单细胞ATAC测序
基因的表达由表观遗传精密调控,而染色质的开放区域是调控的关键开关!
单细胞ATAC测序(scATAC-seq)通过单细胞分辨率解析染色质可及性,揭示细胞类型特异的调控元件、转录因子结合位点及基因互作网络,赋能疾病机制、发育调控和药物靶点研究!
单细胞ATAC vs 传统ATAC的对比
应用场景
1. 基础科研
细胞命运解析:揭示干细胞分化中染色质动态变化(如多能性基因位点)。
发育生物学:追踪胚胎发育中组织特异性调控元件的激活时序。
2. 疾病机制
肿瘤异质性:解析耐药克隆的独特染色质开放特征,锁定耐药相关增强子。
自身免疫病:鉴定异常开放的炎症信号通路调控元件。
3. 药物开发
表观药物靶点:筛选染色质开放区关键因子。
联合治疗策略:表观药物+免疫治疗协同机制研究。
四步解锁表观遗传奥秘
技术原理
单细胞核分离与捕获
微流控技术:基于10x Genomics Chromium平台,通过油滴包裹单细胞核与Tn5转座酶磁珠,实现高通量捕获(单次10,000+细胞核)。
细胞核质控:核膜完整率>95%,确保染色质结构稳定。
染色质开放区域切割与标记
Tn5转座酶:特异性切割开放染色质区域,同时插入测序接头(ATAC-seq核心步骤)。
唯一细胞标签:每个细胞核分配独特DNA标签,实现单细胞数据溯源。
文库构建与测序
PCR扩增:构建带标签的测序文库,保留开放染色质特征。
Illumina双端测序:PE150高深度测序,精准定位开放区域(分辨率达单碱基水平)。
AI驱动表观调控解析
峰检测与注释:识别开放区域(peaks),关联邻近基因与调控元件。
转录因子足迹分析:预测TF结合位点,解析调控网络。
多组学整合:联合scRNA-seq数据,构建“染色质开放→基因表达→细胞功能”。
技术优势
单细胞级表观解析
超高分辨率:从群体均质化到单细胞异质性,捕获稀有细胞表观状态(如肿瘤干细胞)。
超高灵敏度:检测低至500个开放区域/细胞,支持微量样本。
全基因组覆盖
无偏好性:覆盖启动子、增强子等全类型调控元件,绘制完整调控图谱。
多组学联合解决方案
兼容单细胞转录组(scRNA-seq)、CUT&Tag(组蛋白修饰),构建多组学调控。
目标
应用科学技术,让人民的生活更美好。
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muyonglin@aiptide.com
四川省成都市天府国际生物城b1栋305
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素材 | 智普肽德
文案 | 智普肽德
图片 | 智普肽德

