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2区4.1分!无人机高光谱+机器学习(RF/SVM/2D-CNN)智能识别城市森林优势树种:基于红边NDVI植被指数与RFECV特征选择,总体精度达86.91%

2区4.1分!无人机高光谱+机器学习(RF/SVM/2D-CNN)智能识别城市森林优势树种:基于红边NDVI植被指数与RFECV特征选择,总体精度达86.91% CNS生信新靶点挖掘
2026-05-26
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导读:城市森林树种精准分类是绿色空间管理与生态评估的关键,但树木空间分布破碎、光谱相似性高带来挑战。本研究利用无人机高光谱遥感影像(224波段,0.03m空间分辨率),提出一套智能分类流程!


城市森林树种精准分类是绿色空间管理与生态评估的关键,但树木空间分布破碎、光谱相似性高带来挑战。本研究利用无人机高光谱遥感影像(224波段,0.03m空间分辨率),提出一套智能分类流程:首先基于红边光谱分析,构建优化植被指数NDVI(680,748),在复杂城市环境中提取植被的总体精度达97.82%、Kappa 0.95;进而通过最小噪声分离(MNF)降维、灰度共生矩阵(GLCM)提取纹理特征,并采用递归特征消除交叉验证(RFECV)筛选出15个特征波段、7个植被指数和5个纹理特征。将融合特征输入随机森林(RF)、支持向量机(SVM)和二维卷积神经网络(2D-CNN)进行树种分类。结果表明,多特征融合RF模型效果最佳,总体精度86.91%、Kappa 0.85,相比仅用特征波段精度提升3.64%。该方法为城市林业资源调查、生态功能评估和智慧管理提供了高精度、可推广的技术方案。

今天给大家解读一篇4月发表在《iScience》上的题目为“Intelligent classification of dominant tree species in urban forests based on UAV hyperspectral remote sensing images.”的文章。这篇文章发表于2026年4月,主题是基于无人机高光谱遥感影像的城市森林优势树种智能分类。研究首先通过分析典型地物光谱特性,构建了优化的NDVI (680,748)指数用于精准提取植被。随后,从高光谱数据中提取了MNF变换后的特征波段、14种植被指数和基于GLCM的纹理特征,并利用RFECV方法进行特征选择。最后,设计了四种特征组合方案(全波段、特征波段、特征波段+植被指数、特征波段+植被指数+纹理特征),分别输入RF、SVM和2D-CNN模型进行树种分类。实验结果表明,融合多模态特征的RF模型取得了最优效果,OA达到86.91%,Kappa系数为0.85,验证了该方法在城市复杂环境中进行高精度树种识别的潜力。请持续关注我们,每天为您解读最新见刊的文献!)想薅生信资料羊毛?直接在对话框回复 “资料”,免费领取干货大礼包!包括数据集、绘图代码、图表复现、思路总结、参考文献……0代码!鼠标点点点即可轻松完成5-10分生信SCI全文复现!

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团队成员合影(位于上海陆家嘴中心,可随时预约参观)


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题目:《基于无人机高光谱遥感影像的城市森林优势树种智能分类Intelligent classification of dominant tree species in urban forests based on UAV hyperspectral remote sensing images

发表期刊:iScience

影响因子:4.1

研究背景


  1. 现实需求
    快速城市化使居民对生态环境的需求增加,城市森林(包括市内及周边以树木为主的森林生态系统)对缓解热岛效应、固碳、提供休闲空间等至关重要。获取准确的树种尺度的数据是城市绿化评估、管理和规划的关键。然而,城市树木分布高度碎片化、空间不均匀,科学有效地识别树种是核心挑战。
  2. 技术瓶颈
    卫星遥感受限于成本高、重访周期长、易受大气干扰等问题,难以满足城市精细化应用。而无人机遥感具有灵活性高、成本效益好、空间分辨率高等优势,成为理想工具。
  3. 研究空白
    尽管高光谱影像在树种分类方面已取得进展,但将其专门应用于城市森林树种识别的研究相对较少。特别是,不同分类算法和特征组合如何影响城市森林树种识别精度,有待系统研究。



                            CNSknowall 平台 Pubmed+AI 快速提炼全文要点

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                            研究思路:

