梅花鹿为季节性发情动物，2~3岁性成熟，每年秋季发情，10-11月为交配盛期。此时选择茸大、生长快、质量好的做种鹿，参加配种繁殖。主要以群配（公母鹿混合编群，自行交配）、轮配（公鹿轮流放入母鹿群中）、互配（公鹿以调换的方法放入4~5头母鹿小群中）的配种方法，受胎率高。
发情期间，梅花鹿会显得烦燥不安、食欲减退，尤其雄鹿，性凶好斗，如果鹿群中存在两头以上成年雄鹿，必会发生激烈的争斗，其结果不是两败俱伤，就是强者把弱者赶出群外。直至交配期过后，才慢慢恢复正常。
繁殖期间雄兽饮食显著减少，性情变得粗暴、凶猛，为了争夺配偶，常常会发生角斗，头上的两只角就成了彼此互相攻击的武器，这种“角斗”在鹿类中是一种非常普遍的现象。一只健壮的雄兽通常可以拥有10多只雌兽，在一个繁殖季节，雌兽可以多次发情，其发情周期为5天，一旦受孕后便不再发情。
母鹿妊娠后，发生系列生理和形态变化。新陈代谢旺盛，食欲增加，消化道能力增强，体重增加，皮毛光亮，性情温顺，行动小心。妊娠期为230天左右，妊娠6个月可见腹围增大，甚至能看见胎动。产仔于翌年5~6月，一般每胎仅产1仔，也有少数为2仔。
母鹿子宫阵缩及努责微弱，阵缩过强及破水过早，子宫捻转，子宫颈、阴道及骨盆狭窄等表现为难产症状。其原因一是母鹿发育不良，体型小，骨盆小;二是妊娠期饲养不良，由于缺乏营养而瘦弱，造成子宫阵缩无力;腹肌无力，或者由于精料过多，运动量不足而肥胖，产道狭窄。三是胎儿过大，或双胎时两胎儿同时楔入产道;胎儿畸形及发育异常;胎势、胎位、胎向不正。常见的有头颈捻转，前腿一腕部前置，前腿肘关节曲屈。倒生是后腿跗部前置，后腿坐骨前置及胎儿竖向腹部前置。
母鹿产下的幼仔体毛呈黄褐色，也有白色的斑点，几个小时就能站立起来，第二天可随雌兽跑动。雌兽觅食时先到林外四处探望，确信没有危险后，才把幼仔带出来，发现险情会发出惊叫，带着幼仔逃进密林。哺乳期为2~3个月，4个月后幼仔便可以长到10公斤左右。1.5~3岁性成熟，寿命约为20年。
中药配伍鹿是宝，千古美谈古至今。
