五、关于 BLAST
BLAST 是「局部相似性基本查询工具」（Basic Local Alignment Search Tool）的缩写。该程序将 DNA / 蛋白质序列与公开数据库所有序列进行匹配比对，从而找到相似序列。
图 23｜BLAST 首页入口
各个工具分别干什么
图 24｜BLAST 网页工具（一）
· 常规核酸 / 蛋白 BLAST：搜索界面只需要输入序列，返回最相似的几条序列的信息，而且会给出相关的系统发生树。
· Primer-BLAST：设计引物用，输入序列，设置温度、产物大小。
· Global Align：全局双序列比对，两个核苷酸序列的 Needleman-Wunsch 比对。
· Conserved Domains：搜索蛋白质或编码核苷酸序列中的保守结构域。
图 25｜BLAST 网页工具（二）
· Antibody BLAST：特定用于比对抗体或 T 细胞受体序列。
· Vector Screen：用于分析未知序列的长度、载体序列的区域，判断可能使用的克隆载体。
· COBALT：基于保守结构域结构的蛋白质同源结构域检索工具，主要功能是查找查询中包含超家族的结构域结构。
· MSA：使用保守结构域和局部序列相似性信息，进行多个蛋白质序列比对。
基本使用方法
四步：输入序列 — 设置参数 — 运行 — 结果分析。以核酸 BLAST 为例：
图 26｜核酸 BLAST 输入界面
图 27｜BLAST 结果页
结果怎么看
图 28｜BLAST 结果的图形显示
图 29｜详细比对结果
评价 BLAST 结果的标准主要有三项：E 值（Expect）、一致性（Identities）、缺失或插入（Gaps）。Gaps 在结果中用「—」来表示。E 值越小、一致性越高，比对结果越可信。
中科南京生命健康高等研究院成立于2018年1月，是南京市新型研发机构、南京市中试平台。研究院集成疫苗、抗体及小分子药物、免疫诊断三大核心技术平台，组建了一支由中国工程院院士、中国科学院领军科学家牵头的高水平科技人才团队，依托SPF级动物中心、BSL-2实验室及一批尖端设备，研究院可支撑传染病快速发现、精准建模、药物疫苗高效评价，实现从病原发现到药物开发的全链条技术支撑，驱动生物医药前沿探索。