                              1. 数据获取与预处理
                                利用无人机搭载高光谱相机获取研究区高分辨率影像,并进行辐射定标、几何校正、大气校正、镶嵌裁剪等预处理。同时进行地面样地调查,确定7种优势树种及其样本位置。
                              2. 植被提取
                                通过分析典型地物(植被、道路、建筑等)的光谱反射率曲线,利用红边区域(680-750 nm)的特性,采用系统性搜索策略构建了最优的双波段归一化植被指数NDVI (680,748),并确定最优阈值进行二值化,精准提取植被区域,生成植被掩膜。
                              3. 特征工程
                                • 特征提取
                                  对高光谱数据进行MNF变换,保留前30个特征波段;计算14种常用的植被指数;提取基于GLCM的8种纹理特征(经窗口大小优化后选用5×5窗口)。
                                • 特征选择
                                  使用RFECV方法对所有特征(特征波段、植被指数、纹理)进行递归筛选,剔除冗余特征,最终确定15个特征波段、7个植被指数和5个纹理特征为最优特征子集。
                              4. 模型构建与评估
                                设计四种特征组合方案,分别输入RF、SVM和2D-CNN模型进行训练。采用滑动窗口法生成样本,并进行数据增强(旋转)。使用混淆矩阵计算OA、Kappa、PA、UA等指标,系统比较不同方案和模型的表现。


                              研究亮点:

                                1. 开发了基于红边光谱特征的NDVI (680,748)植被指数
                                  该指数在城市环境中显著提升了植被提取的精度,总体精度达到97.82%,Kappa系数为0.95。
                                2. 采用RFECV方法选择关键特征
                                  以最大化树种识别的准确性,有效降低了特征冗余。
                                3. 系统评估了不同算法和特征组合对分类结果的影响
                                  证实了多模态特征融合策略的有效性。
                                4. 为城市森林监测和城市规划提供了可扩展的技术支持


                                研究结果:

                                  1. 植被提取结果
                                    新构建的NDVI (680,748)指数表现最佳,总体精度达到97.82%,Kappa系数为0.95。相比之下,其他常用指数(如EVI、SVI等)存在不同程度的植被“过提取”或“欠提取”问题,尤其是在篮球场、彩色建筑物等非植被地物上出现误判。这表明该优化指数在城市环境中具有更强的鲁棒性。
                                  2. 树种分类结果
                                      • 最优方案
                                        在所有方案中,采用 “MNF变换特征 + 植被指数 + 纹理特征” 输入 随机森林(RF) 分类器获得了最高的分类性能,在测试集上总体精度达到86.91%**,Kappa系数为0.85**。
                                      • 特征组合影响
                                        仅使用特征波段时,RF表现优于SVM,OA为83.27%。
                                        加入植被指数后,RF和SVM的OA分别提升2.39%和0.96%,表明植被指数增强了分类能力。
                                        进一步加入纹理特征后,RF和SVM的OA分别再提升1.25%和3.18%,证实纹理信息作为光谱信息的补充,对区分光谱相似但结构不同的树种至关重要。
                                      • 模型对比
                                        基于多模态特征的RF模型显著优于SVM(OA=84.31%)和仅基于特征波段的2D-CNN模型(OA=85.55%)。这表明在样本集相同的情况下,模型性能很大程度上依赖于所提供的特征信息。
                                      • 树种分类难点
                                        樟树的分类精度最低(UA=65.97%,PA=53.28%),主要原因是其光谱特征与其他树种相似,且样本数量在增强后仍存在不平衡问题。


                                    研究总结:


                                    结论

                                    1. 特征波段是树种分类的基础
                                      植被指数和纹理特征的加入能有效提升整体分类精度。
                                    2. 识别7种优势树种的最优方案
                                      采用多特征集(特征波段+植被指数+纹理特征)输入RF模型,OA达86.91%,Kappa系数0.85,实现了高精度城市优势树种分布制图。模型性能高度依赖于所提供特征信息的质量。
                                    3. 本研究开发的NDVI (680,748)指数
                                      在植被提取方面的表现优于其他传统植被指数,有效抑制了城市典型地物的光谱干扰。

