2026不到半年，全国就有超3000家高企被取消，同比暴增55%！老牌高企、上市公司接连中招，上亿补税案频发。今年高企监管全面升级，抽查比例大幅提升，覆盖全税种，直指50万家高企的税务合规与资质维护软肋。接下来聚恒将结合当下形势，为大家拆解分析。
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全国超3000家高企被取消资格
1-6月暴增55%
2026年一场覆盖多省市的高新资质专项清查正全面铺开。据公开数据，截至6月22日，2026年全国约有超3000家企业被撤销高新技术企业资格，对比 2025年同期1928 家，取消规模增幅高达55%
尤其进入6月份以来，高企取消的频率及家数进一步提升，山东、河南清退数量直接领跑全国，超千家企业出局，辽宁近期更是被一次性取消146家！
这场大规模清查并非临时抽查，而是高企监管体系全面升级的信号。
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2026高企监管全新形势
补税最高5.12亿
聚恒遇到很多企业认为自己是多年老高企，不会有什么问题，但今年的监管形势已经完全不同了。
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2026年高新监管模式升级
以往高新认定通过后，三年内少有核查。就算查出部分数据不达标， 仅要求更正数据、补缴当期税款，仍会保留高企证书。
如今各地抽查比例大幅提升，高企证书有效期内每年随机抽检、跨部门数据联查，工商、税务、社保、知识产权数据互通，多地税务稽查部门联合科技部门、公安开展专项整治。一旦高企复核不通过直接撤销资质，追溯多年纳税年度，全额追缴优惠。
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全税种联动税务稽查
不少企业存在误区，以为高企取消就是企业所得税补税，却忽略了全税种联动税务稽查。
2026年高企资质一旦被撤销，企业不光需按 25% 税率补缴企业所得税。其先进制造业增值税加计抵减资格也会同步取消，过往减免的增值税、城建税、教育费附加需全额补缴。
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老牌高企上亿补税案频发
聚恒还发现今年曝光的高企案例中，老牌高企，上市等大企业占比尤其的多，大批企业补缴上亿元。
所以老高企绝对不能因制度完善就掉以轻心，那些普通中小企业更不用说，比如江苏就接连有两家高企被公开曝光（往期文章：江苏税局稽查南京企业研发费用违规，补罚超100万），企业要尽早识别风险做好合规处理。
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绝大部分高企都栽在这4大税务红线
根据2026年高企曝光的各种涉税问题，及聚恒多年来服务高企的经验，我们发现绝大部分高企都是栽在了忽视资质维护以及税务不合规上！所以无论是新老高企，都要重视以下风险问题。
不符合高企认定条件
2026年税务重点就查这个，这也一直是高企认定失败及高企资格取消的首要原因。
高新收入占比未达60%
《高新技术企业认定管理办法》明确要求高新产品收入占总收入 60% 以上。
研发费用占比不达标
此外高企必须满足研发费用占比要求（营收≤5000万需5%，5000万-2亿需4%，＞2亿需3%），聚恒建议企业单独建账核算研发费用，定期自查比对。
高企研发费用归集不合规
2026江苏等部分省市再度收紧高企认定内部执行口径，很可能会大批量影响高企研发费用占比不达标。
所以企业需要特别注意高企认定和加计扣除研发费用口径差异问题。
违享税收优惠，易引发税务稽查
高企能享受15%所得税优惠，先进制造业增值税加计 5% 抵减，固定资产加速折旧等一系列政策红利。但前提一定是符合高企资质，这在2026年全税种联动稽查下一定要万分警醒。
忽视日常维护，导致高企资格失效
此外，高企资格3年有效，期满前未通过重新认定，或发生重大安全质量环境事故，忘记填写年报等，都可能导致资格取消，并面临追缴已享受的税收优惠及滞纳金风险。
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这3大行业，抓紧自查
不过很多财务还有老板都是嘴上紧张，没真正重视高企税务合规，没被重罚，就一直搁置。今年被查高企里，有相当一部分就是被这种侥幸心理拖垮的。尤其下面这三个行业，我们建议立刻自查。
1.传统制造业（重灾区）
传统制造业，是近年来高企清退的重灾区。在2026年穿透式核查下，企业生产收入混入高新产品收入，研发费用材料费占比畸高等问题极易暴露。
所以聚恒建议即便企业已经拿到高企资格，也要持续监控高新收入，和研发费用占比是否达标，定期评估税务风险。快到三年复核前，更要好好准备。
2.医药与医疗器械（新增核查重点）
医药与医疗器械行业是2026年着重突出的税务稽查重点。尤其是研发费用，企业要重点核查委外研发的真实性，建立研发人员工时台账，按实际参与工时分摊费用。
3.中小软件企业
2026年高企评审强化“硬科技”属性，弱化软件著作权等Ⅱ类知识产权权重。软件企业一定要确保知识产权与企业核心业务强关联，严格区分高新与一般业务收入。
在此聚恒真心的呼吁高企重视自身企业税务合规问题。不管属于哪个行业，不管是多少年的老高企，高企税务合规都不是一劳永逸的事。早自查、早合规，总比等到资质被撤销、补缴大额税款要稳妥得多。如果您有任何问题，欢迎随时联系我们。
编辑：聚恒财税
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