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H1810 肿瘤干细胞_09_空间干性地图预测局部复发风险 _选题方案设计报告

H1810 肿瘤干细胞_09_空间干性地图预测局部复发风险  _选题方案设计报告 生物医学AI圈子
2026-05-20
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导读:H1810 肿瘤干细胞|选题方案设计报告方向9:空间干性地图预测局部复发风险关键抓手:空间干性 / 局部复发
H1810 肿瘤干细胞|选题方案设计报告
方向9:空间干性地图预测局部复发风险
关键抓手:空间干性 / 局部复发 / 风险地图

项目适配
国自然面上 / 地区项目 / 省自然;适合有手术切缘、病理队列或复发随访资源的团队。
科学问题属性
需求牵引,突破瓶颈
执行原则
一个主假说、两条机制Aim、一个转化/验证Aim;公共数据均标注拟验证,不写未分析统计量。

仍需补充的信息
• 具体申请类别与经费尺度:国自然面上/青年/地区、省自然、博士课题或博士后基金。
• 拟聚焦癌种、疾病阶段和核心临床问题:原发、复发、转移、治疗抵抗、免疫治疗失败或局部复发。
• 申请人已有样本资源:FFPE/新鲜样本数量、是否有随访、是否有治疗前后/复发配对样本。
• 已有前期数据:差异分子、干性标志、单细胞/空间/蛋白组/代谢组结果、初步功能实验。
• 可用模型和平台:细胞系、类器官、动物模型、共培养、CRISPR、空间组学、多重IF、外泌体或力学平台。
• 不希望涉及的方向、预算上限、周期限制和伦理审批基础。
第一部分:输入信息适配性判断
判断项
专家判断
申请类别判断
国自然面上 / 地区项目 / 省自然;适合有手术切缘、病理队列或复发随访资源的团队。
研究基础强弱
当前仅有H1810方向池,未见具体癌种与前期实验,基础等级暂评为“中等偏弱/待补强”;若已有样本和模型,可迅速提升为面上项目可竞争基础。
技术路线成熟度
公共数据库发现 + 小样本验证 + 细胞/类器官扰动 + 救援实验是成熟路线;空间组学、动物模型和高通量筛选可作为增强模块。
主要短板
缺少具体癌种、真实数据图、候选靶标初筛结果、样本数量、统计方案和可落地预实验。
真实性处理
本报告不写未经实际分析的P值、HR、AUC、样本量或GSE结果;所有数据库结论均标注为“拟验证”。

第二部分:领域现状与关键科学问题
局部复发风险预测长期依赖病理分期、切缘状态和影像信息,但这些指标很难解释复发灶的细胞来源和空间生态位基础。空间组学、数字病理和多重免疫荧光的发展使“空间干性地图”成为可能:在同一组织切片或相邻切片上同时定位干性细胞、缺氧区、免疫排斥、CAF基质、血管生态位和侵袭前沿。当前共识是:肿瘤复发不是均质风险,而可能来源于特定空间微区中存活的CSC样细胞及其支持生态位。2024年肺癌空间免疫架构研究证明,髓系与T细胞的空间组织方式与免疫逃逸和临床结局相关,这为将空间位置引入风险预测提供了方法学依据。未解决问题是:哪些空间组合比单一标志物更能预测局部复发;是否存在“干性高—免疫低—基质硬—缺氧强”的复合高危微区;该空间图谱是否能指导切缘管理或辅助治疗分层。技术瓶颈在于样本量、空间数据成本和模型可解释性。可行路径是先用公开空间/单细胞数据定义候选空间signature,再在FFPE队列中用多重IF或空间转录组小样本验证,最后构建可解释的空间风险评分,而非盲目追求黑箱AI。
最匹配的科学问题属性为“需求牵引,突破瓶颈”。理由:该方向直接对应复发、耐药、免疫治疗失败或治疗筛选瓶颈,疾病相关性强,适合用机制研究支撑可转化标志物或干预策略。
建议凝练的科学问题候选池:① 候选靶标是否决定CSC状态转换而非仅相关;② 该机制发生在何种治疗/生态位/空间条件下;③ 该轴能否通过小样本和体外扰动验证;④ 能否形成复发、耐药、免疫逃逸或转化分层标志物;⑤ 若主假说不成立,是否仍能通过备选机制完成可发表故事。
第三部分:证据地图
证据来源
当前证据与使用方式
证据等级
是否需进一步验证
文献证据
近3–5年CSC综述、免疫逃逸、表观/代谢/空间或类器官研究支持该方向具有前沿性;具体到靶标仍需按癌种二次核验。
C
需要按目标癌种补充3–5篇更精准原始研究
公共数据库证据
拟用TCGA/GDC、GEO、CPTAC、HPA、DepMap、单细胞/空间数据构建signature并验证候选轴;本报告未写入未实际分析的FC、P值、HR或AUC。
B(拟验证)
必须由申请团队真实复现并保存代码/结果
申请人前期证据
当前未提供具体癌种、样本、前期分子或模型数据,因此暂按“待补充”处理。
A(缺失)
至少补充20–30例样本验证或1组细胞/类器官功能实验
推断性证据
根据“空间干性 / 局部复发 / 风险地图”与CSC核心表型的机制关系,推断若干可干预靶标和通路轴。
D
需通过表达、空间定位、扰动和救援实验升级证据等级
转化证据
若能形成IHC/mIF评分、空间风险图或PDO药敏终点,可进入省自然/面上项目的转化Aim。
C/D
需明确队列来源、随访终点和伦理基础

第四部分:四步推演过程详情
4.1 候选靶标池(8–12个)
靶标名称
分子类型
可能来源细胞/组织
关联阶段
初步证据
文献饱和度
可干预性
匹配度
进入下一步
CA9/HIF1A
缺氧标志/转录因子
缺氧CSC微区
低氧诱导空间干性
C:缺氧文献支持
IHC/mIF可行
ALDH1A1
干性/代谢酶
高干性细胞
局部复发种子
C:标志物成熟
IHC/流式可行
备选
SPP1
分泌蛋白
SPP1+髓系/CAF
免疫抑制空间邻近
C:空间免疫支持
mIF/阻断
CD44
干性/黏附分子
CSC
基质黏附和复发
高饱和
IHC/流式
备选
FN1/ITGB1
基质-受体
CAF/CSC接触区
硬化/侵袭前沿
C:机械信号支持
mIF/水凝胶
CXCL12/CXCR4
趋化因子轴
血管/CAF生态位
残留细胞招募
C:文献充分
抗体/小分子
备选
PD-L1/HLA-I low
免疫状态
免疫冷区CSC
免疫逃逸空间岛
C:免疫逃逸支持
mIF可行
VEGFA/KDR
血管轴
内皮生态位
血管周围干性
C:较传统
IHC/抑制剂
备选
POSTN
ECM蛋白
侵袭前沿基质
复发性生态位
C/D:空间待证
IHC/敲低
TREM2/APOE
髓系状态
抑制性髓系细胞
免疫排斥微区
C/D:癌种依赖
mIF/scRNA
备选

4.2 五条可审计推演链
推演编号
靶标挖掘
通路构建
表型关联
项目合成
推演1
CA9/HIF1A:从候选靶标池进入机制验证;证据多为C/D,需公共数据和小样本升级。
局部缺氧 → HIF1A/CA9 → ALDH1A1/SOX2
缺氧空间微区中的复发种子
缺氧空间干性微区驱动目标实体瘤局部复发风险的机制与预测研究
推演2
SPP1:从候选靶标池进入机制验证;证据多为C/D,需公共数据和小样本升级。
SPP1+髓系细胞 → CD44/ITGAV → AKT/YAP
免疫抑制干性岛形成
SPP1+髓系细胞邻近驱动目标实体瘤空间干性岛形成及局部复发的机制研究
推演3
FN1/ITGB1:从候选靶标池进入机制验证;证据多为C/D,需公共数据和小样本升级。
CAF-FN1 → CSC-ITGB1/FAK → YAP/TAZ
硬化侵袭前沿复发风险
