舆情周报|20万人数据表示，“狼吞虎咽”饮食习惯或对糖尿病发病有诱发作用

Nature子刊：DNA数据存储技术新突破迄今最大规模新生儿肠道菌群宏基因组学研究，人体内微生物与出生方式有关

《Nature》，研究人员纳入来自英国的596名足月儿（314名顺产和282名剖腹产）出生后4天、7天和21天的1679个粪便样本进行宏基因组分析，发现分娩方式是影响新生儿期（≤1月龄）和婴儿期肠道菌群组成的重要因素。顺产婴儿和剖宫产婴儿肠道菌不同，顺产儿肠道菌来源于母亲肠道，富集双歧杆菌、埃希氏菌、拟杆菌和副拟杆菌；剖腹产婴儿有较多的肠球菌、肠杆菌和克雷伯菌等医院环境相关机会致病菌，剖腹产婴儿持续缺少母亲传递的拟杆菌。母亲用抗生素和非母乳喂养对顺产婴儿也有相似影响但程度较轻。婴儿携带的机会致病菌存在毒力因子和抗生素耐药性，可能增加感染风险。（Nature）

自闭症转录组分析发现改变的基因调控网络

《Nature Neuroscience》，研究人员分析了226名1-4岁男性幼儿的血液白细胞转录组（其中119名患有ASD，其中107名具有典型发育），发现了1236个差异表达基因。通过将该调控网络叠加到BrainSpan Atlas的RNA测序数据上，发现网络富集了出生前和出生后早期在新皮层中高度表达的基因，这被认为是自闭症发展的关键时间点。但是，研究人员发现他们的网络中没有富含ASD风险基因。相反，他们的网络丰富了这些风险基因的调控靶标，研究人员指出，ASD风险基因可能会调控其网络，许多风险基因可能通过调节RAS–ERK，PI3K–AKT和WNT–β-catenin信号通路来影响网络。此外，还发现该网络中失调程度与幼儿中ASD症状的严重程度相关。这些结果表明，ASD的遗传异质性可能会失调核心网络，从而影响产前和产后早期年龄的大脑发育，从而影响后期ASD症状的严重程度。

https://www.nature.com/articles/s41593-019-0489-x

北京大学肿瘤医院：多吃维生素及大蒜或可降低胃癌死亡率

《British Medical Journal》，北京大学肿瘤医院研究人员纳入3365名胃癌高发地区的居民，2258名幽门螺旋杆菌阳性受试者随机分为4组：幽门螺旋杆菌治疗、补充维生素、大蒜、安慰剂；1107名幽门螺旋杆菌阴性受试者分为3组：补充维生素、大蒜、安慰剂。结果表明，在22年的随访期间，发生151例胃癌，94例因胃癌死亡病例；幽门螺旋杆菌治疗与补充维生素（而非补充大蒜）与胃癌发病率的降低显著相关。三种干预措施均与胃癌死亡率的降低显著相关，且与其它癌症及心血管疾病无显著关联。（热心肠研究院）

定期喝茶或能提高大脑认知能力

《Aging》，新加坡国立大学（NSU）研究人员一项研究发现，习惯性定期饮茶对大脑组织有积极影响，并可提高大脑功能和结构连接的效率。通过招募36名60岁以上的老年人，对其大脑区域进行磁共振成像检查并且记录他们的生活方式和心理健康数据，发现那些每周至少饮茶四次，不管是绿茶、乌龙茶还是红茶，坚持饮用25年以上的老人的认知能力更为出色。这表明：定期喝茶对大脑结构中与年龄相关的认知衰退相关区域有着保护作用。饮茶对大脑结构的积极贡献使网络组织更有效率。喝茶对预防(减缓)或改善认知能力下降是有效的，饮茶可能是一种简单的生活方式选择，有益于大脑健康。（生物探索）

近7万个细胞！Science：绘制人类肾脏免疫细胞图谱

《Science》，Wellcome Sanger研究所、剑桥大学和纽卡斯尔大学等联合团队利用10x Genomics单细胞RNA测序对来自14个成熟人类肾脏和6个胎儿肾脏进行研究，生成了人类肾脏细胞图谱，并绘制了器官免疫细胞图谱。基于成熟肾脏，获得了40,268个细胞，利用主成分分析将这些细胞分为四个主要的细胞区室：内皮细胞、免疫细胞、成纤维细胞和成肌纤维细胞，以及上皮细胞。此外，还分析了来自胎儿肾脏的单细胞转录组，获得了27,203个可注释的细胞，鉴定出免疫、内皮、正在发育的肾单位上皮和基质细胞簇。胎儿肾脏数据集鉴定了几个免疫细胞簇：最早的发育阶段存在巨噬细胞和一些树突状细胞（DC）；在受孕后九周开始出现单核细胞，T细胞和NK细胞，而在受孕后十二周开始出现B细胞。这些数据表明免疫细胞亚群在人类胎儿肾脏中存在不同的时间定位模式。常规bulk转录组数据同样显示了骨盆中免疫基因的最高表达，但胎儿肾脏上皮细胞中几乎没有免疫基因表达。在人类的前三个月中，以不同的时间模式在人类肾脏中建立了多种免疫细胞群，但它们与成熟的肾脏免疫细胞不同，在出生后获得了促进促炎和感染防御能力的转录程序。该研究为人类肾脏的免疫图谱分区以应对主要的免疫学挑战提供了全景概述。

https://science.sciencemag.org/content/365/6460/1461

微远基因正在开发基于CRISPR的结核病诊断

感染病原基因诊断初创公司Vision Medicals（微远基因）正在利用CRISPR作为诊断工具模型来开发一种新的结核病（TB）即时检验CRISPR-MTB检测。公司将其检测定位为Cepheid的GeneXpert（Xpert）MTB / RIF检测（被认为是活跃和耐药结核病测试的金标准，并被WHO推荐为对所有有结核病征兆和症状的人的初步诊断检测）的直接竞争对手。CRISPR-MTB检测诊断使用Cas12a核酸酶，该酶识别dsDNA作为激活剂并切割ssDNA。重要的是，当与DNA扩增步骤结合使用时，发现Cas12a可以灵敏地检测目标核酸分子。研究人员实验表明，该测定法可在10个检测中的10个中始终检测到每微升MTB DNA 5个拷贝，在10个检测中的6个中每µL可检测2个拷贝。这表明该测试具有接近单拷贝水平的超高灵敏度。（Genomeweb）

基因编辑公司启函生物获2550万美元A+轮融资

启函生物宣布完成2550万美元A+轮融资。本轮融资由招银国际资本领投，联想之星、鑫易生物、拔萃资本跟投，A轮投资方红杉资本中国基金、北极光等持续跟投。启函生物于2018年7月获得A轮融资，至此完成A轮总融资金额合计3300万美元。（启函生物）

FDA批准Exact Sciences的结直肠癌检测范围扩大到更为年轻人群

肠癌早筛龙头企业Exact Sciences表示，已获得美国FDA批准，将其Cologuard结直肠癌检测适应症扩大到45岁以上的中等风险人群（之前是针对50岁及以上人群进行检测），该扩展将为美国45岁至49岁之间的大约1900万中等风险个体提供使用Cologuard的选择。公司指出，2018年，美国癌症协会更新了大肠癌筛查指南，推荐无特殊风险人群应在45岁开始定期进行结直肠癌检查。

https://www.genomeweb.com/business-news/fda-expands-approval-exact-sciences-colorectal-cancer-test-younger-people#.XYlEjzCF7IU