界
预印本 尚未公开,方法全文与补充材料未可核到 PDF。HF 示例图 不是湿实验证明。部分吞吐对比写明测于旧权重。Lenacapavir 线是步骤级 PoC,不是工艺与监管路径。训练数据完整组分未全部随仓公开。没有收购对价可报。
写在最后
对国内团队,信号不是「又多一个开源 checkpoint」,而是验收标准在变:对方用的是联合序列与全原子条件采样 + 可核对湿实验漏斗,并用 BSD 把复现门槛打下来。接下来比的是谁能把同类漏斗写进自己的靶点和工艺步骤,而不是谁先转发一张结构渲染图。
文末链接
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https://rfd4-proteina.org/ -
https://huggingface.co/nvidia/RFD4-Proteina -
https://huggingface.co/nvidia/RFD4-Proteina-Diffusers -
https://github.com/RosettaCommons/RFD4-Proteina -
https://github.com/huggingface/diffusers/pull/15088 -
https://x.com/HuggingPapers/status/2112621318659281207 -
https://research.nvidia.com/labs/genair/proteina/ -
https://arxiv.org/abs/2503.00710

