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MOLBREEDING
DNA样本送样规范
一、耗材选择及装样规范
建议使用96孔PCR板或深孔板进行装样,并使用配套硅胶盖或热封膜进行热封。将所有样本板进行叠放压紧,并将所有样本板一并使用保鲜膜进行缠绕固定,避免在样本运输过程中硅胶盖松动导致样本损失或样本间串孔污染的情况。
使用96孔板时需将核酸样本按照A1-A12,A-H列的顺序进行装样操作。并将样本信息填写至样本信息表本,以便我司收到样本后进行样本核对工作。96孔板装样规范示意图如图1所示:
图1
注意:使用96孔PCR板或深孔板进行核酸样本邮寄时切勿使用粘性封口膜进行封膜操作,在运输和开盖过程中易造成样本间的串孔污染情况。
对所有样本板进行固定工作切勿使用橡皮筋或胶带进行缠绕固定,易造成96孔板变形进而板盖分离导致样本间串孔污染。DNA样本建议采用“上海都友”品牌的96孔板(为我司自用品牌)进行邮寄。
二、邮寄方法
将样本管放于透明的塑料袋中或样本板整齐放于泡沫箱中,在样本周围包裹适量的防震塑料泡泡纸和冰袋,需将项目信息单打印后放于自封袋中以免冰袋打湿。
建议采用低温放置冰袋的方式进行样本邮寄。
三、DNA样本送样说明
根据DNA样本的总量、条带完整度及样本状态进行质控,以下为我司对于DNA样本质控的简要说明:
1.
首先根据DNA总量初步判断等级,
判断标准如下表
图2
我司采用Qubit®2.0对DNA浓度进行定量检测,根据实际收到的样本体积计算DNA总量。
2.
样本等级说明
A 级:样品质量满足建库测序要求,且总量满足2次或2次以上建库需要
B 级:样品质量满足建库测序要求,且总量满足1次但不足2次建库需要
C 级:样品质量不完全满足建库测序要求,可以尝试建库
D 级:样品质量完全不满足建库测序要求,不建议使用的样品
3.
然后根据DNA胶图对样品等级
进行进一步的判定,判级示例见下图:
图3
图2中样本1-3 DNA主带清晰且位置正确(根据浓度判定等级);
图2中样本4-6 DNA主带清晰且位置正确 ,但存在RNA污染(根据实际情况进行降级判断);
图2中样本7-9存在DNA降解情况(根据实际情况进行降级判断);
图2中样本10-12存在DNA严重降解情况(判定为C级);
图2中样本13-15存在DNA无主带情况(判定为D级)。
4.
最后根据样品颜色判定最终的样品等级
图3中A08、B12、C01、C02、C07样品有颜色(A、B等级样品有颜色、杂质判定为C级)。
图4
备注:根据公司规定,所有DNA样本在DNA纯化后再进行质检判级,纯化工作会对DNA有一定量的损失,请知悉。DNA样本质检结果以最终收到的实际样本检测结果为准。

