在海运物流中，小柜（20GP）、大柜（40GP）与高柜（40HQ）除基础柜租外，衍生费用差异显著且随箱型增大而递增。以下从五个核心环节解析各箱型费用差距。
港口与码头费用
码头操作费（THC）
该费用按箱型阶梯收取，40GP/40HQ通常为20GP的1.5至2倍，是费用差距最直观的环节。
港务港建费
依据箱型或重量计征，大柜与高柜因尺寸及载重更大，费用高于小柜。
堆存费与滞箱费
超期堆存及滞箱均按天计费。大柜、高柜单价更高且占用码头资源更多，超期产生的成本更为敏感。
内陆运输与提还箱
拖车费
受路线、车型及限重等因素影响，40GP/40HQ拖车成本比20GP高出30%至60%。
提箱与还箱费
部分堆场对大柜、高柜收取较高操作费；偏远或小型堆场还可能额外加收调箱费。
装卸与加固费
大柜、高柜货物更重、体积更大，导致人工与机械成本增加，所需加固材料用量也相应增多。
报关与查验环节
报关费
多数情况下按票计费，若按箱计费则大柜、高柜费用更高。此外，多品名、高价值货物的申报复杂度也会推高成本。
查验费
海关开箱、过机、掏箱等查验费用按箱型收取。大柜、高柜因操作空间大、货物数量多，费用显著高于小柜。
熏蒸与检疫费
涉及木质包装或特定货物的熏蒸、检疫均按箱型计费，大柜、高柜费用相对更高。
附加费与特殊费用
旺季附加费与拥堵费
旺季附加费（PSS）、拥堵费（CS）等多数按箱计费，40GP/40HQ费用约为20GP的1.5至2倍。
燃油附加费
部分航线按箱型阶梯收取BAF/FAF。大柜、高柜因占用舱位与运力更多，附加费标准更高。
超重费
小柜限重约21至22吨，大柜/高柜限重约26至28吨。超重部分按吨加收，大柜超重成本更为突出。
特殊操作费
开顶柜、框架柜等特种箱的吊机与绑扎费，以及危险品、冷藏箱的操作费，在大柜、高柜上成本更高。
保险与其他成本
货运保险费
保费按货值计算。大柜、高柜通常装载货量与货值更高，保险费用相应增加。
文件与杂费
电放费、改单费等一般按票收取，箱型间差异不大；但涉及改港、退关等特殊操作时，大柜、高柜在码头与船公司端的费用更高。