做分子、做细胞、做生信的人，绕不开一个网站：NCBI。
很多人对它的印象停留在「搜文献的地方」，或者「导师让我上去查一下这个基因」。打开首页，一堆密密麻麻的英文入口，看两秒就退出去了。
其实它比你想得好用得多。这篇就把它拆开讲清楚，看完就能上手。
图 1｜NCBI 官网首页（www.ncbi.nlm.nih.gov）
一、NCBI 是什么
全称 National Center for Biotechnology Information，美国国家生物技术信息中心，1988 年成立，隶属于美国国立卫生研究院（NIH）下面的国立医学图书馆（NLM）。
它干的事情就一件：把全球的生物信息学数据收集起来、存好、处理好，然后免费开放给所有人查。基因序列、蛋白序列、转录组、代谢组，还有海量文献，服务对象覆盖生物学、计算机科学、统计学等多个领域。
图 2｜NCBI 机构信息与官网入口
它的能力大致分四块
· 数据存储：全球多个物种的基因组、转录组、蛋白序列，以及大量生物学文献和物种信息。
· 数据检索：浏览器打开 www.ncbi.nlm.nih.gov，搜索栏里输关键词或研究主题，快速拿结果。
· 数据分析：提供多种在线工具，最有名的就是 BLAST，用于比较生物序列相似性，辅助基因功能预测和进化分析。
· 数据共享：与其他生物信息学数据库保持紧密联系和合作，不用你一个个网站跑。
图 3｜NCBI 资源列表
二、四个最常用的库，先记住名字
· GenBank：公开的核酸序列数据库，包含所有已知的核苷酸序列，以及相关的文献著作和生物学注释。
· PubMed：医学文献数据库，提供生物医学方面的论文，支持主题词、关键词、期刊等多种检索途径，并有识别相关术语和词汇的自动转换功能。
· Protein：蛋白质序列数据库，可以搜索特定蛋白，了解其结构、功能、相互作用等信息。
· BLAST：Basic Local Alignment Search Tool，局部相似性基本查询工具，用于比较生物序列的相似性，是 NCBI 最广为人知的分析工具。
图 4｜常用资源入口（核苷酸序列、蛋白结构、基因表达、基因图谱、文献检索、序列分析）
三、第一步，怎么搜一个基因
以 TNF 为例。
最直接的办法，在搜索框左边的下拉菜单里选 Gene 或者 Protein，然后输入基因名或者 ID。
图 5｜在搜索选项中选择 Gene 或 Protein
图 6｜输入基因名 TNF 进行搜索
如果懒得选，下拉菜单保持 All Databases，直接输名字，搜完在结果页里再点 Gene 或 Protein，或者其他需要的数据，效果一样。
图 7｜以基因为例的搜索结果
还有一个更快的写法：想查人的 TNF，直接在框里输 Homo sapiens TNF，物种和基因名一起给，省得在结果里翻。
图 8｜输入「Homo sapiens TNF」直接限定物种查询
四、第二步，基因详情页怎么看
点进基因详情，默认所有子菜单都是展开的，一屏一屏往下拉，信息量很大。选择自己需要查看的内容细看即可。把下拉菜单收起来，能看到整体框架。
图 9｜基因详情界面（子菜单全部展开）
图 10｜收起菜单后的板块目录
Summary
基因的官方名称、种属、别称和基本功能。进来看的第一块。
图 11｜Summary 板块
Genomic context
显示目的基因在染色体上的位置，以及有关基因主要序列位置的信息，顺便能看到上下游的邻居基因。想看详细结果，可以通过 Genome Data View 来查看。
图 12｜Genomic context 板块
图 14｜点击FASTA后界面
图 15｜点击genbank后界面
图 16｜
图 17｜Sequence Text View 界面
这里的颜色是有讲究的
· 蓝色：标记 5'UTR 或 3'UTR 序列。
· 红色：标记外显子。因为外显子要翻译成氨基酸，所以下面会给出对应的氨基酸序列。
· 绿色：标记内含子。内含子不翻译，所以下面没有氨基酸序列。
若没有显示完整的 5'UTR 或 3'UTR，可以点左上角的 Prev page 或 Next page 翻页。
Expression
显示目的基因在多个组织中的表达情况。
图 18｜Expression 板块
Bibliography
PubMed 中收录的目的基因相关文献，其中有关目的基因功能的研究论文，单独列在 GeneRIFs 版块。找功能线索优先看这块。
图 19｜Bibliography 板块
图 20｜NCBI Reference Sequences (RefSeq)
图 21｜NCBI Reference Sequences (RefSeq)
图 22｜蛋白详情界面与 3D 结构
（未完待续，下篇讲解 NCBI 的标志性功能和最常用工具之一——BLAST）