FN1-ITGB1空间机械轴预测目标实体瘤侵袭前沿CSC富集和局部复发的机制研究
推演4
PD-L1/HLA-I low:从候选靶标池进入机制验证;证据多为C/D,需公共数据和小样本升级。
抗原呈递低下 → T细胞排斥 → CSC残留
免疫冷干性微区与复发
免疫冷空间干性微区介导目标实体瘤局部复发风险的机制与标志物研究
推演5
POSTN:从候选靶标池进入机制验证;证据多为C/D,需公共数据和小样本升级。
POSTN基质富集 → αvβ3/FAK → 干性克隆黏附
切缘附近CSC保留
POSTN富集切缘生态位促进目标实体瘤空间干性保留和局部复发的机制研究

第五部分:项目选题建议(5个)
选题1
1. 项目题目:缺氧空间干性微区驱动目标实体瘤局部复发风险的机制与预测研究
2. 适配项目类型:国自然面上 / 地区项目 / 省自然;适合有手术切缘、病理队列或复发随访资源的团队。
3. 科学问题属性:需求牵引,突破瓶颈。该方向直接对应复发、耐药、免疫治疗失败或治疗筛选瓶颈,疾病相关性强,适合用机制研究支撑可转化标志物或干预策略。
4. 核心科学问题:在目标实体瘤背景下,CA9/HIF1A是否通过“局部缺氧 → HIF1A/CA9 → ALDH1A1/SOX2”成为驱动“缺氧空间微区中的复发种子”的因果节点?
5. 核心科学假说:治疗压力、生态位刺激或空间微环境改变可诱导CA9/HIF1A异常激活/抑制,并通过“局部缺氧 → HIF1A/CA9 → ALDH1A1/SOX2”重塑CSC功能状态,最终导致缺氧空间微区中的复发种子;阻断或救援该轴将相应降低或恢复CSC相关功能表型。
6. 立项依据/研究背景:围绕“空间干性地图预测局部复发风险”方向,当前领域已经认识到肿瘤干细胞并非固定不变的少数细胞,而是在治疗压力、生态位信号、代谢应激和免疫选择中不断转换的功能状态。已有高质量综述和近期研究提示,CSC与复发、转移、治疗抵抗和免疫逃逸密切相关,但多数研究仍停留在标志物相关或泛通路描述层面,缺少能被扰动、能被救援、能回到临床样本验证的因果机制。本选题以“CA9/HIF1A”为核心切入点,将其嵌入“局部缺氧 → HIF1A/CA9 → ALDH1A1/SOX2”机制轴,聚焦“缺氧空间微区中的复发种子”这一可量化表型,避免把多组学分析作为终点。拟先在公开数据库和单细胞/空间数据中建立候选signature,验证CA9/HIF1A与干性评分、生态位细胞邻近、治疗反应或复发结局的关系;再在申请人后续补充的目标癌种样本中通过qPCR/WB/IHC/多重IF确认表达与空间定位;最后利用细胞系、类器官或共培养模型进行敲低、过表达、药物干预和救援实验。该设计的科学价值在于把“空间干性 / 局部复发 / 风险地图”下降到一条可被验证的靶标—通路—表型链条,同时保留向标志物、药物组合或风险分层转化的接口。由于目前尚未提供申请人具体前期数据,所有数据库相关结论均按“拟验证”处理,正式标书中需补充真实图表和统计结果。
7. 研究目标:
• 总目标:阐明CA9/HIF1A及其相关机制轴在目标实体瘤CSC关键表型中的因果作用。
• 分目标1:验证CA9/HIF1A在目标癌种临床样本、公开队列和CSC富集模型中的表达变化、空间定位和临床相关性。
• 分目标2:解析“局部缺氧 → HIF1A/CA9 → ALDH1A1/SOX2”的上下游调控关系,明确关键中间分子、转录/代谢/免疫读出和救援节点。
• 分目标3:评估该机制轴对“缺氧空间微区中的复发种子”以及球形成、类器官再生、免疫杀伤、迁移侵袭或体内成瘤/复发表型的功能意义。
8. 研究内容:
• 内容1:公共数据库与临床样本验证。基于TCGA/GDC、GEO、HPA、DepMap及可获得单细胞/空间数据构建CA9/HIF1A相关signature;在申请人目标癌种样本中用qPCR、WB、IHC或多重IF验证表达、定位与预后/复发/治疗反应关系。
• 内容2:机制因果验证。围绕“局部缺氧 → HIF1A/CA9 → ALDH1A1/SOX2”开展敲低、过表达、药物阻断、配体刺激、抑制剂处理和关键分子救援,明确靶标在通路激活中的必要性和充分性。
• 内容3:功能与疾病意义验证。通过球形成、类器官形成、极限稀释、细胞迁移侵袭、免疫共培养杀伤或动物移植模型,评估该轴对缺氧空间微区中的复发种子的影响,并设计替代验证终点。
9. 关键技术路线:
• 组学发现:bulk转录组/蛋白组+单细胞/空间数据整合,先输出候选图谱,不写未经分析的统计量。
• 临床验证:目标癌种FFPE/新鲜样本,检测CA9/HIF1A、干性标志和通路读出;多重IF验证细胞来源与空间邻近。
• 体外验证:CSC富集球培养、药物压力残留模型、3D类器官或肿瘤-基质/免疫共培养。
• 因果干预:siRNA/shRNA/CRISPRi/过表达/药物阻断;围绕“局部缺氧 → HIF1A/CA9 → ALDH1A1/SOX2”设置救援实验。
• 体内验证:条件允许时开展皮下/原位移植、限制性稀释成瘤或治疗后复发模型;经费不足时以类器官和小样本验证替代。
10. 特色与创新之处:
• 新靶标维度:把CA9/HIF1A从相关分子推进为可扰动的CSC功能节点。
• 新机制维度:将“局部缺氧 → HIF1A/CA9 → ALDH1A1/SOX2”作为主线,避免泛泛讨论空间干性 / 局部复发 / 风险地图。
• 新表型维度:把缺氧空间微区中的复发种子作为核心终点,配合干性功能实验而非单纯表达验证。
• 新模型维度:采用公开多组学发现、小样本空间验证、细胞/类器官扰动和救援的最小闭环。
• 延续与突破:可嵌入申请人已有癌种、样本、模型和平台;未提供基础时,建议先做2–3项预实验。
11. 可行性分析:
• 已有基础:本报告尚未获得申请人真实前期数据,因此按“基础待补充”处理;若已有样本或模型,可优先纳入立项依据。
• 样本/模型:建议至少建立20–30例FFPE验证队列、2个细胞系/类器官模型和1套共培养或治疗压力模型。
• 技术平台:qPCR/WB/IHC/多重IF、流式分选、球形成、类器官培养和CA9/HIF1A扰动均具备常规可执行性;高级组学可根据经费缩放。
• 周期可控:第一年完成数据挖掘和样本验证,第二年完成机制扰动,第三年完成功能验证和风险替代实验。
12. 风险点与替代方案:
• CA9/HIF1A表达差异不稳定:改用蛋白定位、通路活性评分或组合signature,避免仅依赖单基因。
• 机制轴验证不成立:保留上游刺激和下游表型,平行检测替代通路;以救援实验决定主轴是否需要调整。
• 动物模型表型不显著:用类器官、极限稀释成球、免疫共培养杀伤或空间样本验证作为替代终点。
• 临床相关性不足:扩大到外部队列或调整结局为复发、治疗反应、局部侵袭、免疫排斥等更贴近机制的终点。
• 技术条件受限:先完成最小闭环,暂缓高成本空间/单细胞实验,以多重IF和公开数据替代。
13. 关键参考文献:
[1] Enfield KSS, Colliver E, Lee C, et al. Spatial Architecture of Myeloid and T Cells Orchestrates Immune Evasion and Clinical Outcome in Lung Cancer. Cancer Discov. 2024;14(6):1018-1047. DOI: 10.1158/2159-8290.CD-23-1380. PMID: 38581685.
