合格的应收账款是保理业务开展的基础，应收账款回款也是保理融资的第一还款来源。一旦基础交易的买卖双方发生商业纠纷，应收账款便会存在瑕疵，甚至会影响保理融资款的回款。因此，及时处理商业纠纷对保理商而言是一个重要的内容，同时也是对保理商专业能力的考验。
一、商业纠纷的定义
商业纠纷的含义非常广泛。在保理业务中，简单地说，商业纠纷就是买方或卖方对基础合同的履约情况发生异议，从而影响应收账款。
常见的商业纠纷有：卖方没有完全履行基础贸易合同项下的要求，卖方交货逾期，买方对货物质量提出异议，买方恶意拖欠货款，合同条款在执行中存在争议，由于不可抗力引起的纠纷等。
引起商业纠纷的原因有很多种，常见的有：买卖双方中的一方不诚信、不履行合同，签订合同时内容不明确、在执行中产生争议，政策的变化导致卖方产能下降、影响交货，自然灾害等不可抗原因影响合同的执行等。
二、商业纠纷的处理
商业纠纷的种类与发生原因有很多种，对于保理商，最关心的是商业纠纷是否影响已转让的应收账款、以及保理融资款是否能及时归还。
1、对卖方的处理
通常情况下，保理商对买方情况的掌握程度远不及对卖方的掌控程度，所以在买卖方之间的商业纠纷发生时，保理商可以通过对卖方进行适当的限制以降低商业纠纷带来的风险。
①停止向卖方新增的融资
在商业纠纷处理完之前，保理商停止向卖方新增的融资，控制风险敞口不在增加。
但是在有些情况下，保理商停止新增融资，卖方会立即发生资金链断裂，危及保理商已经发放的保理融资款。这时，如果卖方能提供其他合格的、不涉及已发生商业纠纷的应收账款，保理商也应考虑新增融资。
②逐渐降低融资比例
从买方收到的付款将不再向卖方进行转付，暂时留存在监管账户上或直接归还保理融资款。
③要求卖方转让新的应收账款
要求卖方转让新的、合格的、与已发生商业纠纷无关的应收账款，从而降低融资比例。
④要求卖方归还融资款
如果商业纠纷无法妥善解决、并触及到保理合同中提前还款的条款，保理商可以要求卖方归还部分或者全部的融资款。但是在卖方资金链较为紧张的情况下提前回收，可能会造成卖方资金链断裂，危及保理融资款的安全。
2、督促买卖双方协商解决
在采取对卖方的限制之前，保理商可促进买卖双方和平协商商业纠纷，督促两方积极地解决商业纠纷中的相关问题。
同时，保理商也应对协商时间设立一个期限，例如90日、180日等。期限内买卖双方无协商结果，再采取其他的手段。
3、采用法律手段解决争议
法律手段可选择仲裁或是诉讼。如果选择仲裁解决纠纷，仲裁管辖事先事后均可约定，较为简单。如果选择诉讼，一般以基础合同中约定辖地的为主，除非在保理合同中另有约定、并获得买卖方同意的。
采用法律手段时，保理商也应考虑投入的成本与时间。通常来说，采用仲裁的方式效率要高得多，成本也更节省。具体采用方法应结合实际情况而定。
商业承兑汇票融资过程中存在的风险
一、商业汇票融资运用的条件分析 企业融资过程中考虑的因素很多，除了融资成本外，还要考虑融资风险的大小(基于商业信用的商业票据风险比较大)，融资规模的大小，融资机动性的优劣(商业汇票机动性较强)，融资的方便程度，甚至还要考虑融资顺序的先后，融资对企业控制权的影响，融资时机恰当与否，以及其他因素等。
一般而言，对于票据业务，企业有两种选择，在贴现率较低时，选择票据贴现，表现为银行的票据融资;而当利率走高，企业选择票据质押贷款，这将计入一般贷款口径。 2007年以来，我国票据融资大幅下滑，固然有央行紧缩金融机构信贷规模的原因，主要还是由于票据融资的成本过高从而导致交易量大减。
为什么2005和2006年初票据融资发展迅猛呢?究其原因，无非是由于当时票据利率不合理的结构形成票据融资成本过低，刺激了对汇票的需求大幅增长，银票贴现利率低于2.0%的情况都极为普遍。 个别金融机构的贴现利率甚至达到了1.8%的水平，低于当年半年期存款利率，这为融资性票据的滋生提供了“温床”。
可以看出，融资成本依旧是商业汇票融资时考虑的最重要因素，当贴现利率较低时，商业汇票得到广泛应用。其中影响成本的因素包括，市场贷款利率，贴现利率等。
二、商业汇票融资方式分析
(一）债权企业融资 为了解决临时的资金周转困难，获得足够的流动资金，票据债权企业可以将持有的应收票据向银行申请贴现，从而从银行取得一笔款项。 这种活动的实质相当于用应收票据这种权属凭证作为质押物向银行取得一笔质押借款，而且这种借款的一个好处就是其利率要比正常的短期借款略低。
另外，对于银行限定了贷款额度的企业，利用应收票据贴现这种途径不失为一个变相获得借款的好渠道，其实质相当于企业从银行获得更多贷款额度。
(二)债务企业融资
在具有良好的业务合作关系的企业之间，特别是在关联企业之间，目前比较流行的一种做法就是互相开具商业承兑汇票，让债权企业用商业承兑汇票先向银行贴现，然后再将从银行取得的贴现款转划给原票据债务企业，从而达到原票据债务企业从银行融资的目的。这种融资是通过原票据债权企业而间接进行的。
值得一提的是，因为此时开具商业承兑汇票的目的主要是向银行融资，故这种票据金额可能是真实的交易，也可能不是真实的交易。 对于票据到期后，可能是由原票据债务企业向银行偿还款项，也可能是由原票据债权企业向银行偿还，然后再向原票据债务企业收取款项。
但不管最终是由谁向银行偿还款项，原票据债务企业均已经达到了通过原票据债权企业向银行融资的目的。 而且，如果有必要的话，原票据债权企业可以让原票据债务企业就原票据金额重新再开具一张商业承兑汇票，从而循环上面的融资过程(当然，也可以以其他金额或新发生的交易金额来开具新的商业承兑汇票)。
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