近期，咨询网药的朋友是真多啊，难道是国自然提交日期定了，大家准备最后一搏？不管是因为啥，小记者现在脑子里都是找新思路、找新思路、找新思路···~
功夫不负有心人，新思路是找到了，但它看起来一点也不正宗，是网络药理学但研究目标又不是药，而是肠道菌群代谢物，够新吧？是不是没见过这种思路？老实说，小记者也是头回见。来吧！这就是我们苦苦寻找的突围思路了，突破内卷效果杠杠的，一起来看看怎么做的吧！
这篇文章由上海中医药大学附属第七人民医院团队发表，利用网药方法阐明糖尿病背景下微生物群、代谢物和靶标之间的关系，整体思路设计为常规网药分析+药物相似性和毒性评价，思路相较于传统网药也有升级，添加了ADME分析，创新性也有所提升；研究目标从传统的药物（尤其是中医药）换成了肠道微生物代谢物，新颖性十足，这也是能发纯生信的关键因素，另外，这里用到了一个可以获取肠道微生物和代谢物信息的gutMGene数据库，想做这个方向的朋友可以去看看，比直接分析16S或宏基因组数据可以简单多了！整个文章一点测序和实验都没有，全部用的是公共数据和在线分析平台，发文2个多月就接受，速度相当快！网药能发纯生信的机会可不多，并且还加上了肠道菌群热点，热度和创新性都大幅提升，小记者可以预见这个新思路会很抢手，所以赶快换个疾病去复现吧~
网药想发纯生信？老套路是行不通啦！找新思路，小记者很在行，朋友们只需跟着小记者的推荐走，发文直接不用愁！看到新思路不知道怎么复现？直接联系小记者吧，咱们团队个性化思路设计、生信分析都能做，十年经验，定能让您满意而归！
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题目：利用网络药理学阐明肠道微生物代谢产物在糖尿病中的作用
杂志：Molecular Medicine（IF=6）
发表日期：2024年12月
研究背景
大量研究强调了保持肠道微生物群的多样性和平衡对于人类健康（包括糖尿病）的重要性。然而，肠道微生物群的代谢物和靶标发挥作用的精确机制在很大程度上仍未被探索。
数据来源和分析工具
研究思路
图1：研究流程图
主要结果
1. 从公共数据库收集了685个肠道微生物代谢物靶点、224种人类肠道靶标和5930个糖尿病相关靶点，分步取交集后，识别到48个肠道菌群代谢产物调节糖尿病的靶点，随后建立肠道-靶标-糖尿病网络
图2：肠道菌群代谢产物调节糖尿病的靶点鉴定
2. PPI网络分析确定，IL6、AKT1和PPARG作为糖尿病治疗的核心靶点
图3：PPI网络分析
3. GO分析显示，肠道微生物群代谢物主要调节氧化应激、炎症和细胞增殖。KEGG分析结果表明，IL-17、PI3K/AKT、HIF-1和VEGF是参与糖尿病的主要信号通路。
图4：GO分析
图5：KEGG分析
4. 分别通过SwissAMDE平台和ADMETlab平台测量已确定的关键代谢物的药物相似性和毒性，结果显示代谢产物如丁酸盐、乙酸盐和丙酸盐对肠道健康有益
表2：关键代谢物的类药性评价
表3、4：关键代谢物的毒性评价
5. 通过构建MSMT综合网络，发现三个核心靶点通过与8种代谢产物、3种底物和5种肠道微生物群的相互作用而对糖尿病产生治疗作用
图6：微生物群-底物-代谢物-靶标网络构建
小结
这篇非正宗的网药文章，选取的肠道微生物代谢物研究目标的创新性很高，直接冲破了中医药网药的内卷困境！分析整体还是很简单的，在传统网药分析上添加了一步ADME分析，有亮点又好复现，整体设计有热度有新颖度，这不就是咱们要找的订好新思路嘛，想用用纯生信快速发一篇网药的朋友，这个创新思路很适合你，换个疾病就能复现（建议优先找代谢相关疾病）。中医药生信发文思路花样翻新，建议紧跟小记者脚步，获得第一手消息！想做个性化生信分析和思路设计？需要生信服务器？欢迎随时联系小记者！专业团队为你保驾护航，1V1定制创新思路！
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