[2] National Cancer Institute. Human Tumor Atlas Network (HTAN): constructing three-dimensional atlases of cellular, morphological, molecular and spatial features of human cancers and microenvironments over time. Official NCI resource, updated 2025. URL: humantumoratlas.org / cancer.gov.
[3] Loh JJ, Ma S. Hallmarks of cancer stemness. Cell Stem Cell. 2024;31(5):617-639. DOI: 10.1016/j.stem.2024.04.004. PMID: 38701757.
[4] Chu X, Tian W, Ning J, et al. Cancer stem cells: advances in knowledge and implications for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2024;9(1):170. DOI: 10.1038/s41392-024-01851-y. PMID: 38965243.
[5] Agudo J, Miao Y. Stemness in solid malignancies: coping with immune attack. Nat Rev Cancer. 2025;25(1):27-40. DOI: 10.1038/s41568-024-00760-0. PMID: 39455862.
[6] Saw PE, Xu X, Chen J, Song EW. Cancer stem cell mimicry for immune evasion and therapeutic resistance. Cell Stem Cell. 2024;31(8):1101-1112. DOI: 10.1016/j.stem.2024.06.003. PMID: 38925125.
[7] National Cancer Institute. Genomic Data Commons Data Portal and Repository: TCGA, HCMI and other cancer datasets for molecular and clinical research. Official NCI/GDC resource.

选题2
1. 项目题目:SPP1+髓系细胞邻近驱动目标实体瘤空间干性岛形成及局部复发的机制研究
2. 适配项目类型:国自然面上 / 地区项目 / 省自然;适合有手术切缘、病理队列或复发随访资源的团队。
3. 科学问题属性:需求牵引,突破瓶颈。该方向直接对应复发、耐药、免疫治疗失败或治疗筛选瓶颈,疾病相关性强,适合用机制研究支撑可转化标志物或干预策略。
4. 核心科学问题:在目标实体瘤背景下,SPP1是否通过“SPP1+髓系细胞 → CD44/ITGAV → AKT/YAP”成为驱动“免疫抑制干性岛形成”的因果节点?
5. 核心科学假说:治疗压力、生态位刺激或空间微环境改变可诱导SPP1异常激活/抑制,并通过“SPP1+髓系细胞 → CD44/ITGAV → AKT/YAP”重塑CSC功能状态,最终导致免疫抑制干性岛形成;阻断或救援该轴将相应降低或恢复CSC相关功能表型。
6. 立项依据/研究背景:围绕“空间干性地图预测局部复发风险”方向,当前领域已经认识到肿瘤干细胞并非固定不变的少数细胞,而是在治疗压力、生态位信号、代谢应激和免疫选择中不断转换的功能状态。已有高质量综述和近期研究提示,CSC与复发、转移、治疗抵抗和免疫逃逸密切相关,但多数研究仍停留在标志物相关或泛通路描述层面,缺少能被扰动、能被救援、能回到临床样本验证的因果机制。本选题以“SPP1”为核心切入点,将其嵌入“SPP1+髓系细胞 → CD44/ITGAV → AKT/YAP”机制轴,聚焦“免疫抑制干性岛形成”这一可量化表型,避免把多组学分析作为终点。拟先在公开数据库和单细胞/空间数据中建立候选signature,验证SPP1与干性评分、生态位细胞邻近、治疗反应或复发结局的关系;再在申请人后续补充的目标癌种样本中通过qPCR/WB/IHC/多重IF确认表达与空间定位;最后利用细胞系、类器官或共培养模型进行敲低、过表达、药物干预和救援实验。该设计的科学价值在于把“空间干性 / 局部复发 / 风险地图”下降到一条可被验证的靶标—通路—表型链条,同时保留向标志物、药物组合或风险分层转化的接口。由于目前尚未提供申请人具体前期数据,所有数据库相关结论均按“拟验证”处理,正式标书中需补充真实图表和统计结果。
7. 研究目标:
• 总目标:阐明SPP1及其相关机制轴在目标实体瘤CSC关键表型中的因果作用。
• 分目标1:验证SPP1在目标癌种临床样本、公开队列和CSC富集模型中的表达变化、空间定位和临床相关性。
• 分目标2:解析“SPP1+髓系细胞 → CD44/ITGAV → AKT/YAP”的上下游调控关系,明确关键中间分子、转录/代谢/免疫读出和救援节点。
• 分目标3:评估该机制轴对“免疫抑制干性岛形成”以及球形成、类器官再生、免疫杀伤、迁移侵袭或体内成瘤/复发表型的功能意义。
8. 研究内容:
• 内容1:公共数据库与临床样本验证。基于TCGA/GDC、GEO、HPA、DepMap及可获得单细胞/空间数据构建SPP1相关signature;在申请人目标癌种样本中用qPCR、WB、IHC或多重IF验证表达、定位与预后/复发/治疗反应关系。
• 内容2:机制因果验证。围绕“SPP1+髓系细胞 → CD44/ITGAV → AKT/YAP”开展敲低、过表达、药物阻断、配体刺激、抑制剂处理和关键分子救援,明确靶标在通路激活中的必要性和充分性。
• 内容3:功能与疾病意义验证。通过球形成、类器官形成、极限稀释、细胞迁移侵袭、免疫共培养杀伤或动物移植模型,评估该轴对免疫抑制干性岛形成的影响,并设计替代验证终点。
9. 关键技术路线:
