深圳供应链服务企业组织非常有特点，不是集团企业但是又有多个公司，有时公司间的关系又很难说清楚。起码都会建立2个平台进行操作，那就是深圳平台与香港平台。香港平台作为国际结算，国际商务，国际物流的操作中心，承接所有的香港当地业务及过港业务，当然还有很大大陆不方便的业务。因此客户看出，深圳供应链企业的一笔进口或者出口（过港）业务，是由至少四方完成了，而不是一般认为的三方。四方为：客户、供应商、深圳供应链企业深圳公司、深圳供应链香港公司。但是往往深圳供应链香港公司既不是深圳供应链深圳公司的子公司，也不是它的分公司，它们之间确实又存在某种关联。
以上这种模式，目前深圳绝大多数企业都采用，但是它并非是最先进的模式，随着业务的发展、深入，平台模式发生了巨大的变化：
当然每一个细分的行业，每一种运作模式选用什么的平台（窗口）都是非常考究的，因为它会涉及到整体资源配置、财务核算、税务因素、法律风险、风险因素、制约因素等，可能还会考虑到行业或者模式的未来发展空间等问题。
新型的供应链公司，在组织上很考究，架构都设计得很开阔，
一般供应链服务公司的组织架构大体如下：
特点有点高富帅的赶脚：通关最高等级AA资质，国税最高等级资质，外汇最高等级资质，高新技术企业，其特点是分工明细、特点鲜明。营运作为平台部门，财务负责核算、资金支持、投资理财；风控全面掌控公司经营，管理风险的识别、评估、预警、控制和处理；各事业部负责业务拓展.
深圳供应链的业务结构中还有一个难搞，难懂的，但是特别重要的——委托方，在某些情况下，委托方既不是进口业务的客户，也不是出口业务的供应商，既不收票也不开票，它还可能不是拉皮条的，但是它确实是一个委托方。系统怎么设计都费脑筋。
深圳供应链企业公司的各个部门很有特色（笑侃篇）：
美女最多的部：商务部；权利最大的部：风控部；永远都在上班的部：物流部；公司最赚钱的部：资金部；永远拖后腿的部：信息部；里里外外都挨屌的部：关务部；外面孙子家里爷的部：业务部；看似很忙但效果很差的部：人力资源部；规矩最多的部：财务部；小事做不完大事没有的部：行政部。
