转录组学技术的发展,核心是不断提升对生物样本的解析精度。传统的bulkRNA测序只能获得组织的平均表达信息,掩盖了细胞异质性;
图 小鼠全脑细胞类型高分辨率空间图谱
(DOI: 10.1038/s41586-023-06812-z)
图 Stereo-seq时空转录组的技术优势
图 FFPE样本时空转录组的应用方向
图 Stereo-seq可以实现FFPE样本中宿主-微生物的高分辨率原位共分析
(DOI: 10.1016/j.cell.2025.08.008)
Stereo-seq凭借其卓越的空间解析能力,在多个领域展现出了不俗的应用效果,以下是几个最具代表性的应用方向:
图 人脑发育不同区域NPC亚群和RGs的分子差异的时空分布
(DOI: 10.1016/j.cell.2023.11.016)
时空图谱构建:
生物发育与疾病演化具有高度时空特异性。Stereo-seq可构建组织或器官的全转录组时空图谱,精确定位基因表达的空间异质性与时间变化规律。
图 人类母胎界面亚微米级空间转录组分析
(DOI: 10.1038/s41586-026-10316-x)
图 小鼠暴发性心肌炎进展过程中心脏的转录模式变化
(DOI:10.1038/s41392-025-02143-9)
图 病原菌靶向马铃薯细胞和周围细胞的时空调控响应
(DOI:10.1038/s41477-025-02181-9)
[1]Zhao Y, et al. Stereo-seq V2: Spatial mapping of total RNA on FFPE sections with high resolution. Cell. 2025 Nov 13;188(23):6554-6571.e21.
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