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由于在一个特定的季节或一生中,公猪比母猪的后代要多得多,因此,从遗传观点上看,就整个猪来说,单个公猪比母猪更重要,而就1个后代来说,公猪和母猪同等重要。由于1头公猪在特定的时内能与多头母猪配种,因此公猪通常比母猪选择得更严格,而育种者用在优秀公猪身上的费用要比对同样优秀的母猪高。
长期以来有经验的养猪生产者深信女儿比儿子更像其父亲,而儿子更像其母亲。因此,母猪因为算儿子的优秀表现而身价倍增,而公猪因为其女儿们的优秀表现而获得好声誉。虽然这种说法有点言过其实,但这种现象可能由于性连锁遗传而存在,这可以这样理解;决定性别的基因由其中的一条染色体携带,而位于同一条染色体上的其他基因将与性别连锁或相连并与性一起传递给后代，由于性连锁,男性色盲比女性色盲的比例大,在家禽育种中,利用性别连锁性状在早期区别雏鸡的雌雄。当黑羽公鸡与芦花母鸡杂交时,所生后代中所有母鸡都是黑羽,所有公鸡都是芦花羽。然而必须强调的是,大部分情况下公猪和母猪对任何一个后代的影响是相同的,因此大多数育种者都力求种用家畜无论公、母均要有优秀的性能优先遗传。
优先遗传是指公猪或者母猪把它们自己的特性传递给后代的能力。例如,一个优先遗传的公猪其所有后代比一般的半同胞个体更像它们的父亲,彼此之间也比一般的半同胞个体更相像。对优先遗传进行检测的唯一方法是对后代的观察。从遗传角度来说,一个家畜是优先遗传个体,必须具备2个条件:(1)显性;(2)纯合性。得到1个或多个显性基因的每一个后代都表现出该显性基因所应表现出的特殊性状。而且,完全纯合的家畜会将相同的基因传递给其后代。尽管完全纯合的家畜很可能是不存在的,但是通过建立近交系来获得几乎完全纯合个体是可能的,而且这是唯一的一种产生完全纯合个体的方法。然而,相反的观点是,没有证据可以证明在1个动物个体身上表现出某种性状就能预测优先遗传的存在。具体来说,1头精力旺盛、肌肉发达的公猪比1头在这些方面相对逊色的公猪更有优先遗传的优势,这种说法是难以令人信服的，同时也需要强调确定优先遗传在动物育种中到底有多重要也是不大可能的,虽然过去很多公猪以优先遗传而著称。也许这些公猪是有优势的,但也有可能,它们的后代之所以表现出众是因为它们的交配母猪性能优秀。总之,可以说如果1头公猪或母猪拥有大量控制优势表型和性能的完全显性基因,并且又是纯合的,那么它的后代在表型上将与其父母极为相像,彼此之间也极为相像。但谁又能这样幸运真正地拥有这样1头猪呢?
如果某个组合的后代特别出色,并且在整体上优于它们的父母,育种者对此的解释是动物配合得好。例如,1头母猪与某一公猪交配后可产生优秀的后代,但是当与另一头有同样优点的公猪交配后后代却可能大失所望。甚至有时两头相当平庸的公、母猪交配后,产下的后代却无论表型还是性能都非常优秀。从遗传的角度来说,所谓成功的基因配合是来自双亲控制优良性状基因的正确组合的结果,虽然可能每个亲本缺少一些成为优秀个体的基因。换句话说,配合得好的家畜是因为它们的彼此互补的优良基因组合在了一起。家畜育种的历史就是按照推理将几个优势基因配合在一起的记录。然面由于好的基因配合纯属偶然,因此这样培育出的优秀个体要从育种的角度来仔细考察,因为这样育出的优秀个体是杂合子,这样的性状很难忠实地遗传给下一代。对家畜而言,家系是以品种为基础追溯公畜或者母畜一个家系的历史,不幸的是,家系的价值往往被夸大,显然,如果基础公猪或母猪往下延续了很多代,这个“家系的源头”的遗传优势由于一代一代的多次配种行为而依次递减,这样的话就没有理由认为这个家系比别的家系优越。如果育种者们特别重视某一数量较少的家系,这种情况就会更加严重,因为他们忽视了家系成员少的原因,在某些情况下这种结果是由于繁殖性能不佳或者存活率低而造成的。家系本身是很容易推测的。因此,家畜育种的历史经常遭受错误的家系选育的毁灭性打击,如以没有太多实际意义的家系作为选种的依据,幸运的是,养猪生产者对猪的家系没有达到其他某些家畜那样的痴迷程度。当然,某些近交家系确实有遗传学意义,此外,如果在相应的育种过程中再结合严格的选育,就会选育出许多优良的个体,那么这个家系就可能被大家所认同。
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