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Scala Biodesign 让蛋白质在单分子层面——或50个分子层面——的重新设计变得轻松易行

Scala Biodesign 让蛋白质在单分子层面——或50个分子层面——的重新设计变得轻松易行 海外洞察
2023-09-11
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导读:生物科技领域正掀起一场“淘金热”,人工智能和其他工具被用于发现新药和疗法。Scala Biodesign 近日获得 550 万美元的新融资,

随着人工智能等工具在新药研发中的广泛应用,生物科技领域正迎来新一轮机遇。Scala Biodesign完成550万美元种子轮融资,致力于通过精准分子改造,提升现有或潜力药物的实用性与可制造性。

该公司源自特拉维夫魏茨曼科学研究所的研究成果,专注于预测蛋白质三维结构及其行为。在AlphaFold和RoseTTAfold颠覆该领域的背景下,Scala创始人认为,将结构预测能力与其他数据结合,可显著加速治疗性分子开发中最耗时的环节。

许多潜在药物虽具备功能活性,却因稳定性差(如室温或人体内易分解)而难以规模化生产与分发。理论上可通过替换部分分子片段提升稳定性,但关键在于:替换哪些位点?用什么替代?

CEO兼联合创始人拉维特·内策尔(Ravit Netzer)指出:“蛋白质开发高度复杂,即便在大公司也主要依赖试错。”传统方法常采用随机诱变,但在已知蛋白质结构的今天,盲目尝试已不再可行。

以含100个氨基酸的小蛋白为例,每个位置有20种可能,组合总数远超穷举极限。现实中,随机优化往往耗时漫长、成本高昂,甚至直接失败。

Scala 联合创始人拉维特·内策尔(左)和阿迪·戈尔登兹韦格(Adi Goldenzweig)。

这如同在段落中随机替换词语以期改善表达,实则需要同义词词典般的精准指导。Scala整合蛋白质结构预测、临床数据及天然蛋白观察,构建出能精准定位有效修饰的系统,从而提升稳定性、增强疗效或简化制造工艺。

全流程纯计算驱动,无需湿实验,最终输出少量高置信度序列,确保至少一个方向正确推进研发。

疟疾疫苗候选物在修改前后的对比。

例如,某实验室研究一种天然疟疾疫苗蛋白,但其热稳定性不足,难以承受运输储存条件。CTO兼联合创始人阿迪·戈尔登兹韦格(Adi Goldenzweig)表示:“他们明确面临热稳定问题,输入参数后获得三个优化方案,选定最优者后已进入临床试验。”他补充道:“理想是提供单一方案并具100%信心,目前虽未达此水平,但相比传统成千上万次尝试已是巨大进步。”

此类改造并非简单单点替换,大型蛋白可能需同步调整数十个位点。Goldenzweig强调:“无人会一次性进行超50个突变。”

Netzer表示:“我们在验证方面具备独特广度与深度,成功应用于抗体、酶等多种蛋白。我们反复证明蛋白质可实现重大改进,并希望将其规模化,而非仅限于博士课题。”这也正是“Scala”名称的由来。

目前,Scala正与多家未公开制药公司及实验室合作,商业模式灵活,优先提供服务验证而非自建IP,但不排除未来布局自有知识产权。

Netzer解释:“初创公司无法面面俱到,我们聚焦与合作伙伴协同,清晰展示技术价值,避免流程复杂化。”

本轮由TLV Partners领投的550万美元种子轮融资为首轮外部融资。结束隐身状态后,公司将拓展更多合作与研究,推动蛋白质工程迈向高效便捷的新阶段。

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