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期刊文章中常能看见各种统计检验可视化图:柱形图、盒形图、小提琴图等,图形简洁实用又好看,应用多不胜举:
当然OmicShare平台也有不少能输出柱形图、盒形图、小提琴图的工具,但这些工具大部分是静态版本,图形样式单一无法满足发文、汇报需求,不少同学反馈很需要支持在线修改参数的动态数据检验工具!
有需求就有响应,这次平台的升级优化就把大家呼声很高的工具、功能统统实现~
✔️ 推出动态两组检验箱线图工具,支持多种参数样式调整;
首先推出动态版的数据检验箱线图(盒形图),仍然仅需上传数据文件、选择统计检验方法即可提交任务;
注意数据文件无需行名,即不需要基因ID等物质名称列;文件中不要出现空值、# % / 等易导致出错的特殊符号。示例格式如下。
选择t检验或Wilcoxon秩和检验提交任务,下滑至工具下方结果展示区,待任务完成即可开始多种参数的在线调整。
支持标题字体字号修改、网格边框与刻度范围修改、图例调整、图形横纵方向调整等整体样式调节:
细节方面,盒形的整体配色与不透明度、数据散点的展示类型、盒形的描边模式都可修改:
统计检验的显著性标记也有三种类型可选:直接显示P值、按字母标记或星号标记,并且P值对应的星标数量也可修改,当然一般不建议修改,按默认的对应关系足矣。
调整满意后即可点击右上角的下载图标,选择需要的图片格式下载。
有这么多参数可修改,轻松调出花式箱线图,复刻多种文章同款样式也不在话下~
同样呼声很高的还有网络热图,接收到很多老师的建议“能不能优化一下,让节点可以拖动?生成的图形节点总是挤在一起,连线太难看清……” 听劝,这次我们也做了升级优化,网络图部分的节点位置可以灵活拖动啦~
先来快速调整一下其他参数,当然还不会使用这个工具的同学可以戳往期教程速学一下:
接下来开始节点位置调整,当光标由
变为
时就可以拖动节点位置:
节点位置信息暂无法保存,最好在其他参数调整好后,最后移动节点位置;
网络图部分的连线颜色为单色模式时,适合展示正/负相关,连线颜色为区间色模式时,更适合展示不同显著性范围颜色,以方便识别两组数据的关联强度。
经常使用在线工具的同学,账户中难免有大量的任务记录、结果数据,我们也收到不少反馈,总是单独下载、清理任务数据太麻烦了,这次优化顺便也将批量下载/删除功能加上,让同学们用起来更方便。
在项目总览界面,可以批量勾选项目后,一键下载或删除任务数据:
需要注意的是,批量下载时若数据量较大,下载速度较慢,页面会加载一段时间,不要关闭页面,待全部项目打包好即会下载到指定位置;部分动态工具下载到的只有原始数据、运行文件,结果图还是需要在调整页面下载。
下载后的结果文件夹,解压后可以看到是以项目编号命名,随机的项目编号通常带有“volcano”、“kegg_network”等可用于分辨任务的词组,也可以在提交任务时自定义项目编号,以便下载后更方便区分结果文件。
大家还有哪些希望升级更新的地方,也欢迎继续给我们提建议~
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OmicShare Tools最新方法学文章已发表iMeta:
发表期刊:iMeta
发表时间:202408
影响因子:23.7
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引用OmicShare Tools的参考文献为:
Mu, Hongyan, Jianzhou Chen, Wenjie Huang, Gui Huang, Meiying Deng, Shimiao Hong, Peng Ai, Chuan Gao, and Huangkai Zhou. 2024. “OmicShare tools: a Zero‐Code Interactive Online Platform for Biological Data Analysis and Visualization.” iMeta e228. https://doi.org/10.1002/imt2.228
*海量工具使用无门槛:161+工具覆盖99%生命科学期刊发表所需,无需任何编程基础,提交数据即可完成绘图;
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