单细胞测序技术
单细胞测序技术(Single cell RNA sequencing,scRNA-seq)是指在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组等遗传信息进行高通量测序分析的一项新技术,可以研究单个细胞内的基因表达情况,同时解决用组织样本测序无法解决的细胞异质性难题,让解析单个细胞的行为、机制及其与机体的关系成为了现实。
单细胞转录组与传统转录组的对比
传统转录组测序将细胞群体“混合均质化”,掩盖了关键细胞亚群的异质性。
单细胞转录组测序(scRNA-seq)通过超高分辨率解析每个细胞的基因表达谱,精准识别稀有细胞类型、追踪发育轨迹、揭示疾病机制,为科研与临床提供全新视角!
单细胞转录组测序应用场景
1. 基础科研
细胞图谱构建:绘制器官/胚胎发育单细胞图谱(如人类细胞图谱计划)。
干细胞分化:追踪多能干细胞→功能细胞的分子开关。
2. 疾病研究
肿瘤异质性:解析癌细胞克隆进化、耐药亚群、免疫逃逸机制等。
神经疾病:鉴定阿尔茨海默病中特异性激活的胶质细胞亚群等。
3. 转化医学
生物标志物挖掘:从单细胞数据中筛选诊断/预后标志物(如CTC循环肿瘤细胞)。
免疫治疗:评估CAR-T细胞体内动态及耗竭特征,优化治疗方案。
单细胞转录组测序技术原理
1.单细胞分离与捕获
微流控技术:利用10x Genomics Chromium系统,通过油滴包裹单细胞与磁珠,实现高通量(单次百万级细胞)捕获。
磁珠标记:每个磁珠携带独特分子标签(UMI)和poly(dT)引物,确保单细胞RNA精准溯源。
2.RNA逆转录与扩增
模板转换:通过TSO(Template Switch Oligo)捕获mRNA全长,合成带标签的cDNA。
高效扩增:PCR扩增构建文库,保留单细胞表达特征,避免偏好性偏差。
3.高通量测序与数据分析
Illumina NovaSeq平台:双端测序(PE150),覆盖3’/5’端转录本,深度解析基因表达。
AI驱动分析:基于Seurat、Scanpy等算法,完成细胞聚类、注释、拟时序及互作网络建模。
技术优势
超高灵敏度
单细胞分辨率:检测低至1,000个基因/细胞,支持稀有细胞(占比<0.1%)精准捕获。
全转录本覆盖:可分析mRNA、lncRNA及可变剪切体,揭示复杂调控网络。
多组学整合
兼容单细胞ATAC-seq(染色质开放区域)、CITE-seq(表面蛋白检测)、空间转录组,构建多维生命图谱。
临床级稳定性
细胞活性>85%,线粒体基因比例<10%,数据重复性R²>0.95,符合严苛要求。
目标
应用科学技术,让人民的生活更美好。
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素材 | 智普肽德
文案 | 智普肽德
图片 | 智普肽德

