
萜烯是一系列萜类化合物的总称,是在许多植物中发现的芳香族化合物,为植物创造了特征气味,如大麻、松树和薰衣草。在自然界中,萜烯可保护植物免受动物或传染性细菌的侵害。
萜类在植物中的含量通常很低,且植物提取法还存在野生资源稀缺、分离效果不佳、产量极低的问题;化学合成法虽解决了植物提取法中的诸多问题,但仍存在原料昂贵、工艺流程复杂、立体选择性低、能耗高、污染大、总收率偏低等问题。相比之下,生物合成法不受原料的限制、生产过程绿色清洁、产物单一、产率提升空间大,具有很大的优势。
生物合成法又分为两种,一种是通过代谢工程手段直接在植物中促进萜类的合成;另一种是通过合成生物学在微生物等底盘细胞中合成目标产物。
近日,江南大学的团队在微生物底盘细胞 Candida glycerinogenes (C.glycerinogenes,产甘油假丝酵母) 中构建了合成萜烯的途径,通过过表达、基因敲低和反义 RNA 抑制等策略,萜烯的产量提高了近 16 倍,达到 6.0mg/L。相关文章以题为“Synthesis of pinene in the industrial strain Candida glycerinogenes by modification of its mevalonate pathway”发表在 Journal of Microbiology 期刊。
C.glycerinogenes 由江南大学诸葛斌实验室分离,具有自主知识产权,该菌株可以承受高温(42℃)、高乙醇浓度(20% V/V)、多种有机酸,并能产生甘油(约 130g/L)。此外,C.glycerinogenes 拥有完整的甲羟戊酸 (MVA) 途径,可以潜在地用作萜类化合物合成的底盘细胞。
甲羟戊酸途径(Mevalonate pathway)是以乙酰辅酶A为原料合成异戊二烯焦磷酸和二甲烯丙基焦磷酸的一条代谢途径,存在于所有高等真核生物和很多病毒中。该途径的产物可以看作是活化的异戊二烯单位,是类固醇、类萜等生物分子的合成前体。
此外,经过简单的转化,C.glycerinogenes 可以高效利用原甘蔗渣水解产物,在相同条件下比酿酒酵母 S. cerevisiae ZWA46 产生更多的乙醇。在超高葡萄糖浓度(550 g/L)下,C.glycerinogenes 生长良好且优于其他酵母。
通常,在 MVA 途径的下游,存在与生长和代谢密切相关的途径,它们竞争碳源。如果下游通路太强,往往会导致细菌的旺盛生长,而不是相关产物合成。
本研究中,研究团队将蒎烯生产途径引入 C.glycerinogenes,蒎烯产量主要通过加强上游 MVA 途径和抑制下游途径副产物的产生来提高。此前,该实验室已经用 C.glycerinogenes 生产了 1194.6 mg/L 的香叶醇,香叶醇和蒎烯都是单萜类化合物,以香叶基焦磷酸盐 (GPP) 为前体。

▲图 | C. glycerinogenes 中蒎烯生物合成方案,黑色箭头表示天然途径,红色箭头表示代谢工程修饰途径
研究人员首先评估了 C.glycerinogenes 和 S.cerevisiae 对蒎烯的耐受性。当蒎烯>200 mg/L ,S.cerevisiae 无法生长,但 C.glycerinogenes 在该浓度下生长良好。
此外,研究团队对上述两种底盘细胞中甲羟戊酸和角鲨烯含量进行了测定。甲羟戊酸是 MVA 途径的重要中间代谢物,是生产异戊二烯的重要前提。甲羟戊酸水平对其下游产品的生产具有约束力;角鲨烯则是 MVA 途径下游的关键代谢物。最终发现C.glycerinogenes 中的角鲨烯含量是 S.cerevisiae 的 3 倍,团队猜测是因为 C. glycerinogenes 中的 MVA 途径更强。表明 C.glycerinogenes 更适合作为蒎烯合成的底盘细胞。
以甲羟戊酸为节点,MVA 途径可分为上游和下游途径。团队检查了增强上游和下游途径对角鲨烯合成的影响。加强上游途径后,角鲨烯的产量明显高于下游途径。这可能是因为上游代谢途径较弱,加强它可以提高甲羟戊酸含量,为下游萜烯合成提供足够的前体。因此,加强上游途径使 MVA 途径的代谢更加平衡,促进了角鲨烯的合成。
角鲨烯的大量积累也会减少蒎烯的合成。当反义 RNA 抑制角鲨烯的合成时,通过 MVA 途径的反馈调节,蒎烯产量为 5.1mg/L。
为了提高蒎烯的产量,团队将上游和下游通路独立增强,以检查对蒎烯合成的影响。上游通路主要通过过表达 ERG10、ERG13 和 tHMGR 来增强,下游通路主要通过过表达 ERG12、ERG8 和 IDI1 来增强。在第⼀种情况下,蒎烯产量为 4.1mg/L,在第⼆种情况下,蒎烯产量为 3.1mg/L。
乙酰辅酶 A 是酵母代谢中最重要的代谢中间体,也是 MVA 途径的起始材料。因此,加强乙酰辅酶 A 合成可以增加 MVA 途径中的碳流量,并在蒎烯的下游合成中发挥关键作用;而甘油和乙醇是对蒎烯合成具有强烈影响的两个主要副产物,通过抑制甘油或乙醇,蒎烯产量分别达到 4.7 mg/L 和 4.45 mg/L。当甘油、乙醇和角鲨烯的合成途径同时被抑制时,蒎烯产量为 6.0 mg/L。
总之,利用代谢工程,江大团队构建了在 C.glycerinogenes 中合成蒎烯的途径,通过修饰 MVA 途径,增强上游途径和抑制下游角鲨烯的合成,抑制乙醇和甘油的合成,显着提高了蒎烯产量。
论文中,团队也表示下⼀个重点是蒎烯合酶的合理设计和修饰,以提高其与其底物 GPP 的结合能力。此外,角鲨烯和蒎烯的联产发酵可能是未来的一个方向。
参考资料:
1.https://patents.google.com/patent/CN107723300A/zh
3.https://www.baike.com/wikiid/6984896272574579886?from=wiki_content&prd=innerlink&view_id=5adfxi7nw5o000
4.http://biotech.jiangnan.edu.cn/szdw1/jzyg/zg1/zgb.htm
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