芯航｜分子之心获数亿A轮融资，世界级AI蛋白技术加速生物领域新基建- 大数跨境

芯航资本

2024-09-13

导读：构建生物经济基础设施，加速商业化进程

在生物经济智能化升级的浪潮中，业界领先的 AI 蛋白质设计平台公司分子之心宣布于近期完成 A 轮融资。本轮融资额达数亿元人民币，由谢诺投资、深创投联合领投，商汤国香资本、久奕投资跟投。作为具有行业标杆地位的 AI 生物大分子设计平台公司，分子之心本轮融资将进一步提速 AI 生物基础设施建设。

分子之心创始人、国际知名计算生物学家许锦波表示，本轮融资将用于进一步扩大顶级复合型人才团队，深入完善 AI 蛋白质基础大模型、AI 蛋白质优化设计平台 MoleculeOS 等生物经济共性技术平台，加速 AI 蛋白质技术的产业落地和商业化进程。“我们用 AI 设计超越自然进化的超级蛋白，并通过 AI 蛋白质基础设施建设，把蛋白质设计这一科学问题转变为‘可编程’、‘可预测’的工程问题。”

此外，分子之心还将探索从蛋白质元件设计到代谢通路设计、工艺优化等生物经济领域研发、生产全流程的系统性优化设计。

截至目前，分子之心累计完成3轮融资，过往投资方包括合成生物学龙头企业凯赛生物、红杉中国、百度 BV、联想创投等。

持续从0到1创新，锚定产业难题

研发全球领先 AI 蛋白技术

蛋白质是生物经济的核心物质基础，生物医药、生物制造等领域对于功能性蛋白质需求巨大，但从自然界发现具备理想功能的蛋白质难度极大。传统方法大多通过湿实验筛选，耗时长，成本高，且成功率低，严重制约了生物制药、生物制造等领域的高速发展。

分子之心基于全球领先的 AI 蛋白质技术，融合分子动力学、量子化学等科学计算方法，实现小样本、甚至零样本的蛋白质精准优化和设计，无需高通量筛选，仅需少量湿实验验证就可精准获得理想的蛋白质，极大提升抗体、酶、小蛋白、疫苗等各类型蛋白质性能优化和从头设计的效率及成功率。

作为 AI 蛋白质领域少有的具备从0到1创新能力的企业，分子之心在蛋白质动态结合设计等极具产业价值、但难度极高的领域拥有全球领先的技术实力和应用经验。蛋白质动态结合设计可解决酶活优化设计等应用难题，产业应用广泛，但由于难度极高，目前全球范围内尚无公开的成熟方法。行业中主流的 AlphaFold 等算法局限于蛋白质静态结构预测，对此问题束手无策。分子之心自研蛋白动态结合设计算法，有效规避了目前主流算法和大模型大量存在的假阳性问题，精度和成功率均处于领先水平。

截至目前，分子之心已自研十余项性能领先的 AI 蛋白质预测、优化、设计算法，如全球首个集成序列、结构、功能和进化的产业级 AI 蛋白质生成大模型 NewOrigin（达尔文）、精度超越 AlphaFold 3 的复合物结构预测算法，全球首创的可同时用于蛋白质侧链预测与序列设计的算法等，相关成果多次发表于 SCIENCE 杂志、美国科学院院刊等核心期刊，获得首届国际基础科学大会前沿突破奖等荣誉。诺奖基金会组织的“人类 3D 蛋白质组最新进展”研讨会上，许锦波是唯一一位中国大陆地区的嘉宾。

基于革命性的 AI 蛋白质设计技术，分子之心在酶活性优化设计、极端环境下蛋白质性能优化等高难产业问题上取得突破，并基于对蛋白质等生物元件设计的理解，对代谢通路、菌株构建、发酵工艺、放大工艺等生物反应流程的关键环节进行系统性优化设计。

在与头部医药公司联合优化其核心原料用酶的产业项目中，分子之心使用 AI 技术对一个功能极其复杂、分子量极大的酶进行设计。由于该酶达到表达系统极限，使用湿实验方法改造难度极高，全球范围内的公开报道中此前没有类似成功案例。分子之心基于 AI 从头设计了一个自然界不存在的新酶，在保留功能活性的同时将分子量减少了60%，突破了传统实验方法无法实现的多目标优化难题。

这些领先技术背后，是一支具有 AI 生物交叉背景与深厚产业经验的复合型人才团队。分子之心创始人许锦波教授在业界有“AI 蛋白质折叠奠基人”之誉，曾于2016年全球首次使用 AI 方法突破蛋白质结构预测这一世纪难题，其开辟的全新技术路线被 DeepMind 用于 AlphaFold 的开发，拉开了 AI 蛋白质结构预测、AI 蛋白质设计的帷幕。2022年，许锦波归国创立分子之心，吸引了一批来自 MIT、耶鲁、加州理工、清华、北大等顶尖高校及药明、诺维信、Meta、亚马逊、百度、阿里、字节、Discovery Studio 等头部公司的高端人才。在这支全球稀缺的顶级团队推进下，分子之心持续突破技术边界，为生物经济领域带来变革引擎。

