今天给大家解读一篇4月发表在《Emerging Microbes & Infections》上的题目为“Optimizing machine learning-based diagnosis of neurosyphilis in HIV-negative patients: a multicenter, real-world comparison of international diagnostic criteria.”的文章。本研究是一项多中心研究,旨在优化HIV阴性患者神经梅毒的机器学习诊断方法。研究团队根据六项国际诊断指南开发了相应的机器学习模型,并使用来自中国和美国的四个中心的真实世界数据进行了训练与外部验证。最终,研究将性能优异的模型集成到一个免费的在线工具中,为临床医生提供诊断决策支持。(请持续关注我们,每天为您解读最新见刊的文献!)想薅生信资料羊毛?直接在对话框回复 “资料”,免费领取干货大礼包!包括数据集、绘图代码、图表复现、思路总结、参考文献……0代码!鼠标点点点即可轻松完成5-10分生信SCI全文复现!
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团队成员合影(位于上海陆家嘴中心,可随时预约参观)
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题目:《在HIV阴性患者中优化基于机器学习的神经梅毒诊断:国际诊断标准的多中心真实世界比较》Optimizing machine learning-based diagnosis of neurosyphilis in HIV-negative patients: a multicenter, real-world comparison of international diagnostic criteria
发表期刊:Emerging Microbes & Infections
影响因子:7.5
研究背景:
神经梅毒在全球范围内持续上升,但其诊断仍然具有挑战性。传统诊断通常需要多学科专业知识和多种脑脊液检测,而在资源有限的环境中,这些检测难以获得。
研究思路:
- 数据收集
从四个中心(广州、北京、厦门、西雅图)收集了1648例疑似神经梅毒病例。 - 队列划分
以广州队列作为训练队列,其他三个中心的队列作为外部验证队列。 - 模型开发
针对六项国际诊断指南,使用随机搜索和三折交叉验证训练了五种机器学习算法(随机森林、Adaboost、SVC、NuSVC、XGboost)。 - 性能评估
使用AUC、PRAUC、校准曲线、决策曲线净收益、Brier评分和SHAP等多种指标全面评估模型的区分能力、校准度、临床效用和可解释性。
研究亮点:
-
模型性能优异:所有机器学习模型在不同指南下均表现出优秀的区分能力(AUC和PRAUC >0.90),并具有良好的校准性、可靠性和积极的临床实用性。 -
关键预测因子一致:无论模型或指南如何,神经系统症状、脑脊液蛋白和脑脊液白细胞计数始终是最强的预测因子。 -
实用工具开发:研究提供了一个免费、基于网络的工具,将模型操作化,为全球临床医生提供符合当地诊断标准的适应性决策支持。
研究结果:
- 预测因子
在所有模型和指南的分析中,神经系统症状、脑脊液蛋白和脑脊液白细胞计数 consistently ranked as the strongest predictors。 - 模型性能
所有模型均取得了优异的区分能力(AUC和PRAUC >0.90),并且具有良好的校准度、可靠性和积极的临床效用。不过,模型性能因所采用的诊断指南不同而存在 modestly 的差异。
研究总结:
-
研究发现,最优的机器学习诊断方法取决于所应用的诊断定义。这表明在开发和评估诊断模型时,必须明确其基于的诊断标准。 -
研究所开发的免费在线工具实现了这些模型,旨在为全球临床医生提供与当地诊断标准相适应的决策支持,有望帮助应对不同资源环境下的诊断挑战。
结果译文:
1. 队列特征
总之,本研究共纳入1648例HIV阴性梅毒感染者。其中,来自广州的659例作为开发队列,来自北京、厦门和西雅图的480例、493例和16例分别作为三个独立的外部验证队列。按6种诊断指南划分的四个队列的二分类结果见补充表S3。
2.特征重要性
3.不同ML模型的性能与比较
4.净收益
更多结果和补充图表:doi: 10.1080/22221751.2026.2648888
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