大数跨境

MindWalk 在 Vultr云上基于 AMD GPU 部署 OpenFold3,推进药物发现

MindWalk 在 Vultr云上基于 AMD GPU 部署 OpenFold3,推进药物发现 Ai时代前沿
2026-10-13
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导读:MindWalk是一家原生人工智能的生物公司,公布了开源结构预测模型 OpenFold3 的生产部署成果。

MindWalk是一家原生人工智能的生物公司,公布了开源结构预测模型 OpenFold3 的生产部署成果。该部署与工程合作伙伴 AMD 和 Vultr 合作完成,运行于 Vultr Kubernetes Engine 和 Vultr Cloud GPU 之上,由 AMD Instinct MI325X GPU 提供算力,并通过 AMD Inference Microservices(AIM)交付。此次部署同时也是 AIM 在生产级生命科学场景下对 OpenFold3 的独立验证。

MindWalk 围绕自身的生产工作负载设计了评估,覆盖蛋白质、RNA、DNA、配体(ligand)及抗体-抗原(antibody-antigen)预测,并在其发现工作流中运行了从预处理到推理的完整路径,全部在其治理和人类科学审查之下进行。一个生产级预测环境在数分钟内完成部署,抗体-抗原推理时间较 MindWalk 此前的环境缩短约 5 倍。

此次部署扩展了 ReefIQ 底层的计算容量——ReefIQ 是 MindWalk 的生物上下文层,公司正随着 ReefIQ 在 2026 年 6 月发布后的企业级采用扩展而持续扩展规模。

"我们有意选择了开源模型。"MindWalk总裁兼 CEO Dr. Jennifer Bath 表示。"预测蛋白质形状正在变成任何团队都能买到的能力。但知道这个形状对一种疾病、对公司已经运行过的项目意味着什么——这不是人人能做到的。这正是 ReefIQ 所掌握的。这次部署改变的是:我们能以多快的速度、多低的成本将一个新的企业合作伙伴接入 ReefIQ。AMD 和 Vultr 已将计算侧变成了一条标准化路径,合作伙伴的项目可以在数分钟内开始运行,而不是等待一个定制构建。这缩短了从签约到首个结果的时间,也意味着我们的成本不必随着每增加一个合作伙伴而攀升。我们用真实的抗体-抗原项目而非挑选出来的漂亮数据集来测试,因为这才是合作伙伴真正施加的检验标准。"

MindWalk 运行了什么

MindWalk 运行了单链和多链蛋白质、蛋白质-RNA 和蛋白质-DNA 相互作用、使用 CCD 和 SMILES 输入的蛋白质-配体结构,以及来自其自身发现项目的抗体-抗原复合物,测试了包括 CPU 密集型预处理、多序列比对以及 GPU 加速推理在内的完整路径。评估还揭示了多 GPU 执行、推理控制和部署工作流方面的实践考量。MindWalk 将这些发现分享给了 AMD 和 Vultr,以指导后续的平台工作。

"MindWalk 展示了将开源 AI 应用于复杂生物分子结构预测以推进药物发现的真正可能。"Vultr 首席营销官 Kevin Cochrane 表示。"与 AMD 一起,Vultr 提供了支撑这项工作的 Kubernetes 原生 CPU 和GPU 基础设施,帮助团队将更少的时间花在管理基础设施上,将更多的时间用于用 OpenFold3 等模型推进科学发现。"

为什么这对行业很重要

预测能力正在快速标准化。模型权重是开放的,芯片供应商将模型打包为可部署的微服务,一次市场交易现在能在数分钟内交付过去一个资金充裕的研究组织需要数年才能搭建的东西。对于在 AI 使命下运营的制药研发组织而言,这消除了研究问题与答案之间最昂贵的障碍之一。

但标准化无法提供的是模型推理所依赖的生物上下文,以及使其输出在受监管项目中可用的治理。这正是 ReefIQ 所提供的层——而且每在其上运行一个项目,它就变得更有价值。

验证证明了什么

模型无关架构已被实证, OpenFold3 不是 MindWalk 的模型。MindWalk 在 Vultr 云中的 AMD Instinct GPU 上部署、运行和测量了一个第三方开源模型,运行在其自身的发现工作流中,处于其自身的治理和人类科学审查之下。将自己的模型带入 ReefIQ 的合作伙伴遵循的是同一条路径。

计算效率是一个成本杠杆。 Vultr 和 AMD 构成了 MindWalk 平台底层的计算基座。这一层的推理效率直接决定了以企业规模向合作伙伴交付 AI 工作流的成本。

合作伙伴的部署摩擦正在降低——不仅对 MindWalk 如此。 AMD 和 Vultr 构建的从开源模型到生产工作流的标准化 Kubernetes 原生路径,缩短了受监管环境中研究问题与答案之间的距离。这正是制药公司 CIO 最常提出的运营层面的问题,也是决定企业接入 ReefIQ 速度的关键。

【声明】内容源于网络
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