田间积水会排挤土壤孔隙内的空气，造成土壤缺氧。作物根系得不到生长所必需的氧气，呼吸受阻，被迫进行无氧呼吸，而无氧呼吸所产生的能量仅为有氧呼吸的1/20。
此外，缺氧环境下，好氧细菌活动减弱，厌氧细菌活动加强，产生大量有毒物质，包括甲烷、亚硝酸盐、硫化氢、乙醇及低分子有机酸等，这些有毒物质毒害作物根部，抑制种子发芽，阻碍根系正常发育。
1、危害作物根系
根系最先受到积水危害。根系长期处于缺氧状态，呼吸受抑制，活力衰退，吸收水分和养分的能力下降。轻则造成根系发根差，重则造成烂根、死苗。
由于根系吸收能力下降，地上部分出现“生理性干旱”——即田间有水，但根系无法吸收，植株反而表现为缺水萎蔫。
2、影响作物生长
田间积水胁迫持续时间越长，对作物株高、叶绿素含量、叶片光合作用和呼吸作用的影响越大。
如玉米受涝后植株生长缓慢、矮小、细弱，出叶速度慢，叶面积小，下部叶片枯黄，中部叶色变淡，有时出现红叶。积水淹没全株时会造成死苗。
3、降低作物产量和品质
田间积水对产量的影响最为显著，且与积水时长、生育期密切相关。如我国玉米生产最易遭受积水涝害胁迫，平均减产率达43.7%；小麦、棉花等农作物平均减产率在20%～35%。
4、易暴发病害
积水过后，田间湿度高，植株免疫力下降，极易造成病虫害集中暴发。
玉米：易发生根腐病、纹枯病、茎腐病等。
蔬菜：茄科、瓜类，疫病加重发生；苗期，猝倒病、立枯病、根腐病加重发生。
尽快采用水泵、挖沟等办法排除田间积水，坚持“雨停田干、水退田净”。最好在24-48小时内完成排水，排水越快，损失越小。
积水会导致土壤板结。待土壤稍干后，应及时进行划锄或中耕，破除板结层，改善土壤透气性，促进根系恢复活力。
雨后及时开展田间巡查，做到早发现、早防治。坚持“雨后必防、发病早治”原则。
涝灾后土壤养分流失严重，并且作物根系吸收能力弱，叶面追肥是首选：根系恢复前，通过叶面喷施是补充养分最有效的方式。
可喷施0.2%-0.3%的磷酸二氢钾溶液，配合“利根”等史丹利液体肥（推荐用量为每亩150-200毫升，可与多数常规杀虫杀菌剂混用，但不可与碱性农药、铜制剂混配，不建议与除草剂混配），增强植株抗逆性。
待植株恢复生长、新根长出后，再遵循“少量多次”的原则，追施速效氮肥和钾肥。切忌立即大量施用速效化肥，以免“烧根”。