                                    讨论

                                    • 方法论价值
                                      本研究证明了通过系统搜索红边区域构建优化植被指数,并结合多模态特征与RFECV特征选择,能显著提升城市森林树种分类精度,为高精度城市森林制图和可持续管理提供了技术支撑。
                                    • 实际应用
                                      该方法可用于生成详细的树木空间分布图,并支持对树木生长、胁迫响应和健康状态的监测,为城市绿地规划、生态功能评估和病虫害预警等提供关键数据。
                                    • 研究局限性
                                      1. 单时相数据
                                        研究仅使用了单时相的遥感数据,限制了结果的泛化能力。多时相数据通常能提供更优的识别结果,需进一步研究不同环境条件下树种光谱的变化。
                                      2. 数据源单一
                                        研究仅依赖无人机高光谱数据,未融合多源遥感数据(如LiDAR数据),后者可提供互补的结构信息。未来研究应整合多源数据以提高分类的稳健性和精度。
                                      3. 固定窗口问题
                                        纹理特征提取时使用了固定的5×5窗口,对于冠幅差异较大的树种(如冠幅广阔的朴树和冠幅紧凑的枇杷树),可能无法完全代表其冠层结构,导致部分树种分类精度下降。






                                    结果译文:

                                    1.实验环境与流程


                                    实验配置包括一台联想ThinkSystem SR650服务器,配备双英特尔至强金牌5117处理器、256 GB的2666 MHz DDR4内存和一块32 GB的NVIDIA Tesla V100 GPU。所用软件包括Python 3.12、ENVI 6.1和ArcGIS 10.8。高光谱相机的关键参数见表1。
                                    实验流程包括以下步骤(图2):(1)对高光谱数据进行光谱分析,选择用于构建植被指数的波段(图3),并与常见指数对比评估植被提取效果。(2)特征提取,包括特征波段、植被指数(表2)和纹理特征(表3)。(3)使用RFECV进行特征选择,基于模型贡献迭代去除最不重要的特征(图4)。(4)使用SVM、RF和2D-CNN模型进行树种分类,并在测试集上评估和比较(表4)。

                                    2.植被提取与精度评估


                                    为精确评估植被指数从无人机高光谱影像中提取植被的能力,本研究采用基于阈值的分类方法生成植被图像,并将其与常用植被指数(如EVI、GNDVI、NDVI、SVI、NDVI(705,750)和NDVI(680,748))进行比较,如表5所示,以确定每个植被指数的最佳分类阈值。为公平比较各植被指数的性能,我们在[0, 0.8]区间内以0.01为步长遍历所有阈值,计算每个阈值的分类结果。最终,基于综合评估指标(总体精度和Kappa系数各占50%权重)选择每个植被指数的最佳阈值,如表6所示。在二值植被图像中,绿色像素表示植被区域,非植被区域用黑色表示,以直观展示植被信息提取结果。此外,在研究区内选取四个代表不同地物类型的目标区域进行对比分析,包括阴影区、建筑区、屋顶、篮球场以及草坪和灌木区。不同植被指数下的植被信息提取结果如图5所示。
                                    图5中各植被指数的二值图像为评估植被提取精度提供了直观参考。在图5A中,除NDVI(680,748)外,其他所有植被指数都不同程度地将篮球场误分为植被。在图5B中,SVI和EVI将白色和橙红色建筑误分为植被,而GNDVI仅将橙红色建筑误分为植被。在图5C中,所有植被指数均未将阴影误分为植被;但EVI将白色地面误分为植被,SVI在阴影区域的植被提取效果较差。在图5E中,SVI未能提取阴影区域的植被,而EVI将白色地面和部分建筑误分为植被。
                                    为了定量评估各植被指数的精度,本研究使用混淆矩阵方法在实验区评估其精度,如表7所示。
                                    如表7所示,所有植被指数都表现出不同程度的植被提取能力。在这些指数中,NDVI(680,748)取得了最高的总体精度和Kappa系数。GNDVI、NDVI和NDVI(705,750)也表现出良好的植被提取性能。然而,EVI的非植被生产者精度和植被用户精度均较低,表明它将大量非植被区域误分为植被。同时其植被用户精度也低,意味着被分类为植被的像素实际上包含了相当多的非植被地物。总体而言,这反映出植被过度提取的趋势。相反,SVI的植被生产者精度较低,反映出大量植被像素被遗漏;其非植被用户精度也低,即被分类为非植被的像素含有大量植被污染。总体来看,SVI的植被提取不足。

                                    3.树种分类实验


                                    在本研究中,提取了三组不同的特征变量以评估它们在树种分类任务中的有效性。为系统评估不同特征和分类器对树种分类性能的影响,设计了四种方案:全波段、特征波段、特征波段+植被指数、特征波段+植被指数+纹理特征,分别结合RF、SVM分类和2D-CNN,如表8所示。


