为规范增值税发票管理，减并发票种类，方便纳税人发票使用，国家税务总局发布2015年第99号公告，明确以下三项内容：
一、提供货运服务的开票要求
1、发票种类：增值税一般纳税人提供货物运输服务，使用增值税专用发票和增值税普通发票。
2、备注栏填写：开具发票时，应将起运地、到达地、车种车号以及运输货物信息等内容填写在发票备注栏中，如内容较多可另附清单。
二、停用货运专票的过渡期
为避免浪费，方便纳税人发票使用衔接，货运专票最迟可使用至2016年6月30日，7月1日起停止使用。
三、铁路运输企业的发票使用规定
铁路运输企业受托代征的印花税款信息，可填写在发票备注栏中。中国铁路总公司及其所属运输企业（含分支机构）提供货物运输服务，可自2015年11月1日起使用增值税专用发票和增值税普通发票，所开具的铁路货票、运费杂费收据可作为发票清单使用。
一问：货运专票停用，增值税专票需要重新申请吗？
答：对于只有货运专票没有专票票种的纳税人，如果提供货物运输服务，使用增值税专用发票和增值税普通发票开具，应重新申请增值税发票票种和最高开票限额。
对于已经有增值税专用发票票种的纳税人，提供货物运输服务，可以直接使用增值税专用发票开具，不需再申请。若企业因生产经营变化，发票份额不能满足业务需要的，可以申请调整。
二问：货运企业重新申请增值税发票的，发票份额如何确定？
答：主管税务机关可以综合考虑原货运专票的限额和份数核定相关发票。但为避免浪费，货运专票最迟可使用至2016年6月30日，7月1日起才停止使用。建议相关纳税人6月30日前可继续使用货运专票。
三问：小规模纳税人的企业提供货运服务，开具什么发票？
答：已纳入增值税发票系统升级版的小规模纳税人，提供货物运输服务，开具增值税普通发票。尚未纳入增值税发票系统升级版的，使用网络开票系统开具通用机打发票。
四问：企业提供货运服务，改用增值税专票开具后，之前开出的货运专票，因信息有误，怎样申请开红字？
答：一般纳税人开具货物运输业增值税专用发票后，发生开票有误等情形但不符合作废条件的，应按照国家税务总局公告2015年第19号 第五条规定，通过申请《开具红字货物运输业增值税专用发票信息表》等流程开具红字发票。