互联网之于信息产业,正如基因组计划之于现代生物学。每一代基础设施的建成,都将极大拓展整个领域的可能性。如今,生命科学正迎来新一代基础设施:AI 虚拟细胞(AI Virtual Cell,AIVC)。
从微观视角看,蛋白质是零件,细胞是机器。过去十年,以 AlphaFold 为代表的 AI 工具解决了设计“新零件”的难题,而构建“新机器”则是 AI 在生物领域创造核心价值的关键。AIVC 旨在计算机中构建细胞的“数字镜像”,模拟其在药物、基因编辑或环境变化干预下的动态演变。
2024 年 12 月,斯坦福大学、哈佛大学、微软研究院等机构的 42 位学者在《细胞》(Cell)期刊联合发表文章,系统提出了 AI 构建虚拟细胞的研究框架。这标志着 AIVC 从分散的技术探索迈入系统化发展的快车道,被视为继 AlphaFold 之后的又一里程碑时刻。
AIVC 不仅是技术方向的突破,更具备巨大的产业价值。传统 AI 制药(AIDD)虽提升了候选分子发现效率,但新药研发仍受制于“双十定律”,九成以上失败发生在临床转化阶段。AIVC 将预测对象从分子推进至细胞尺度,致力于在计算空间模拟细胞状态变化,有望大幅压缩实验成本,革新药物发现流程,并为细胞治疗、基因疗法提供关键计算支撑。
基于此,《麻省理工科技评论》中国在中关村科学城管理委员会指导下,联合百曜科技发布《AI 虚拟细胞(AIVC)技术趋势、产业生态与应用前景研究报告》。报告梳理了 AIVC 的全球技术路线与产业格局,为中国科研工作者、产业界及投资人提供参考。
范式重构:从“分子命中”到“细胞响应”
AIVC 是一种跨尺度、多模态的大规模神经网络模型,能够表征并模拟细胞在分化、发育、衰老及人为扰动下的状态转换。理解其战略价值,需将其置于 AI for Science 的演进脉络中审视。
传统 AIDD 主要解决分子结构与互作问题,难以判断靶点在特定疾病细胞中的真实响应。AIVC 则将研究对象从“分子层面”推进至“细胞层面”,把细胞视为由基因调控网络、信号通路及代谢过程构成的动态系统,实现从“靶点命中”到“细胞响应”预测的跨越。
这一进展得益于单细胞测序、空间组学、扰动实验及自动化平台的成熟,使得细胞状态与表型结果转化为可计算数据。政策、技术、监管与资本的四重共振,共同为 AIVC 打开了发展窗口。
图 | AIVC 是 AI 时代生命科学的新基础设施(来源:《麻省理工科技评论》中国、Bunne et al., Cell, 2024)
技术四层:数据、模型、自主智能与干湿闭环
AIVC 的构建可拆解为数据、模型、自主智能和干湿闭环四个核心层级。
图丨AIVC 构建的数据、模型、应用分层(来源:《麻省理工科技评论》中国、百曜科技访谈)
数据层:多源协同与高质量加工
AIVC 依赖四类数据的协同:细胞静态数据(单细胞转录组)、扰动 - 响应数据、临床数据及生物学先验知识。数据进入模型前需经过严格加工:
- 去噪:剔除技术偏差,保护稀有细胞状态的弱信号;
- 去重:控制冗余比例,避免过度学习;
- 标准化:统一不同来源与批次的表达规则;
- 跨模态对齐:建立不同来源信息的内在关联,这是难度最高的核心环节。
模型层:从静态表征到动态演化
AIVC 模型正经历快速迭代:
- 静态表征:早期以 Transformer 为主的自监督预训练模型(如 Geneformer),主要回答“细胞是什么”;
- 扰动预测:引入干预前后对照数据(如 GEARS、STATE),回答“细胞如何变化”;
- 动态演化:利用世界模型在潜在空间预测未来状态(如 CellOS、AlphaCell、AIDO Cell),回答“细胞如何演化”。
当前模型参数已从百万级跃升至十亿级,但单纯扩大规模并不必然提升零样本泛化能力,训练目标、扰动覆盖及细胞上下文同样关键。
图丨AIVC 模型预训练(来源:《麻省理工科技评论》中国、Yang X, et al. Cell Research, 2024 等)
自主智能:任务调度与推理
通用大模型负责理解自然语言提问与规划,AIVC 模型负责状态预测,智能体(Agent)将二者串联,完成从问题理解、虚拟扰动到结构化输出的闭环,并对接湿实验验证。
图丨自主智能工作流(来源:《麻省理工科技评论》中国)
干湿闭环:核心竞争力所在
真正决定 AIVC 长期竞争力的是“数据生产 - 模型预测 - 实验验证 - 数据回流”的闭环。自动化实验平台连接两端,每一轮实验产生的新数据与误差反馈,经回流校准后持续提升模型在特定场景的预测可靠性。其中,失败实验、负样本等多时间点采样数据构成了难以复制的护城河。