• 组学发现:bulk转录组/蛋白组+单细胞/空间数据整合,先输出候选图谱,不写未经分析的统计量。
• 临床验证:目标癌种FFPE/新鲜样本,检测SPP1、干性标志和通路读出;多重IF验证细胞来源与空间邻近。
• 体外验证:CSC富集球培养、药物压力残留模型、3D类器官或肿瘤-基质/免疫共培养。
• 因果干预:siRNA/shRNA/CRISPRi/过表达/药物阻断;围绕“SPP1+髓系细胞 → CD44/ITGAV → AKT/YAP”设置救援实验。
• 体内验证:条件允许时开展皮下/原位移植、限制性稀释成瘤或治疗后复发模型;经费不足时以类器官和小样本验证替代。
10. 特色与创新之处:
• 新靶标维度:把SPP1从相关分子推进为可扰动的CSC功能节点。
• 新机制维度:将“SPP1+髓系细胞 → CD44/ITGAV → AKT/YAP”作为主线,避免泛泛讨论空间干性 / 局部复发 / 风险地图。
• 新表型维度:把免疫抑制干性岛形成作为核心终点,配合干性功能实验而非单纯表达验证。
• 新模型维度:采用公开多组学发现、小样本空间验证、细胞/类器官扰动和救援的最小闭环。
• 延续与突破:可嵌入申请人已有癌种、样本、模型和平台;未提供基础时,建议先做2–3项预实验。
11. 可行性分析:
• 已有基础:本报告尚未获得申请人真实前期数据,因此按“基础待补充”处理;若已有样本或模型,可优先纳入立项依据。
• 样本/模型:建议至少建立20–30例FFPE验证队列、2个细胞系/类器官模型和1套共培养或治疗压力模型。
• 技术平台:qPCR/WB/IHC/多重IF、流式分选、球形成、类器官培养和SPP1扰动均具备常规可执行性;高级组学可根据经费缩放。
• 周期可控:第一年完成数据挖掘和样本验证,第二年完成机制扰动,第三年完成功能验证和风险替代实验。
12. 风险点与替代方案:
• SPP1表达差异不稳定:改用蛋白定位、通路活性评分或组合signature,避免仅依赖单基因。
• 机制轴验证不成立:保留上游刺激和下游表型,平行检测替代通路;以救援实验决定主轴是否需要调整。
• 动物模型表型不显著:用类器官、极限稀释成球、免疫共培养杀伤或空间样本验证作为替代终点。
• 临床相关性不足:扩大到外部队列或调整结局为复发、治疗反应、局部侵袭、免疫排斥等更贴近机制的终点。
• 技术条件受限:先完成最小闭环,暂缓高成本空间/单细胞实验,以多重IF和公开数据替代。
13. 关键参考文献:
[1] Enfield KSS, Colliver E, Lee C, et al. Spatial Architecture of Myeloid and T Cells Orchestrates Immune Evasion and Clinical Outcome in Lung Cancer. Cancer Discov. 2024;14(6):1018-1047. DOI: 10.1158/2159-8290.CD-23-1380. PMID: 38581685.
[2] National Cancer Institute. Human Tumor Atlas Network (HTAN): constructing three-dimensional atlases of cellular, morphological, molecular and spatial features of human cancers and microenvironments over time. Official NCI resource, updated 2025. URL: humantumoratlas.org / cancer.gov.
[3] Loh JJ, Ma S. Hallmarks of cancer stemness. Cell Stem Cell. 2024;31(5):617-639. DOI: 10.1016/j.stem.2024.04.004. PMID: 38701757.
[4] Chu X, Tian W, Ning J, et al. Cancer stem cells: advances in knowledge and implications for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2024;9(1):170. DOI: 10.1038/s41392-024-01851-y. PMID: 38965243.
[5] Agudo J, Miao Y. Stemness in solid malignancies: coping with immune attack. Nat Rev Cancer. 2025;25(1):27-40. DOI: 10.1038/s41568-024-00760-0. PMID: 39455862.
[6] Saw PE, Xu X, Chen J, Song EW. Cancer stem cell mimicry for immune evasion and therapeutic resistance. Cell Stem Cell. 2024;31(8):1101-1112. DOI: 10.1016/j.stem.2024.06.003. PMID: 38925125.
[7] National Cancer Institute. Genomic Data Commons Data Portal and Repository: TCGA, HCMI and other cancer datasets for molecular and clinical research. Official NCI/GDC resource.

选题3
1. 项目题目:FN1-ITGB1空间机械轴预测目标实体瘤侵袭前沿CSC富集和局部复发的机制研究
2. 适配项目类型:国自然面上 / 地区项目 / 省自然;适合有手术切缘、病理队列或复发随访资源的团队。
3. 科学问题属性:需求牵引,突破瓶颈。该方向直接对应复发、耐药、免疫治疗失败或治疗筛选瓶颈,疾病相关性强,适合用机制研究支撑可转化标志物或干预策略。
4. 核心科学问题:在目标实体瘤背景下,FN1/ITGB1是否通过“CAF-FN1 → CSC-ITGB1/FAK → YAP/TAZ”成为驱动“硬化侵袭前沿复发风险”的因果节点?
