小记者前几天刷到个帖子说一个高校研究生英语考试中，很多人都不知道TCM是什么···
这···搁药学相关专业毕业的小记者来看，非生物医学专业的不知道情有可原，但如果是相关专业同学也不会就多少有点离谱了，看来咱们中医药的传播和研究还任重而道远啊！
书归正传，咱们生物医学科研圈里的朋友应该都知道中医药研究有多火爆了吧，关键是有国家大力扶持，跟着政策走，不会出错哟，今天小记者还是准备了个中医药网药的热门思路，比较容易实践和复现，大家都行动起来吧，助推一下咱们的中医药研究，刚好也可以趁着热度发一篇生信傍身，一举两得！
1. 选题：该文章的研究目标是药食同源的“益智仁”，在高尿酸血症中有一些研究但其药效机制研究较少，所以此选题有一定的创新性和研究价值；
2. 思路设计：文章设计为网药+分子对接+分子动力学模拟+体外简单实验的热门思路，在常规生信方法上添加了“分子动力学模拟”这个新技术，提高了创新性，大部分是生信分析，比较好复制。另外，Nutrients这个杂志的选择也不错，审稿快，要求也没那么高，中科院2区4.8分，这篇仅24天就接受了，超值啊！着急见刊的朋友可以尝试一下~
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题目：益智仁抗高尿酸血症的潜在机制: 整合网络药理学、分子对接、分子动力学模拟和体外实验
杂志：Nutrients（IF=4.8）
发表日期：2024年12月
研究背景
高尿酸血症(HUA)是一种由人体内嘌呤代谢增加、尿酸(UA)水平升高或排泄障碍引起的代谢性疾病。益智仁（AOF）是一种具有改善高尿酸血症潜力的药食两用资源，但其作用机制有待进一步研究。
研究思路
首先从TCMSP和SwissTargetPrediction数据库收集益智仁的活性成分和对应的靶点，然后从GeneCards数据库中收集HUA相关靶点，与益智仁成分靶点取交集，获得共同靶点，构建PPI网络并进行KEGG和GO富集分析。对AOF的关键活性成分和核心靶标进行分子对接分析，随后通过分子动力学模拟进一步确定了核心活性成分与核心目标蛋白之间复合物的稳定性。最后利用体外细胞实验验证AOF核心活性成分的抗HUA作用。
图1：研究流程图
主要结果
1. 从TCMSP和SwissTargetPrediction数据库中筛选出4种AOF主要活性成分的276个靶标
图2：AOF活性成分相关靶点的鉴定
2. 从GeneCards数据库筛选到928个HUA相关的靶标，与AOF靶标取交集后得到46个AOF抗HUA潜在靶标
图3：AOF抗HUA潜在靶标的获得
3. 针对以上靶点构建了AOF抗HUA药效靶点-有效成分-疾病网络，并利用PPI网络识别到4个核心靶点
图4：药效靶点-有效成分-疾病网络
图5：PPI网络
4. 对46个靶点的GO和KEGG分析显示，这些靶点富集于有190个生物过程、24个细胞成分、42个分子功能和44个KEGG信号通路
图6：GO分析
图7：KEGG富集分析
5. 对4个AOF活性成分和4个核心靶标进行分子对接分析，发现AOF的主要活性成分可能通过与包括PPARG、ESR1、PTGS2和HMGCR在内的靶标结合，对HUA引起的免疫系统障碍和炎症具有潜在的治疗作用
图8：分子对接
6. 分子动力学模拟进一步确定了豆甾醇和核心靶蛋白之间相互作用的稳定性
图9：分子动力学模拟
7. 细胞实验结果表明， AOF核心活性成分豆甾醇通过显著上调ESR1和PPARG的表达水平发挥抗HUA作用
图10：豆甾醇对HK-2细胞的毒性和抗HUA作用
图11：豆甾醇通过调节ESR1和PPARG促进尿酸排泄而发挥抗HUA作用
小结
这篇文章内容算是比较简单的了，药食同源方向的选择有一定的创新性，常规分析中添加“分子动力学模拟”也是一个亮点，其余网药分析和实验部分都非常简单，比较容易模仿复现，做中药方向的朋友不妨试试这个方法，性价比很高！另外，Nutrients这个杂志也可以关注一下，还是很适合毕业投稿的。中医药创新思路花样翻新，建议紧跟小记者脚步，获得第一手思路！想复现这个联合思路或者做个性化生信分析和思路设计？欢迎随时联系小记者！专业团队为你保驾护航，1V1定制创新思路！
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