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在期刊文章常用到的基础图形中,热图、柱形图、折线图、韦恩图全都榜上有名。虽然基础,也还是有不少样式与变形,比如韦恩图,轻松就能在高分文章中找到多种不同的类型:
本期就基于OmicShare平台的动态韦恩图工具绘制同款文献案例图,与大家共赏这些不同韦恩图样式。
使用到的示例文件为三组不同处理的基因集,选择“元素数据”类型提交任务。
随后跳转至动态调整界面,待任务完成即可开始对多种参数进行调整。
既有描边又有填充颜色的韦恩图样式,看起来最为普通,在高分文章中使用率却不低。
Microbiome. 2026(IF 14.9)fig.4
使用OmicShare动态韦恩图工具还可以在“描边模式-描边颜色”切换描边颜色,黑色、白色或跟随填充颜色的描边,都是不错的选择。
Cell Death Dis. 2025(IF 12.2)fig.2
韦恩图显示了从OPLS-DA分析(VIP > 1)、倍数变化分析(| logFC | > 2)和T检验(P < 0.05)获得的差异代谢物的交集
调整图形参数将描边粗细改为0(去掉描边),调低不透明度,就得到了同款:
有去掉描边的韦恩图,当然就有去掉填充色只有描边的韦恩图:
韦恩图显示各组间差异代谢物的交集,三次比较中只有一种代谢物是相同的。
将填充色的不透明度调为0,描边模式改为圈内一致,加粗描边粗细,清清爽爽的无填充色韦恩图就复现出来啦。
部分有黑白印刷要求的期刊杂志,投稿时就需要注意图片使用黑白色或使灰度值对比更明显,此时在无填充韦恩图的基础上将描边改为黑色即可。
韦恩图的圆圈大小全都一样无法比较集合大小,比例韦恩图就能很好解决这个问题:
Mol Cell. 2025(IF 16)fig.6
该韦恩图显示了在Dox诱导的shUHRF1 RKO细胞中,经过特定处理后H3K27me3标记的siQ-ChIP信号相比对照组增加了2倍。
若是在基础韦恩图中标注上数值百分比,也可以读取集合、交集的元素数量占比:
Phytomedicine. 2026(IF 11.3)fig.2
将29个候选靶标与从CTD、OMIM、GeneCards和PharmGkb收集的30085个肝损伤相关基因交叉(右图)。发现所有29种蛋白质都与肝损伤相关,并且能够与TP相互作用(左图)
在图形参数中打开数值、百分比的显示开关即可,数据读取更一目了然~
当我们需要在图中明确显示交集中包含哪些元素,也可以一一标注出来:
Cell Mol Biol Lett. 2025(IF 12.2)fig.5
用韦恩图综合分析RNA-seq和CoIP-MS的结果,CEMIP在两种测序的交集中排名第一。
选中交集部分后,点击下载子集元素,在Adobe illustrator或Photoshop等软件中编辑添加文本即可。
韦恩图除了单独出现,也常见一些组合图,如组合柱形图以读取原始集合数据、组合热图以读取交集基因表达情况、组合图片以丰富图形等。
图形参数中打开柱形图显示按钮,获得韦恩图+柱形组合图
通过EF3030基因表达的差异分析所识别出的各类生物途径的韦恩图。箭头旁的文字简要说明了韦恩图中每组路径所涉及的生物途径;每条箭头都指向该组路径中的某一代表性途径,通过Z-score热图展示该途径中EF3030基因的表达模式。
Industrial Crops and Products. 2026(IF 6.4)fig.3
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OmicShare Tools最新方法学文章已发表iMeta:
发表期刊:iMeta
发表时间:202408
影响因子:23.7
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引用OmicShare Tools的参考文献为:
Mu, Hongyan, Jianzhou Chen, Wenjie Huang, Gui Huang, Meiying Deng, Shimiao Hong, Peng Ai, Chuan Gao, and Huangkai Zhou. 2024. “OmicShare tools: a Zero‐Code Interactive Online Platform for Biological Data Analysis and Visualization.” iMeta e228. https://doi.org/10.1002/imt2.228
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