朋友们，单细胞主题又来咯~
说到单细胞分析领域的大佬，小记者认为非“张泽民”院士莫属了！张泽民院士利用单细胞时空多组学技术已发表30多篇顶刊文章，其中不乏CNS主刊文章，主要聚焦肿瘤微环境不同细胞类型图谱，包含免疫细胞（T细胞、B细胞、NK细胞等）和基质细胞（成纤维细胞、内皮细胞等）···
（图源：迈维代谢，侵删）
不过这还不是小记者今天分享的重点，张泽民院士的CNS文章大部分都会用到单细胞自测数据，小记者刚发现了一个跟张泽民院士做的一系列“泛癌X细胞图谱”研究思路很类似的文章，（重点来了）但全用的单细胞公共数据分析，聚焦泛癌成纤维细胞，运用73个队列发表了Sci. Adv！该文章来自哈医大顾云燕教授团队，这也是个生信科研天团，很牛！下面咱们就来对比看看这两篇泛癌成纤维细胞分析文章~
大佬团队发CNS，咱们学会思路，用公共数据也能冲一冲10分+，朋友们行动起来吧！大规模单细胞分析难度高一些，自己搞不定的可以找小记者帮忙！做课题没想法？想实践没条件？小记者等你召唤！创新思路设计、个性化生信分析方案定制、生信服务器租赁，你所需的服务我应有尽有，欢迎来询~
第一篇：Cancer Cell，张泽民院士团队
题目：跨组织人类成纤维细胞图谱揭示在免疫调节中具有不同作用的肌成纤维细胞亚型
发表时间：2024年10月
方法技术：单细胞转录组测序、空间转录组测序、bulk转录组测序、多重免疫组化、RT-qPCR
自测样本：38名癌症患者样本（癌/癌旁组织）
公共数据： 整合30个公开的成纤维细胞scRNA-seq数据集，包含11种组织和43种健康/疾病状况的517份人类样本
研究内容和结果：首先构建了跨越不同组织和病理状态的成纤维细胞scRNA-seq图谱，不仅鉴定出20种成纤维细胞亚型，还揭示了其中4类具有独特表型的肌成纤维细胞亚型。然后利用空间转录组、多重免疫组化进一步阐明了肌成纤维细胞在肿瘤微环境中的独特免疫调控功能，为肿瘤微环境特异性靶向治疗策略的开发提供了全新的视角和思路。（大规模单细胞分析数据处理太慢？那是没用上带GPU的生信服务器，有需要可联系小记者，用它给你的分析提提速吧！）
第二篇：Science Advances，哈医大顾云燕团队
题目：成纤维细胞图谱:组织间共有和特异的细胞类型
发表时间：2025年4月
方法技术：单细胞转录组分析、多重免疫荧光组化
自测样本：无
公共数据： 整合73个scRNA-seq数据集，获得了1116份样本，涉及10种组织和4种不同的样本类型，包括正常、邻近、肿瘤和转移样本
研究内容和结果：首先构建了一个全面的人类成纤维细胞图谱，鉴定和定义了18种成纤维细胞亚型，并且描述了所有以前建立的主要成纤维细胞亚型，还鉴定了一种以前未识别的、与表观遗传修饰相关的普遍存在的成纤维细胞亚型——，TSPAN8+染色质重塑成纤维细胞，其特征是TSPAN8、GATAD1、MDM2和VEGFA的高表达，以及显著的组蛋白修饰和染色质重塑富集。这种亚型在空间转录组（ST）数据中倾向于与内皮细胞共定位，主要通过配体VEGFA和受体F2R与内皮细胞和T细胞相互作用，其存在与预后不良相关。
成纤维细胞跨组织单细胞图谱的构建
成纤维细胞亚型的转录组异质性
TSPAN8+染色质重塑成纤维细胞的鉴定
成纤维细胞亚型的分化状态
年龄与成纤维细胞亚型细胞衰老的相关性
成纤维细胞亚型的细胞间相互作用
TSPAN8+染色质重塑成纤维细胞的临床意义
小结
“单细胞图谱研究肿瘤微环境细胞异质性”这个赛道真是强的可怕，有张泽民院士团队在打头阵，咱们只要学会它的研究思路，只用公共数据也能发个很不错的文章，就像这篇哈医大的文章，10分+根本不在话下，想冲高分的朋友可以参考复现！其中涉及到大规模单细胞数据处理和分析，分析难度稍高，有需要可以找小记者帮忙分析。思路设计有难度？选题方向搞不定拿不准？想不费力的发高分文章？找小记者！专业的思路设计和生信分析团队为您提供1V1的方案定制服务，有需要随时联系~
小记者话生信
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