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单细胞ATAC测序

单细胞ATAC测序 智普肽德
2025-03-26
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导读:解码染色质开放密码,“看见每个细胞的染色质开放蓝图”

单细胞ATAC测序

      基因的表达由表观遗传精密调控,而染色质的开放区域是调控的关键开关!

       单细胞ATAC测序(scATAC-seq)通过单细胞分辨率解析染色质可及性,揭示细胞类型特异的调控元件、转录因子结合位点及基因互作网络,赋能疾病机制、发育调控和药物靶点研究!



单细胞ATAC vs 传统ATAC的对比


应用场景


1. 基础科研

细胞命运解析:揭示干细胞分化中染色质动态变化(如多能性基因位点)。

发育生物学:追踪胚胎发育中组织特异性调控元件的激活时序。

2. 疾病机制

肿瘤异质性:解析耐药克隆的独特染色质开放特征,锁定耐药相关增强子。

自身免疫病:鉴定异常开放的炎症信号通路调控元件。

3. 药物开发

表观药物靶点:筛选染色质开放区关键因子。

联合治疗策略:表观药物+免疫治疗协同机制研究。


四步解锁表观遗传奥秘

技术原理

单细胞核分离与捕获

微流控技术:基于10x Genomics Chromium平台,通过油滴包裹单细胞核与Tn5转座酶磁珠,实现高通量捕获(单次10,000+细胞核)。

细胞核质控:核膜完整率>95%,确保染色质结构稳定。

染色质开放区域切割与标记

Tn5转座酶:特异性切割开放染色质区域,同时插入测序接头(ATAC-seq核心步骤)。

唯一细胞标签:每个细胞核分配独特DNA标签,实现单细胞数据溯源。

文库构建与测序

PCR扩增:构建带标签的测序文库,保留开放染色质特征。

Illumina双端测序:PE150高深度测序,精准定位开放区域(分辨率达单碱基水平)。

AI驱动表观调控解析

峰检测与注释:识别开放区域(peaks),关联邻近基因与调控元件。

转录因子足迹分析:预测TF结合位点,解析调控网络。

多组学整合:联合scRNA-seq数据,构建“染色质开放→基因表达→细胞功能”。

技术优势

单细胞级表观解析

超高分辨率:从群体均质化到单细胞异质性,捕获稀有细胞表观状态(如肿瘤干细胞)。

超高灵敏度:检测低至500个开放区域/细胞,支持微量样本。

全基因组覆盖

无偏好性:覆盖启动子、增强子等全类型调控元件,绘制完整调控图谱。

多组学联合解决方案

兼容单细胞转录组(scRNA-seq)、CUT&Tag(组蛋白修饰),构建多组学调控。


目标

应用科学技术,让人民的生活更美好。

联系我们,打造非凡的人工智能 & 多肽产品

muyonglin@aiptide.com

四川省成都市天府国际生物城b1栋305


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素材 | 智普肽德

文案 | 智普肽德

图片 | 智普肽德



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