5. 核心科学假说:治疗压力、生态位刺激或空间微环境改变可诱导FN1/ITGB1异常激活/抑制,并通过“CAF-FN1 → CSC-ITGB1/FAK → YAP/TAZ”重塑CSC功能状态,最终导致硬化侵袭前沿复发风险;阻断或救援该轴将相应降低或恢复CSC相关功能表型。
6. 立项依据/研究背景:围绕“空间干性地图预测局部复发风险”方向,当前领域已经认识到肿瘤干细胞并非固定不变的少数细胞,而是在治疗压力、生态位信号、代谢应激和免疫选择中不断转换的功能状态。已有高质量综述和近期研究提示,CSC与复发、转移、治疗抵抗和免疫逃逸密切相关,但多数研究仍停留在标志物相关或泛通路描述层面,缺少能被扰动、能被救援、能回到临床样本验证的因果机制。本选题以“FN1/ITGB1”为核心切入点,将其嵌入“CAF-FN1 → CSC-ITGB1/FAK → YAP/TAZ”机制轴,聚焦“硬化侵袭前沿复发风险”这一可量化表型,避免把多组学分析作为终点。拟先在公开数据库和单细胞/空间数据中建立候选signature,验证FN1/ITGB1与干性评分、生态位细胞邻近、治疗反应或复发结局的关系;再在申请人后续补充的目标癌种样本中通过qPCR/WB/IHC/多重IF确认表达与空间定位;最后利用细胞系、类器官或共培养模型进行敲低、过表达、药物干预和救援实验。该设计的科学价值在于把“空间干性 / 局部复发 / 风险地图”下降到一条可被验证的靶标—通路—表型链条,同时保留向标志物、药物组合或风险分层转化的接口。由于目前尚未提供申请人具体前期数据,所有数据库相关结论均按“拟验证”处理,正式标书中需补充真实图表和统计结果。
7. 研究目标:
• 总目标:阐明FN1/ITGB1及其相关机制轴在目标实体瘤CSC关键表型中的因果作用。
• 分目标1:验证FN1/ITGB1在目标癌种临床样本、公开队列和CSC富集模型中的表达变化、空间定位和临床相关性。
• 分目标2:解析“CAF-FN1 → CSC-ITGB1/FAK → YAP/TAZ”的上下游调控关系,明确关键中间分子、转录/代谢/免疫读出和救援节点。
• 分目标3:评估该机制轴对“硬化侵袭前沿复发风险”以及球形成、类器官再生、免疫杀伤、迁移侵袭或体内成瘤/复发表型的功能意义。
8. 研究内容:
• 内容1:公共数据库与临床样本验证。基于TCGA/GDC、GEO、HPA、DepMap及可获得单细胞/空间数据构建FN1/ITGB1相关signature;在申请人目标癌种样本中用qPCR、WB、IHC或多重IF验证表达、定位与预后/复发/治疗反应关系。
• 内容2:机制因果验证。围绕“CAF-FN1 → CSC-ITGB1/FAK → YAP/TAZ”开展敲低、过表达、药物阻断、配体刺激、抑制剂处理和关键分子救援,明确靶标在通路激活中的必要性和充分性。
• 内容3:功能与疾病意义验证。通过球形成、类器官形成、极限稀释、细胞迁移侵袭、免疫共培养杀伤或动物移植模型,评估该轴对硬化侵袭前沿复发风险的影响,并设计替代验证终点。
9. 关键技术路线:
• 组学发现:bulk转录组/蛋白组+单细胞/空间数据整合,先输出候选图谱,不写未经分析的统计量。
• 临床验证:目标癌种FFPE/新鲜样本,检测FN1/ITGB1、干性标志和通路读出;多重IF验证细胞来源与空间邻近。
• 体外验证:CSC富集球培养、药物压力残留模型、3D类器官或肿瘤-基质/免疫共培养。
• 因果干预:siRNA/shRNA/CRISPRi/过表达/药物阻断;围绕“CAF-FN1 → CSC-ITGB1/FAK → YAP/TAZ”设置救援实验。
• 体内验证:条件允许时开展皮下/原位移植、限制性稀释成瘤或治疗后复发模型;经费不足时以类器官和小样本验证替代。
10. 特色与创新之处:
• 新靶标维度:把FN1/ITGB1从相关分子推进为可扰动的CSC功能节点。
• 新机制维度:将“CAF-FN1 → CSC-ITGB1/FAK → YAP/TAZ”作为主线,避免泛泛讨论空间干性 / 局部复发 / 风险地图。
• 新表型维度:把硬化侵袭前沿复发风险作为核心终点,配合干性功能实验而非单纯表达验证。
• 新模型维度:采用公开多组学发现、小样本空间验证、细胞/类器官扰动和救援的最小闭环。
• 延续与突破:可嵌入申请人已有癌种、样本、模型和平台;未提供基础时,建议先做2–3项预实验。
11. 可行性分析:
• 已有基础:本报告尚未获得申请人真实前期数据,因此按“基础待补充”处理;若已有样本或模型,可优先纳入立项依据。
• 样本/模型:建议至少建立20–30例FFPE验证队列、2个细胞系/类器官模型和1套共培养或治疗压力模型。
• 技术平台:qPCR/WB/IHC/多重IF、流式分选、球形成、类器官培养和FN1/ITGB1扰动均具备常规可执行性;高级组学可根据经费缩放。
• 周期可控:第一年完成数据挖掘和样本验证,第二年完成机制扰动,第三年完成功能验证和风险替代实验。
12. 风险点与替代方案:
• FN1/ITGB1表达差异不稳定:改用蛋白定位、通路活性评分或组合signature,避免仅依赖单基因。
• 机制轴验证不成立:保留上游刺激和下游表型,平行检测替代通路;以救援实验决定主轴是否需要调整。
• 动物模型表型不显著:用类器官、极限稀释成球、免疫共培养杀伤或空间样本验证作为替代终点。
• 临床相关性不足:扩大到外部队列或调整结局为复发、治疗反应、局部侵袭、免疫排斥等更贴近机制的终点。
• 技术条件受限:先完成最小闭环,暂缓高成本空间/单细胞实验,以多重IF和公开数据替代。
13. 关键参考文献:
[1] Enfield KSS, Colliver E, Lee C, et al. Spatial Architecture of Myeloid and T Cells Orchestrates Immune Evasion and Clinical Outcome in Lung Cancer. Cancer Discov. 2024;14(6):1018-1047. DOI: 10.1158/2159-8290.CD-23-1380. PMID: 38581685.
[2] National Cancer Institute. Human Tumor Atlas Network (HTAN): constructing three-dimensional atlases of cellular, morphological, molecular and spatial features of human cancers and microenvironments over time. Official NCI resource, updated 2025. URL: humantumoratlas.org / cancer.gov.
[3] Loh JJ, Ma S. Hallmarks of cancer stemness. Cell Stem Cell. 2024;31(5):617-639. DOI: 10.1016/j.stem.2024.04.004. PMID: 38701757.
[4] Chu X, Tian W, Ning J, et al. Cancer stem cells: advances in knowledge and implications for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2024;9(1):170. DOI: 10.1038/s41392-024-01851-y. PMID: 38965243.
[5] Agudo J, Miao Y. Stemness in solid malignancies: coping with immune attack. Nat Rev Cancer. 2025;25(1):27-40. DOI: 10.1038/s41568-024-00760-0. PMID: 39455862.
[6] Saw PE, Xu X, Chen J, Song EW. Cancer stem cell mimicry for immune evasion and therapeutic resistance. Cell Stem Cell. 2024;31(8):1101-1112. DOI: 10.1016/j.stem.2024.06.003. PMID: 38925125.
[7] National Cancer Institute. Genomic Data Commons Data Portal and Repository: TCGA, HCMI and other cancer datasets for molecular and clinical research. Official NCI/GDC resource.

选题4
1. 项目题目:免疫冷空间干性微区介导目标实体瘤局部复发风险的机制与标志物研究
2. 适配项目类型:国自然面上 / 地区项目 / 省自然;适合有手术切缘、病理队列或复发随访资源的团队。
3. 科学问题属性:需求牵引,突破瓶颈。该方向直接对应复发、耐药、免疫治疗失败或治疗筛选瓶颈,疾病相关性强,适合用机制研究支撑可转化标志物或干预策略。
4. 核心科学问题:在目标实体瘤背景下,PD-L1/HLA-I low是否通过“抗原呈递低下 → T细胞排斥 → CSC残留”成为驱动“免疫冷干性微区与复发”的因果节点?