构建生物经济基础设施

商业化进程加速

随着 AI 蛋白质技术创新和产业落地，分子之心商业化步伐持续迈进。2023年，合成生物学龙头企业凯赛生物战略投资分子之心，并将 AI 蛋白质技术引入研发体系。近期，凯赛生物董事长刘修才公布了双方合作的重要进展，在关键蛋白质优化上，“相对于野生菌，人工智能设计的一个重要酶蛋白结构使菌种产率提高了5倍”。

在更广阔的生物制造市场上，分子之心与医药、材料、化工、食品、农业等领域的头部企业达成深度合作，用 AI 蛋白质技术突破传统生物方法的局限，设计性能更优的超级酶，并赋能代谢通路设计、工艺优化等生物制造全流程。

在创新药领域，分子之心基于 AI 蛋白质设计技术自研细胞因子管线，在保持抑制肿瘤活性的同时，减毒（减少外周活性）数百倍，猴子耐受剂量达到同类管线的数十倍。在蛋白疫苗的设计项目中，分子之心同时针对蛋白疫苗的稳定性、表达量等进行多目标优化，经动物实验验证，疫苗产生中和抗体滴度为已公开专利和相关大型药企蛋白疫苗的数倍，突破相关疫苗稳定性专利。

更值得关注的是，这些产业项目中，AI 设计蛋白质只需3-4天，仅需少量湿实验验证，即可获得理想的候选分子。过往旷日持久的高通量湿实验筛选模式，正在向“精准设计+少量验证”转型，生物经济的底层模式正在新技术的驱动下升级。

为加速 AI 蛋白质设计技术的落地应用，分子之心自研了全球首个集成序列、结构、功能和进化的产业级 AI 蛋白质生成大模型 NewOrigin（达尔文），可针对产业应用需求在几小时内、甚至是分钟级“定制”具有特定功能的蛋白质，成功率高、普适性强、使用门槛低。同时，分子之心将 NewOrigin 大模型集成至一站式 AI 蛋白质预测、优化、设计平台 MoleculeOS 中，面向生物经济领域不同背景、不同需求的用户，提供 API、软件、解决方案、技术服务等多种形式的蛋白质设计工具和服务，通过搭建基础设施平台降低 AI 蛋白质技术的应用门槛。

全球首个功能完整的 AI 蛋白质预测、优化与设计平台 MoleculeOS

当前，生物经济被世界数十个国家列入战略领域，成为国际竞争的新焦点。全球市场持续爆发，核心的生物制药与生物制造的市场规模均已达到数千亿美元，生物制药市场的复合年增长率超过10%，生物制造市场更是以超过26%的复合年增长率快速扩张。在这场全球性的竞逐中，AI 蛋白技术正在成为重塑生物经济版图的革命性力量。

谢诺投资创始合伙人、投委会主席魏晓林：

“以 AlphaFold-2 为代表的基于 AI 的蛋白质结构预测是本世纪最重要、最震撼人心的科学进展之一，分子之心的创始人许锦波教授在这个领域有开创性的贡献。从蛋白质结构预测到蛋白质从头设计是更大的一步跨越，分子之心为此搭建了卓越的技术平台，并取得了不俗的进展。同时，分子之心团队在商业化方面效率高、学习快，落地准，从支持合成生物学到大分子药物发现，在多个领域都有快速的商业化落地进展。这些商业化工作反过来又推动分子之心的技术平台加速迭代和丰富。谢诺投资坚定相信科学和使命的力量，以 AI 造福人类、创造价值是触手可及的未来。我们很荣幸能够与分子之心这样优秀的团队为伴，共同开创未来。”

深创投健康产业投资部总经理周伊：

“智能化基础设施是加速合成生物产业发展的高效引擎。分子之心团队在 AI 蛋白质领域积累的数十年研发、应用经验，以及 AI 蛋白质大模型、产业应用平台，将为合成生物学产业发展夯实底层技术基础。期待下一阶段 AI 蛋白新技术与生物制造产业的融合与规模化爆发。”

商汤国香资本管理合伙人扈与同：

“分子之心在 AI 蛋白质优化设计的实践成果，展现了生成式 AI 在该领域的巨大潜力，有助于加速合成生物和制药产业的变革。基于商汤科技在 AI 大装置和大模型的综合优势，双方将共同探索 AI 技术在生物领域更广阔的创新空间。”

久奕资本合伙人：

“久奕专注于高科技领域。分子之心不仅是 AI 蛋白质设计技术的领军者，也在 AI 技术和生物制造的产业融合上树立了标杆。当下生物制造的变革尚处于初期，我们很高兴与世界一流团队合作，加速 AI 生物制造时代到来。”

芯航资本一直致力于打造“智能+生命科学”交叉科技的早期孵化器平台，专注于在生物科技领域寻找和培养初创型企业，驱动生命科学前沿领域的探索和创新。芯航聚焦生物创新药创新疗法、基因编辑、合成生物、AI 生物计算平台、脑机接口、生物芯片等方向，通过系统的、深度孵化的方法达成生物科技领域的突破创新，并为此构建了覆盖中美两地的投资网络，包括哈佛、MIT、斯坦福、卡耐基梅隆、清华、北大、科大等顶尖高校一流实验室与一流团队项目。着力吸引海外优秀学生回到国内开展创业，为中国生物科技的长远发展贡献顶尖且新鲜的力量。芯航希望，依托中国的学术与产业沃土，开启智能生命科学的大航海时代。

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