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IF23.5|从“棕榈酰化”研究铁死亡,中山大学这个思路好!再加上“分子对接+虚拟筛选+SPR”,Nature子刊当之无愧!

IF23.5|从“棕榈酰化”研究铁死亡,中山大学这个思路好!再加上“分子对接+虚拟筛选+SPR”,Nature子刊当之无愧! 生信日报
2025-06-11
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咚咚咚~看看小记者今天发现了什么好文!小记者看到这篇文章的时候,真的只有一味赞叹,选题上都是大热点—经典铁死亡+新贵棕榈酰化就算了,思路上也是亮点满满,药物高效筛选技术“虚拟筛选+分子对接+SPR”,这不就是最咱们临床医生最爱的方法吗?话不多说,跟着小记者来看看~

这篇文章是中山大学近期发表在Nature子刊Nat Cancer上的题为:Palmitoylation of GPX4 via the targetable ZDHHC8 determines ferroptosis sensitivity and antitumor immunity的论文,以往研究多集中在铁死亡的上游调节因子(如SLC7A11)和下游效应分子(如GPX4),而对GPX4的翻译后修饰(棕榈酰化)的研究相对较少。选题还是比较有新意的。在方法上:通过虚拟筛选约220000种小分子化合物,结合分子对接分析,为发现新的药物靶点和药物候选物提供了高效的技术平台,显著提高了药物发现的效率;利用SPR技术精确测量PF-670462与zDHHC8的结合亲和力,提供了精确的定量数据,有助于优化药物设计和评估药物的特异性。

你以为这就结束了!错!研究进一步提出了铁死亡与免疫疗法的协同治疗策略,为临床应用提供了新的思路!朋友们,这篇文章的药物筛选可太高效了,结合国自然热点,思路不就来了!你还在天天泡在实验室看不到头吗?好方法就要用起来吧!感兴趣的话快戳下方找小记者先帮你免费评估思路~

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杂志:Nat Cancer

发表时间20254

研究背景

最近,越来越多的证据表明,抗肿瘤免疫应答可以通过各种脂质衍生的翻译后修饰(PTM)进行调节,包括S-棕榈酰化是一种可逆的脂质-蛋白修饰然而,在癌症免疫治疗过程中,肿瘤细胞的铁细胞增多症是否受S-棕榈酰化的调节仍很不清楚。

机制图解

主要结果

1.探索铁死亡的调控机制

通过小分子化合物筛选实验,作者发现2-BP这种棕榈酰化抑制剂可显著提高肿瘤细胞对铁死亡的敏感性。后续采用ABE技术和点击化学方法分析证实,GPX4是棕榈酰化的作用靶点,其关键的棕榈酰化修饰位点位于Cys75。

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2.鉴定关键的棕榈酰化酶

对全部zDHHC家族成员展开筛选后,确定zDHHC8是GPX4的主要棕榈酰化酶。借助co - IP实验以及分子对接分析,进一步验证了zDHHC8和GPX4之间存在相互作用,而且zDHHC8的催化活性对于GPX4的棕榈酰化起着关键作用。

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3.探索zDHHC8-GPX4轴在铁死亡中的作用

运用基因敲除(KO)与基因敲低(KD)实验,结果表明 zDHHC8 缺失会让肿瘤细胞对铁死亡诱导剂(像 RSL3、ML162 和 IKE)的敏感性大幅提升。此外,借助患者来源的类器官实验,对 zDHHC8 在肿瘤中的作用进行了验证。 

4.探索zDHHC8在肿瘤免疫中的作用

分析 TCGA 公共数据库数据后发现,zDHHC8 在多种肿瘤里呈现高表达状态,而且它的表达情况和 CD8 + 细胞毒性 T 细胞的浸润程度呈负相关。开展体内实验后表明,zDHHC8 缺失能显著促进 CD8 + T 细胞的浸润,同时抑制肿瘤生长。

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5.发现并验证zDHHC8的小分子抑制剂

经虚拟筛选与分子对接分析,发现 PF - 670462 能够特异性地结合 zDHHC8,促使其发生降解,从而减少 GPX4 的棕榈酰化。体外和体内实验均验证,PF - 670462 可增强肿瘤细胞对铁死亡的敏感性。并且,当 PF - 670462 与抗 PD - 1 免疫疗法联合使用时,能显著抑制肿瘤生长,延长生存期。

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文章小结

总之,作者的研究确定了死亡的调节机制,涉及靶向GPX 4进行棕榈酰化,并揭示了zDHHC 8-GPX 4轴的小分子抑制是改善癌症免疫治疗的有希望的治疗策略。双热点强强联合,23.5分Nature大子刊这不就来了吗?想做这方面研究的,滴滴小记者,免费评估最适合你的疾病课题~更有全方位的思路设计,生信分析,生信服务器!面面俱到,只等你来~


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