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【CUT&Tag测序】

【CUT&Tag测序】 智普肽德
2025-04-09
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导读:精准捕获蛋白-DNA互作,开启表观遗传研究的“高分辨率时代”


CUT&Tag测序



CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)以超高灵敏度、低起始量、低背景的特性,重新定义表观遗传研究标准!

——解析转录因子结合、组蛋白修饰、染色质重塑的高效工具


1

应用场景

1. 基础机制研究

转录调控网络:绘制TF结合位点图谱。

表观遗传分析:追踪发育过程中组蛋白修饰的过程等。

2. 疾病机制解析

肿瘤异常调控:鉴定癌基因的超级增强子激活机制等。

免疫疾病:揭示T细胞中炎症因子的染色质结合异常等。

3. 药物开发加速

表观药物靶点验证

联合治疗策略:探索表观药物与免疫检查点抑制剂的协同作用机制等。


2 技术原理

五步精准锁定蛋白-DNA互作位点


细胞固定与通透

甲醛交联固定蛋白-DNA复合物,温和透化细胞膜,保持染色质天然结构。


靶标蛋白抗体结合

一抗精准靶向:结合目标蛋白(如H3K27ac、CTCF、RNA聚合酶Ⅱ)。

二抗桥接:引入Protein A/G-Tn5融合蛋白,定向锚定Tn5转座酶。


靶向切割与标签插入

Tn5转座酶活化:在抗体定位处切割DNA并插入测序接头(仅靶标区域被标记)。

精准性保障:避免ChIP-seq的超声随机片段化,背景信号降低90%以上。


DNA释放与文库构建

蛋白酶K消化释放靶标DNA片段,PCR扩增构建测序文库。


高通量测序与智能分析

Illumina NovaSeq平台:双端测序(PE150),单碱基分辨率定位互作位点。

AI辅助注释:集成MACS2峰检测、Motif分析、靶基因富集(GO/KEGG),一键生成互作网络图。



3

技术优势


超高灵敏度

样本量需求低:仅需10^3~10^4个细胞(ChIP-seq需10^6~10^7),兼容微量临床样本(如穿刺组织、循环肿瘤细胞)。

单细胞兼容性:可拓展至单细胞CUT&Tag(scCUT&Tag),解析细胞异质性。

极低背景噪音

靶向切割技术:Tn5仅在抗体定位区域激活,非特异性切割减少>95%。

信噪比提升:对比ChIP-seq,目标区域信号强度提升3-5倍。

多场景适配

广泛靶标:支持转录因子(TFs)、组蛋白修饰、染色质调控蛋白。

多组学串联:联合ATAC-seq、RNA-seq,构建“染色质状态→蛋白结合→基因表达”调控轴。


目标

应用科学技术,让人民的生活更美好。

联系我们,打造非凡的人工智能 & 多肽产品

muyonglin@aiptide.com

四川省成都市天府国际生物城b1栋305



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素材 | 智普肽德

文案 | 智普肽德

图片 | 智普肽德



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四川智普肽德生物科技有限责任公司
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