5. 核心科学假说:治疗压力、生态位刺激或空间微环境改变可诱导PD-L1/HLA-I low异常激活/抑制,并通过“抗原呈递低下 → T细胞排斥 → CSC残留”重塑CSC功能状态,最终导致免疫冷干性微区与复发;阻断或救援该轴将相应降低或恢复CSC相关功能表型。
6. 立项依据/研究背景:围绕“空间干性地图预测局部复发风险”方向,当前领域已经认识到肿瘤干细胞并非固定不变的少数细胞,而是在治疗压力、生态位信号、代谢应激和免疫选择中不断转换的功能状态。已有高质量综述和近期研究提示,CSC与复发、转移、治疗抵抗和免疫逃逸密切相关,但多数研究仍停留在标志物相关或泛通路描述层面,缺少能被扰动、能被救援、能回到临床样本验证的因果机制。本选题以“PD-L1/HLA-I low”为核心切入点,将其嵌入“抗原呈递低下 → T细胞排斥 → CSC残留”机制轴,聚焦“免疫冷干性微区与复发”这一可量化表型,避免把多组学分析作为终点。拟先在公开数据库和单细胞/空间数据中建立候选signature,验证PD-L1/HLA-I low与干性评分、生态位细胞邻近、治疗反应或复发结局的关系;再在申请人后续补充的目标癌种样本中通过qPCR/WB/IHC/多重IF确认表达与空间定位;最后利用细胞系、类器官或共培养模型进行敲低、过表达、药物干预和救援实验。该设计的科学价值在于把“空间干性 / 局部复发 / 风险地图”下降到一条可被验证的靶标—通路—表型链条,同时保留向标志物、药物组合或风险分层转化的接口。由于目前尚未提供申请人具体前期数据,所有数据库相关结论均按“拟验证”处理,正式标书中需补充真实图表和统计结果。
7. 研究目标:
• 总目标:阐明PD-L1/HLA-I low及其相关机制轴在目标实体瘤CSC关键表型中的因果作用。
• 分目标1:验证PD-L1/HLA-I low在目标癌种临床样本、公开队列和CSC富集模型中的表达变化、空间定位和临床相关性。
• 分目标2:解析“抗原呈递低下 → T细胞排斥 → CSC残留”的上下游调控关系,明确关键中间分子、转录/代谢/免疫读出和救援节点。
• 分目标3:评估该机制轴对“免疫冷干性微区与复发”以及球形成、类器官再生、免疫杀伤、迁移侵袭或体内成瘤/复发表型的功能意义。
8. 研究内容:
• 内容1:公共数据库与临床样本验证。基于TCGA/GDC、GEO、HPA、DepMap及可获得单细胞/空间数据构建PD-L1/HLA-I low相关signature;在申请人目标癌种样本中用qPCR、WB、IHC或多重IF验证表达、定位与预后/复发/治疗反应关系。
• 内容2:机制因果验证。围绕“抗原呈递低下 → T细胞排斥 → CSC残留”开展敲低、过表达、药物阻断、配体刺激、抑制剂处理和关键分子救援,明确靶标在通路激活中的必要性和充分性。
• 内容3:功能与疾病意义验证。通过球形成、类器官形成、极限稀释、细胞迁移侵袭、免疫共培养杀伤或动物移植模型,评估该轴对免疫冷干性微区与复发的影响,并设计替代验证终点。
9. 关键技术路线:
• 组学发现:bulk转录组/蛋白组+单细胞/空间数据整合,先输出候选图谱,不写未经分析的统计量。
• 临床验证:目标癌种FFPE/新鲜样本,检测PD-L1/HLA-I low、干性标志和通路读出;多重IF验证细胞来源与空间邻近。
• 体外验证:CSC富集球培养、药物压力残留模型、3D类器官或肿瘤-基质/免疫共培养。
• 因果干预:siRNA/shRNA/CRISPRi/过表达/药物阻断;围绕“抗原呈递低下 → T细胞排斥 → CSC残留”设置救援实验。
• 体内验证:条件允许时开展皮下/原位移植、限制性稀释成瘤或治疗后复发模型;经费不足时以类器官和小样本验证替代。
10. 特色与创新之处:
• 新靶标维度:把PD-L1/HLA-I low从相关分子推进为可扰动的CSC功能节点。
• 新机制维度:将“抗原呈递低下 → T细胞排斥 → CSC残留”作为主线,避免泛泛讨论空间干性 / 局部复发 / 风险地图。
• 新表型维度:把免疫冷干性微区与复发作为核心终点,配合干性功能实验而非单纯表达验证。
• 新模型维度:采用公开多组学发现、小样本空间验证、细胞/类器官扰动和救援的最小闭环。
• 延续与突破:可嵌入申请人已有癌种、样本、模型和平台;未提供基础时,建议先做2–3项预实验。
11. 可行性分析:
• 已有基础:本报告尚未获得申请人真实前期数据,因此按“基础待补充”处理;若已有样本或模型,可优先纳入立项依据。
• 样本/模型:建议至少建立20–30例FFPE验证队列、2个细胞系/类器官模型和1套共培养或治疗压力模型。
• 技术平台:qPCR/WB/IHC/多重IF、流式分选、球形成、类器官培养和PD-L1/HLA-I low扰动均具备常规可执行性;高级组学可根据经费缩放。
• 周期可控:第一年完成数据挖掘和样本验证,第二年完成机制扰动,第三年完成功能验证和风险替代实验。
12. 风险点与替代方案:
• PD-L1/HLA-I low表达差异不稳定:改用蛋白定位、通路活性评分或组合signature,避免仅依赖单基因。
• 机制轴验证不成立:保留上游刺激和下游表型,平行检测替代通路;以救援实验决定主轴是否需要调整。
• 动物模型表型不显著:用类器官、极限稀释成球、免疫共培养杀伤或空间样本验证作为替代终点。
• 临床相关性不足:扩大到外部队列或调整结局为复发、治疗反应、局部侵袭、免疫排斥等更贴近机制的终点。
• 技术条件受限:先完成最小闭环,暂缓高成本空间/单细胞实验,以多重IF和公开数据替代。
13. 关键参考文献:
[1] Enfield KSS, Colliver E, Lee C, et al. Spatial Architecture of Myeloid and T Cells Orchestrates Immune Evasion and Clinical Outcome in Lung Cancer. Cancer Discov. 2024;14(6):1018-1047. DOI: 10.1158/2159-8290.CD-23-1380. PMID: 38581685.
[2] National Cancer Institute. Human Tumor Atlas Network (HTAN): constructing three-dimensional atlases of cellular, morphological, molecular and spatial features of human cancers and microenvironments over time. Official NCI resource, updated 2025. URL: humantumoratlas.org / cancer.gov.
[3] Loh JJ, Ma S. Hallmarks of cancer stemness. Cell Stem Cell. 2024;31(5):617-639. DOI: 10.1016/j.stem.2024.04.004. PMID: 38701757.
