由于股权转让价款一般较高，转让协议经常存在分期付款条款。关于分次取得股权转让收入的税款计算，现行税法对非居民企业转让股权规定了特殊的计算方式，即先覆盖成本后再计算转让所得。现结合案例进行解析。
案例：非居民企业股东分次取得股权转让收入
2019年1月，美国企业A公司与北京市B公司签订股权转让协议，将其持有的中国居民企业M公司100%股权转让。协议规定股权转让总价款3000万元，分三期收款，每期收款1000万元，收款时点分别为2019年1月、2020年1月、2021年1月。A公司持有M公司股权成本为1800万元。
分析
本案例有三种可能的税务处理方式：一是2019年1月一次性确认全部股权转让收入和股权成本，当月确认全部应纳税所得额1200万元（3000－1800）；二是根据分期纳税的原则，按照收款比例于三个收款时点分别确认400万元应纳税所得额；三是按照首先覆盖成本的原则，2019年1月暂不确认所得，2020年1月确认应纳税所得额200万元，2021年1月确认应纳税所得额1000万元。三种税务处理方式中第三种方式对企业最有利，可以产生延迟纳税的节税效应。37号公告规定，对非居民企业转让股权采取第三种方式进行税务处理。
本案例中，2019年1月收款1000万元不能覆盖成本，不确认股权转让所得；2020年1月累计收款2000万元，可以覆盖成本1800万元，余额200万元作为应纳税所得，按照10%的税率缴纳企业所得税；2021年1月累计收款3000万元，本期收到的1000万元全部作为应纳税所得，按照10%的税率缴纳企业所得税。
目前对于居民企业和个人转让股权分期收款尚无非常明确的税收政策，税收实践中也存在一些争议，居民企业股东应适用权责发生制，在办理股权变更手续时即应全部确认股权转让收入；个人股东由于存在扣缴义务，由扣缴义务人按照合同于每次支付股权转让款时基于配比原则分期扣缴个人所得税。