冷冻切片技术助力空间转录组研究
单细胞空间转录组揭示
猕猴大脑皮层的细胞类型组织架构
“Single-cell spatial transcriptome reveals cell-type organization in the macaque cortex” 发表于Cell,通过大规模单细胞核RNA测序和空间转录组分析,构建了猕猴大脑皮层细胞类型分类法,揭示了细胞类型的空间分布、与皮层层级的关系及灵长类特异性细胞类型,为理解灵长类大脑的进化、发育等提供了重要基础。
1. 构建猕猴大脑皮层细胞分类法,确定了264 种转录组定义的皮层细胞类型。
2. 运用空间转录组分析技术,明确了上述细胞在大脑皮层的空间分布。
3. 发现了细胞类型分布与视觉、躯体感觉系统层级有关。
4. 跨物种(人、鼠)分析揭示了在L4层富集的灵长类特异性细胞类型。
图片摘要(Chen et al. 2023)
本研究采用猕猴大脑组织冷冻切片方法,用于空间转录组分析和免疫组化染色。冷冻切片质量对下游实验结果的准确性和可靠性极为关键。
空间转录组分析
高质量冷冻切片能够完整保留细胞的形态和组织结构,若切片过程导致细胞变形或破损,细胞内的RNA会泄漏,从而无法精准确定基因表达的空间位置。同时,冷冻切片机提供的稳定的温度可防止RNA降解,保证其完整性。而且,均匀的切片厚度至关重要,厚度不一致的切片会在成像和数据分析环节引入误差,过厚的切片会使不同细胞层的信息相互重叠,难以分辨各层细胞的基因表达差异;过薄的切片则可能丢失部分细胞,导致关键信息遗漏,进而影响对组织中基因表达模式的正确解读。
免疫组化染色
良好的冷冻切片质量可维持抗原活性,使抗体与抗原正常结合,准确显示目标蛋白的分布情况。此外,平整的切片能保证染色试剂均匀分布和渗透,呈现清晰的染色效果,避免对蛋白表达水平的误判。
徕卡冷冻切片机系列
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徕卡冷冻切片机系列凭借其精准温控、稳定切片与智能设计,为空间转录组分析及免疫组化染色等下游实验提供高质量冷冻切片保障。
空间转录组分析
全系列搭载精密制冷系统,确保样本全程处于稳定低温环境,有效抑制RNA降解;零位样本定位系统与精密步进电机支持切片厚度一致性,避免因厚度不均导致细胞层信息重叠或丢失,精准保留组织形态与RNA空间定位;UVC消毒与密封设计减少污染风险,为高灵敏度分析提供纯净样本基础。
免疫组化染色
防卷板与真空系统协同实现无褶皱平整切片,确保染色试剂均匀渗透;稳定的低温环境维持抗原活性,使抗体结合更精准,蛋白定位更清晰。
此外,徕卡系列通过模块化功能(如电动切片、LED照明)和人性化设计(高度调节、工具便捷存取),在提升切片效率的同时,为科研与诊断提供可重复的高质量数据支撑,赋能精准生命科学研究与临床决策。
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