[4] Chu X, Tian W, Ning J, et al. Cancer stem cells: advances in knowledge and implications for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2024;9(1):170. DOI: 10.1038/s41392-024-01851-y. PMID: 38965243.
[5] Agudo J, Miao Y. Stemness in solid malignancies: coping with immune attack. Nat Rev Cancer. 2025;25(1):27-40. DOI: 10.1038/s41568-024-00760-0. PMID: 39455862.
[6] Saw PE, Xu X, Chen J, Song EW. Cancer stem cell mimicry for immune evasion and therapeutic resistance. Cell Stem Cell. 2024;31(8):1101-1112. DOI: 10.1016/j.stem.2024.06.003. PMID: 38925125.
[7] National Cancer Institute. Genomic Data Commons Data Portal and Repository: TCGA, HCMI and other cancer datasets for molecular and clinical research. Official NCI/GDC resource.

选题5
1. 项目题目:POSTN富集切缘生态位促进目标实体瘤空间干性保留和局部复发的机制研究
2. 适配项目类型:国自然面上 / 地区项目 / 省自然;适合有手术切缘、病理队列或复发随访资源的团队。
3. 科学问题属性:需求牵引,突破瓶颈。该方向直接对应复发、耐药、免疫治疗失败或治疗筛选瓶颈,疾病相关性强,适合用机制研究支撑可转化标志物或干预策略。
4. 核心科学问题:在目标实体瘤背景下,POSTN是否通过“POSTN基质富集 → αvβ3/FAK → 干性克隆黏附”成为驱动“切缘附近CSC保留”的因果节点?
5. 核心科学假说:治疗压力、生态位刺激或空间微环境改变可诱导POSTN异常激活/抑制,并通过“POSTN基质富集 → αvβ3/FAK → 干性克隆黏附”重塑CSC功能状态,最终导致切缘附近CSC保留;阻断或救援该轴将相应降低或恢复CSC相关功能表型。
6. 立项依据/研究背景:围绕“空间干性地图预测局部复发风险”方向,当前领域已经认识到肿瘤干细胞并非固定不变的少数细胞,而是在治疗压力、生态位信号、代谢应激和免疫选择中不断转换的功能状态。已有高质量综述和近期研究提示,CSC与复发、转移、治疗抵抗和免疫逃逸密切相关,但多数研究仍停留在标志物相关或泛通路描述层面,缺少能被扰动、能被救援、能回到临床样本验证的因果机制。本选题以“POSTN”为核心切入点,将其嵌入“POSTN基质富集 → αvβ3/FAK → 干性克隆黏附”机制轴,聚焦“切缘附近CSC保留”这一可量化表型,避免把多组学分析作为终点。拟先在公开数据库和单细胞/空间数据中建立候选signature,验证POSTN与干性评分、生态位细胞邻近、治疗反应或复发结局的关系;再在申请人后续补充的目标癌种样本中通过qPCR/WB/IHC/多重IF确认表达与空间定位;最后利用细胞系、类器官或共培养模型进行敲低、过表达、药物干预和救援实验。该设计的科学价值在于把“空间干性 / 局部复发 / 风险地图”下降到一条可被验证的靶标—通路—表型链条,同时保留向标志物、药物组合或风险分层转化的接口。由于目前尚未提供申请人具体前期数据,所有数据库相关结论均按“拟验证”处理,正式标书中需补充真实图表和统计结果。
7. 研究目标:
• 总目标:阐明POSTN及其相关机制轴在目标实体瘤CSC关键表型中的因果作用。
• 分目标1:验证POSTN在目标癌种临床样本、公开队列和CSC富集模型中的表达变化、空间定位和临床相关性。
• 分目标2:解析“POSTN基质富集 → αvβ3/FAK → 干性克隆黏附”的上下游调控关系,明确关键中间分子、转录/代谢/免疫读出和救援节点。
• 分目标3:评估该机制轴对“切缘附近CSC保留”以及球形成、类器官再生、免疫杀伤、迁移侵袭或体内成瘤/复发表型的功能意义。
8. 研究内容:
• 内容1:公共数据库与临床样本验证。基于TCGA/GDC、GEO、HPA、DepMap及可获得单细胞/空间数据构建POSTN相关signature;在申请人目标癌种样本中用qPCR、WB、IHC或多重IF验证表达、定位与预后/复发/治疗反应关系。
• 内容2:机制因果验证。围绕“POSTN基质富集 → αvβ3/FAK → 干性克隆黏附”开展敲低、过表达、药物阻断、配体刺激、抑制剂处理和关键分子救援,明确靶标在通路激活中的必要性和充分性。
• 内容3:功能与疾病意义验证。通过球形成、类器官形成、极限稀释、细胞迁移侵袭、免疫共培养杀伤或动物移植模型,评估该轴对切缘附近CSC保留的影响,并设计替代验证终点。
9. 关键技术路线:
• 组学发现:bulk转录组/蛋白组+单细胞/空间数据整合,先输出候选图谱,不写未经分析的统计量。
• 临床验证:目标癌种FFPE/新鲜样本,检测POSTN、干性标志和通路读出;多重IF验证细胞来源与空间邻近。
• 体外验证:CSC富集球培养、药物压力残留模型、3D类器官或肿瘤-基质/免疫共培养。
• 因果干预:siRNA/shRNA/CRISPRi/过表达/药物阻断;围绕“POSTN基质富集 → αvβ3/FAK → 干性克隆黏附”设置救援实验。
• 体内验证:条件允许时开展皮下/原位移植、限制性稀释成瘤或治疗后复发模型;经费不足时以类器官和小样本验证替代。
10. 特色与创新之处:
• 新靶标维度:把POSTN从相关分子推进为可扰动的CSC功能节点。
• 新机制维度:将“POSTN基质富集 → αvβ3/FAK → 干性克隆黏附”作为主线,避免泛泛讨论空间干性 / 局部复发 / 风险地图。
• 新表型维度:把切缘附近CSC保留作为核心终点,配合干性功能实验而非单纯表达验证。
• 新模型维度:采用公开多组学发现、小样本空间验证、细胞/类器官扰动和救援的最小闭环。
• 延续与突破:可嵌入申请人已有癌种、样本、模型和平台;未提供基础时,建议先做2–3项预实验。
11. 可行性分析:
• 已有基础:本报告尚未获得申请人真实前期数据,因此按“基础待补充”处理;若已有样本或模型,可优先纳入立项依据。
• 样本/模型:建议至少建立20–30例FFPE验证队列、2个细胞系/类器官模型和1套共培养或治疗压力模型。
• 技术平台:qPCR/WB/IHC/多重IF、流式分选、球形成、类器官培养和POSTN扰动均具备常规可执行性;高级组学可根据经费缩放。
• 周期可控:第一年完成数据挖掘和样本验证,第二年完成机制扰动,第三年完成功能验证和风险替代实验。
12. 风险点与替代方案:
• POSTN表达差异不稳定:改用蛋白定位、通路活性评分或组合signature,避免仅依赖单基因。
• 机制轴验证不成立:保留上游刺激和下游表型,平行检测替代通路;以救援实验决定主轴是否需要调整。
• 动物模型表型不显著:用类器官、极限稀释成球、免疫共培养杀伤或空间样本验证作为替代终点。
• 临床相关性不足:扩大到外部队列或调整结局为复发、治疗反应、局部侵袭、免疫排斥等更贴近机制的终点。
• 技术条件受限:先完成最小闭环,暂缓高成本空间/单细胞实验,以多重IF和公开数据替代。
13. 关键参考文献:
[1] Enfield KSS, Colliver E, Lee C, et al. Spatial Architecture of Myeloid and T Cells Orchestrates Immune Evasion and Clinical Outcome in Lung Cancer. Cancer Discov. 2024;14(6):1018-1047. DOI: 10.1158/2159-8290.CD-23-1380. PMID: 38581685.
