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流式数据有问题?看看是不是死细胞惹的祸

流式数据有问题?看看是不是死细胞惹的祸 Youlai友莱生物
2026-09-10
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导读:做流式实验时,很多人习惯把注意力放在圈门策略和抗体选择上,却容易忽略一个基础但关键的步骤——排除死细胞。

 大家好我是小莱!✨

我们来喽!这里小莱会不定期与大家一同分享学习分子生物领域相关内容,死细胞虽然已经没了活性,但它们仍然存在于样本中,如果不加以排除,就会对流式结果产生不小的干扰。


Q1

死细胞是如何扰乱流式结果的?

死细胞之所以会影响流式数据,主要源于两个特点:一是膜破了,但抗原还在;二是膜通透性改变,各种染料都能自由进入。

细胞死亡后,细胞膜的完整性虽然丧失了,但表面的抗原并不会立刻消失。它们仍然能够结合抗体,这就带来了一个问题:我们测到的阳性信号,到底来自真正阳性的细胞,还是死细胞上残留的抗原?

比假阳性更麻烦的是第二个问题。膜破损后,死细胞内部暴露出来,各种荧光染料可以自由进入,非特异性地结合到细胞内各种分子上。这导致死细胞的荧光背景异常升高,而且没有特异性——它可能在所有通道里都发出信号,在散点图上常常表现为沿对角线分布的斜线信号。

这种非特异性结合会带来几个后果:假阳性率升高、细胞分群模糊、弱阳性群体被淹没在高背景里。一个很直观的例子是:外周血样本如果不排除死细胞,CD4和CD8的散点图上会出现一团异常的“双阳性”细胞群,而实际上正常情况下双阳性细胞表达极少。排除死细胞后,正常的互斥分布就恢复了,数据才真正可信。


Q2

如何排除死细胞?

排除死细胞主要有两种方式,一种是利用光散射特性,另一种是利用死活染料。

1. FSC/SSC光散射法

这是最简单快捷的方法。活细胞、死细胞和细胞碎片在光散射特性上有差异。前向角散射(FSC)大致反映细胞大小,侧向角散射(SSC)反映细胞内部颗粒度。死细胞通常会皱缩(FSC变小)、内部结构紊乱(SSC变大),因此在FSC/SSC图上,它们往往出现在活细胞群的左上方或左外侧。

这种方法操作简单,不需要额外染色,在圈门时就可以区分大部分死细胞。但它的局限在于,只能区分形态上明显异常的细胞。如果细胞刚死,形态变化还不明显,光靠FSC/SSC就不够用了。所以更多实验还需要用死活染料进一步确认。


2. 死活染料法

使用死活染料是更精确的方法,原理都基于细胞膜的完整性。常见的有两类:

核酸染料:比如PI、7-AAD、DAPI。这类染料不能透过活细胞膜,只能进入死细胞结合核酸发出荧光。优点是方便,染色后直接上机即可。但缺点也很明显——不能洗,也不能固定,因为固定需要对所有细胞破膜,活细胞也会被染上。

胺活性染料:这类染料能与蛋白质上的伯氨基共价结合。活细胞只染上表面蛋白,荧光较弱;死细胞因为膜破损,染料进入内部结合大量胞内蛋白,荧光信号很强。最大的优点是染色后可以固定、可以破膜,很适合用于胞内染色实验。


Q3

什么时候必须做死活染色?

这个问题可以从样本状态和实验需求两个角度来看。

从样本状态来看:如果是新鲜外周血、脾脏等处理得当的样本,死细胞比例较低,单靠FSC/SSC通常够用。但如果是肿瘤组织、难制备的组织、或者冻存复苏后的细胞,死细胞和碎片会很多,这时候必须用死活染料精确排除。

从实验需求来看:多色流式实验、弱表达抗原检测、胞内染色实验,都强烈建议做死活染色。道理很简单——颜色越多,背景越复杂;抗原越弱,越容易被死细胞的非特异性信号淹没。

反过来,如果只是常规检测新鲜外周血的CD3/CD4/CD8等强表达指标,FSC/SSC圈门基本够用。但前提是样本状态确实好,死细胞少,实验精度要求不高。


Q4

操作中的一些建议

排除死细胞不是一个“要不要做”的问题,而是一个“做到什么程度”的问题。根据样本质量和实验精度要求,选择合适的排除方法。

对于常规样本和简单实验,FSC/SSC排除就够用了。对于复杂样本、多色实验或需要精确分析的情况,建议加上死活染料。如果实验涉及胞内染色,直接选择胺活性染料。无论哪种方法,都建议在分析时同时圈出活细胞门,这样才能确保最终数据反映的是真实细胞群体的状态。

排除死细胞是流式实验中一个容易被低估但非常重要的步骤。它不会直接帮你回答“细胞表达了什么”,但它能确保你回答这个问题时,数据是干净、可靠的

根据样本状态和实验需求,选择合适的排除方法,让流式结果经得起推敲。

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