氨基酸损失的主要过程包含如下几个方面：
胃肠道未被消化或吸收的氨基酸排泄 ；不可吸收的氨基酸(结构改变)随尿液排泄；胃肠道内源性氨基酸损失；体蛋白周转率：蛋白周转和消亡的过程；合成非蛋白质含氮物；吸收氨基酸的不可避免的分解代谢；过量供应或不平衡氨基酸的分解代谢；氨基酸的不可逆变化和尿中的损失：甲基化和羟基化。
提高蛋白消化率和氨基酸的吸收率是降低氨基酸损失的主要手段。
图1 影响蛋白质消化吸收的因素
01 抗营养因子
非淀粉多糖(NSP)
日粮中的非淀粉多糖会造成日粮整体消化吸收率的降低，主要机理包含如下几个方面：
增加食糜黏性降低内源性消化酶在食糜中的分散度，减低日粮消化率。
“笼蔽效应” ，包裹营养物质，降低其消化性;
增厚肠道粘液层，降低肠道对于营养物质的吸收效率，从而影响采食量。
玉米价格高涨，完美解决 NSP(小麦中的木聚糖，大麦中的葡聚糖，稻谷中的纤维素等)的危害是替代谷物使用中的关键一环。
对于乳仔猪，甘露聚糖和半乳糖苷应该得到特别的关注。
一方面，二者容易形成半乳甘露聚糖，而半乳甘露聚糖易造成免疫抑制；另一方面，半乳糖苷易造成仔猪胀气和腹泻。
图2 大豆中蛋白类抗营养因子及危害
02 日粮营养系统配制
低蛋白日粮是猪料无抗的重要手段，可以有效减少由于供应过剩而导致的额外氨基酸损失。
图3堪萨斯州立大学推荐猪只赖氨酸需求量
图3是堪萨斯州立大学推荐的猪只赖氨酸需求，根据方程我们可以估计猪只不同阶段的SID lysine合理设置，该设置与实际生产非常接近。
氨基酸的失衡和拮抗通常会引起小肠对氨基酸的竞争性吸收和转运，导致小肠损伤、代谢紊乱、大量释放有毒物质和采食量的降低。
03 肠道健康(菌群平衡、结构完整和免疫健全)
肠道健康是营养物质消化和吸收的基础。除了日粮和加工工艺的调整，主要为客户提供酸化剂、酶制剂、益生菌、植物精油和免疫调节剂等产品，来系统替代抗生素和保证动物的肠道健康。另外，牧场管理的差异和抗生素的取消使猪只对免疫的要求提高，从而提高猪只对部分氨基酸的需求增加，特别是对苏氨酸和色氨酸需求增加明显。
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