[2] National Cancer Institute. Human Tumor Atlas Network (HTAN): constructing three-dimensional atlases of cellular, morphological, molecular and spatial features of human cancers and microenvironments over time. Official NCI resource, updated 2025. URL: humantumoratlas.org / cancer.gov.
[3] Loh JJ, Ma S. Hallmarks of cancer stemness. Cell Stem Cell. 2024;31(5):617-639. DOI: 10.1016/j.stem.2024.04.004. PMID: 38701757.
[4] Chu X, Tian W, Ning J, et al. Cancer stem cells: advances in knowledge and implications for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2024;9(1):170. DOI: 10.1038/s41392-024-01851-y. PMID: 38965243.
[5] Agudo J, Miao Y. Stemness in solid malignancies: coping with immune attack. Nat Rev Cancer. 2025;25(1):27-40. DOI: 10.1038/s41568-024-00760-0. PMID: 39455862.
[6] Saw PE, Xu X, Chen J, Song EW. Cancer stem cell mimicry for immune evasion and therapeutic resistance. Cell Stem Cell. 2024;31(8):1101-1112. DOI: 10.1016/j.stem.2024.06.003. PMID: 38925125.
[7] National Cancer Institute. Genomic Data Commons Data Portal and Repository: TCGA, HCMI and other cancer datasets for molecular and clinical research. Official NCI/GDC resource.
第六部分:5个选题评分与排序
选题
核心靶标
重要性20
原创性20
机制15
基础15
可行15
相关10
风险5
总分
排序建议
选题1
CA9/HIF1A
19
18
14
13
13
9
4
90
优先
选题2
SPP1
19
15
14
13
13
9
4
87
优先
选题3
FN1/ITGB1
18
13
14
13
13
9
4
84
备选
选题4
PD-L1/HLA-I low
18
11
13
13
13
9
4
81
备选
选题5
POSTN
18
11
13
12
12
8
4
78
谨慎

推荐优先申报:选题1(CA9/HIF1A)和选题2(SPP1)。两者相对兼顾机制深度、可验证性和转化接口。若作为博士课题,建议只保留一个靶标、一条机制轴和一组核心表型;若作为国自然面上,需要增加两类独立模型、救援实验和申请人真实前期数据;若作为省自然,应强调区域样本资源、病理队列随访和可转化检测指标。
第七部分:最优选题深化建议
推荐选题
题目如何更像国自然
前期基础增强
压缩为博士课题
扩展为面上项目
避免评审质疑
选题1:CA9/HIF1A
题目建议保留“CA9/HIF1A—局部缺氧—缺氧空间微区中的复发种子”三要素,避免加入过多技术词。
前期基础需补:①公开数据发现图;②20–30例IHC/mIF验证;③CA9/HIF1A干预后核心表型改变;④至少1个救援实验。
博士课题压缩:只做1个癌种、2个模型、1个表型和1个救援实验;空间/动物可作为附加结果。
面上项目扩展:加入临床队列、类器官或动物模型,形成“发现—机制—功能—转化”三Aim。
可能质疑:靶标是否新、是否CSC特异、机制是否因果、样本量是否够、技术是否超预算;应通过预实验图和替代方案回应。
选题2:SPP1
题目建议保留“SPP1—SPP1+髓系细胞—免疫抑制干性岛形成”三要素,避免加入过多技术词。
前期基础需补:①公开数据发现图;②20–30例IHC/mIF验证;③SPP1干预后核心表型改变;④至少1个救援实验。
博士课题压缩:只做1个癌种、2个模型、1个表型和1个救援实验;空间/动物可作为附加结果。
面上项目扩展:加入临床队列、类器官或动物模型,形成“发现—机制—功能—转化”三Aim。
可能质疑:靶标是否新、是否CSC特异、机制是否因果、样本量是否够、技术是否超预算;应通过预实验图和替代方案回应。

第八部分:参考文献列表(已核验/资源来源)
1. Enfield KSS, Colliver E, Lee C, et al. Spatial Architecture of Myeloid and T Cells Orchestrates Immune Evasion and Clinical Outcome in Lung Cancer. Cancer Discov. 2024;14(6):1018-1047. DOI: 10.1158/2159-8290.CD-23-1380. PMID: 38581685.
2. National Cancer Institute. Human Tumor Atlas Network (HTAN): constructing three-dimensional atlases of cellular, morphological, molecular and spatial features of human cancers and microenvironments over time. Official NCI resource, updated 2025. URL: humantumoratlas.org / cancer.gov.
3. Loh JJ, Ma S. Hallmarks of cancer stemness. Cell Stem Cell. 2024;31(5):617-639. DOI: 10.1016/j.stem.2024.04.004. PMID: 38701757.
4. Chu X, Tian W, Ning J, et al. Cancer stem cells: advances in knowledge and implications for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2024;9(1):170. DOI: 10.1038/s41392-024-01851-y. PMID: 38965243.
5. Agudo J, Miao Y. Stemness in solid malignancies: coping with immune attack. Nat Rev Cancer. 2025;25(1):27-40. DOI: 10.1038/s41568-024-00760-0. PMID: 39455862.
6. Saw PE, Xu X, Chen J, Song EW. Cancer stem cell mimicry for immune evasion and therapeutic resistance. Cell Stem Cell. 2024;31(8):1101-1112. DOI: 10.1016/j.stem.2024.06.003. PMID: 38925125.
7. National Cancer Institute. Genomic Data Commons Data Portal and Repository: TCGA, HCMI and other cancer datasets for molecular and clinical research. Official NCI/GDC resource.
8. Uhlén M, et al.; Human Protein Atlas Consortium. The Human Protein Atlas cancer resource provides transcriptomic, proteomic and pathology images for multiple cancer types. Official resource: proteinatlas.org.
9. Cancer Dependency Map Project. DepMap Portal: open-access cancer model dependency and perturbation resource for therapeutic vulnerability discovery. Official resource: depmap.org.
说明:数据库与资源类条目用于方案设计方向与数据抓手说明,不代表本报告已完成真实下载、批量校正或统计建模;正式申请书中必须补充可复现代码、结果图和统计表。














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