                                    4.树种分类精度分析


                                    本研究系统比较了九种识别方案在验证集上的性能。结果表明,将MNF变换后特征、植被指数和纹理特征输入RF分类器的方案取得了最优分类性能,总体精度为86.91%。相比之下,仅使用MNF变换后特征时,RF和SVM的分类精度分别为83.27%和80.17%。当直接使用所有原始光谱波段时,两种方法的精度分别降至74.62%和75.03%。总体而言,基于RF的多特征融合方法显著优于单特征或全波段方法。此外,通过MNF降维后的特征集显示出比全波段方法更高的分类潜力,表明特征选择和组合在提升模型性能中起着关键作用。各方法的详细精度结果见表9,基于高光谱图像的树种分类结果见图6。

                                    5.特征组合对城市树种分类精度的影响


                                    当仅基于特征波段进行分类时,分析两类分类器的分类结果显示,RF分类器在验证集上表现最佳,总体精度为83.27%,Kappa系数为0.80。如实验结果S4所示,在RF分类器下,用户精度最低的树种是樟树,用户精度仅为65.97%,其次是乌桕和桂花,用户精度分别为80.32%和73.37%。这表明在RF分类器中,樟树、乌桕和桂花存在严重的误分类问题。此外,在实验结果S3中,樟树的生产者精度最低,仅为53.28%,表明漏分严重。误分的潜在原因在于这些树种具有相似的光谱特征,使其难以与其他类别区分。此外,存在类别不平衡问题,数据增强后樟树样本数量超过其他类别,导致大量样本被误分类。相比之下,朴树、广玉兰和松树的分类精度相对较好,表明分类器对这些树种具有较好的识别能力。
                                    总之,光谱特征在优势树种分类中起着重要作用。然而,当树种具有相似的光谱特征时,会导致严重的误分和漏分。这种相似性使得许多样本被错误分类或遗漏。
                                    加入植被指数对分类精度有显著影响。两种分类方法的总体分类精度均有显著提高。具体而言,RF的总体分类精度提升了2.39%(从83.27%到85.66%),Kappa系数提高了0.03(从0.80到0.83);SVM的总体分类精度提升了0.96%(从80.17%到81.13%),Kappa系数提高了0.01(从0.78到0.79)。大多数树种的精度有不同程度的提升,而少数树种的精度有所下降。例如,在RF分类器中,乌桕的生产者精度下降了0.56%。这可能是因为植物生长旺盛,大多数树种呈深绿色,叶绿素含量高。在此阶段,植被指??对植被变化极为敏感。然而,在完全郁闭条件下,树木冠层闭合度高,树木阴影、林隙等因素也可能影响叶片在植被指数中的表现。这些因素可能导致植被指数的变异性增加,以及树种间均值的显著差异。
                                    加入纹理特征显著影响分类精度。两种分类模型的总体分类精度均有显著变化。具体而言,RF的总体分类精度提升了1.25%,Kappa系数提高了0.02;SVM的总体分类精度提升了3.18%,Kappa系数也提高了0.03。
                                    如表9所示,加入纹理特征后总体精度显著提高,但某些树种的分类精度有所下降。例如,在RF模型中,枇杷树的用户精度和生产者精度均有一定程度下降。在SVM模型中,朴树的用户精度下降了3.79%。总之,纹理特征对城市森林树种识别具有重要影响。在城市环境中,纹理特征的引入在树种分类模型中起着至关重要的作用。纹理特征的加入显著改变了城市森林树种的总体分类精度。然而,不同树种对纹理特征的响应存在差异。这可能是因为不同树种的冠幅大小不同,而本研究使用固定的5×5窗口提取纹理特征。例如,朴树的树冠通常宽大且自然圆润,叶片密度不均匀,冠幅较大,其边缘结构更复杂。在5×5固定窗口下,提取的纹理特征不能完全代表整体冠层结构。相比之下,枇杷树冠幅较小,叶片大而革质且光滑,导致窗口超出冠层边界,从而提取了过多冠层周围的背景信息。
                                    S9方案(仅使用特征波段的2D-CNN)在分类中未加入纹理或植被指数特征,仅依赖从原始高光谱数据中选出的光谱波段。与使用多特征的S8方案相比,总体精度下降了0.36%,Kappa系数下降了0.01。这表明多特征组合弥补了机器学习模型自身学习能力的局限,而2D-CNN模型在特征集有限时并未展现出其优势。这表明在树种分类任务中,在相同样本集下,模型性能在很大程度上取决于所提供的特征信息。

                                    更多结果和补充图表:doi:  10.1016/j.isci.2026.115633






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