我国硅藻土等级的划分是根据硅藻土中SiO2的含量划分的，分为一级土(SiO2含量高于80%)、二级土和三级土。我国硅藻土的储量非常丰富，居世界第二，但是相对优质的硅藻土矿床，即一级土却较少，大多数地区的硅藻土矿床均为为二级或三级硅藻土，这些硅藻土中的SiO2含量较低。以硅藻土为原料的产品，如助滤剂等，对其质量要求很高;因此，硅藻土原土在使用前必须要先经过提纯处理。
目前，硅藻土的提纯方法主要有擦洗法、酸洗法、焙烧法等。
1擦洗法
擦洗法是指通过将硅藻土颗粒打细来筛分或过滤掉硅藻土中的一些杂质。但是由于硅藻土中含有的矿物性质及其颗粒粒度不同，通常要添加一些相应的助剂，以此来增加硅藻土的悬浮性和分散性。且擦洗往往要经过反复的过程，才能达到去想要的效果，即去除杂质、提高SiO2含量、获得硅藻精土的目标。硅藻土易与粘土等形成等降群，且擦洗较难清洗掉硅藻土微孔中的杂质;因此想单单通过擦洗法来将二者分离较为困难。未达到高的提纯要求，通常需要采用多次沉降步骤才能去除粘土矿物，但也使得擦洗法的回收率很低。硅藻土原矿进行了分离提纯，采用的是擦洗沉降的方法。提纯过程分为磨矿，擦洗和沉降分离三个步骤，最后成功地提纯出了SiO2含量高于90%的硅藻土精土。
2酸浸法
酸浸法主要是通过酸溶液的化学作用来去除硅藻土中的砂砾杂质。其主要步骤是现将硅藻土制成溶液，然后边搅拌边按一定的比例加入硫酸或盐酸等常用的强酸，搅拌反应一段时间以使硅藻土中一些矿物杂质，如A12O3、Fe2O3、CaO和MgO等，与酸发生化学反应而生成可溶性盐类。这样就可以通过过滤滤掉这些可溶性盐类，最后洗涤和干燥后就可以得到纯度较高的硅藻土。采用酸洗法提纯处理硅藻土，所用酸为盐酸，经盐酸酸浸1h后，硅藻土的比表面积由原来的189 m2/g提高到了222 m2/g。
3焙烧法
焙烧法是一种最简单、最有效的提工艺方法。一般是指通过600～800°C煅烧，去除硅藻土中的有机质杂质分解挥发，从而提高硅藻土中的SiO2含量;同时，焙烧之后的硅藻土中孔径会增大，表面酸强度增加。
4综合法
除以上三种方法外，还有重力沉降、磁选、热浮选法等方法，但无论哪一种方法自身都具有一定的局限性，因此一般采用将几种方法综合的方法来使提纯达到最好的效果。采用酸洗法和焙烧法综合的方法提纯四川米易地区的硅藻土，酸洗后SiO2含量达到79.64%，酸洗后再进行焙烧，SiO2含量上升达到81.74%。
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