图 | 数据 - 模型 - 实验的循环飞轮(来源:《麻省理工科技评论》中国、百曜科技访谈)
产业生态:从模型授权到联合研发
AIVC 已形成清晰的产业价值链:上游涵盖测序平台、数据资源及算力设施;中游提供细胞表征与扰动预测能力;下游在药物研发、细胞治疗等场景兑现价值。
图 | AIVC 价值链:上游基础提升上限,下游场景兑现价值(来源:《麻省理工科技评论》中国)
产业格局呈现新锐公司与成熟企业双线并进。海外如 Xaira Therapeutics、Recursion,国内如百曜科技、英矽智能等,正将 AIVC 作为核心引擎。科技巨头(腾讯、Google DeepMind、NVIDIA 等)也在加速布局。
2024 至 2026 年间,资本市场关注度显著抬升。Xaira Therapeutics 成立即获 10 亿美元承诺资本;国内百曜科技、元示科技等也相继完成数亿元融资。产业合作已从概念验证进入实际交付:GSK 授权 Noetik 模型、Recursion 与罗氏合作管线进入早期发现阶段、Cellular Intelligence 收购诺和诺德帕金森疗法项目等,均标志着 TechBio 领域规模化落地的开始。
图 | AIVC 产业呈现新锐公司与成熟企业双线并进格局(来源:《麻省理工科技评论》中国)
图 | 产业合作推动 AIVC 走向产业研发实践(来源:《麻省理工科技评论》中国)
能力验证:从“学术指标”走向“产业指标”
2025 年,首届虚拟细胞挑战赛(VCC)由 Arc Institute 发起,成为检验 AIVC 真实预测价值的全球风向标。中国团队表现亮眼:百图生科旗下 BioMap Research 团队摘得最终大奖,百曜科技创始团队参与构建的模型在决赛全能榜单全球排名第二。中国 AIVC 研究正从“跟随者”转向“引领者”。
2026 VCC 赛季进一步引入零样本预测任务,重点考察模型在未见过细胞背景下的迁移能力,这对降低产业研发成本具有极高指导意义。
关键挑战与六大趋势
当前 AIVC 仍面临数据基础不成熟、多模态对齐困难、干湿闭环缺乏长期运转场景等挑战。未来演进呈现六大趋势:
趋势一:参数量不再是唯一标准
模型规模虽已跃升至十亿级,但效果更取决于训练目标、扰动覆盖度及数据多样性,单纯堆砌参数无法带来更好的零样本泛化能力。
趋势二:私有"AI-ready"数据成关键要素
公开数据库不等于可用数据。围绕模型训练目标专门设计实验获得的“新生产数据”,以及通过干湿闭环持续更新的自有数据,将成为企业的核心护城河。
趋势三:干湿闭环成为产业化门槛
有效的闭环需同时满足:持续产生新数据、模型影响研发决策、客户愿意付费。缺少任一环节都无法转化为持续的资产与能力。
趋势四:通用模型与垂直落地缺一不可
企业需兼顾跨场景预测能力的构建与具体疾病/管线的垂直落地。两条路径无固定先后顺序,但长期来看必须兼备。
趋势五:产业协同与政策推动成放大器
大型药企将从客户转变为生态共建者,共同定义技术标准;政府则通过大科学装置与共享平台建设,提升整体支撑能力。
趋势六:投资逻辑转向“平台 + 兑现”双重定价
长期价值取决于模型平台的预测能力与复用性,短期价值则需通过具体研发场景的收入与验证来兑现。
重新定义生命科学的边界
人体由 37 万亿个细胞构成,每个细胞都是精密运转的机器。从读取基因序列到预测蛋白质结构,再到模拟整个细胞行为,AI 正沿着生命组织层级逐级攀升。
AIVC 开启了最关键的一次跨越:让计算机不仅识别生命的组成部分,更理解生命系统的运转规律。它将在验证前预见结果,在临床前缩小方向,推动生命科学从依赖试错的经验学科,演变为可预测、可模拟的精确科学。
技术尚在早期,但方向已不可逆。唯有尊重生命系统的复杂性,坚持科学验证与创新并重,方能拓展人类对生命理解的边界。
致谢
感谢指导单位中关村科学城管理委员会的关心与支持。报告撰写过程中受到来自科研、产业、投资等领域专家学者的支持与帮助(排名不分先后):中国科学院院士陈润生、中国科学院动物研究所研究员李鑫、同济大学长聘特聘教授刘琦、西湖大学特聘研究员裴唯珂、耶鲁大学副研究科学家张迪、君联资本董事总经理周瑔、峰瑞资本副总裁谢达,以及英矽智能、百曜科技等机构,为 AIVC 的技术发展、产业应用及未来趋势提供了宝贵意见。特别感谢百曜科技对本研究报告的发起与项目支持。
免责声明:本报告所载数据和观点仅反映《麻省理工科技评论》中国截至发布之日的判断。报告对信息的准确性、完整性不作任何保证,不构成任何投资建议。不同时期可能会发布其他结论不一致的报告,读者应自行关注最新信息。

