近年来大家对网络药理学的文章是屡见不鲜了，传统打法就是：提取药物目标基因-筛选疾病相关靶点-共同靶点蛋白互作-各类富集分析-最后再来个分子对接就打完收工！想就这样短平快的发文，现在是基本不可能了，那网药课题还能怎么搞？
创新思路大放送来啦~朋友们，点个关注速速收藏吧~
① 通过网药加分子对接预测药物的作用靶点和机制，最后通过实验进一步验证（简单直接堵上审稿人的嘴，不耽误咋投稿进度~）；
② 先通过网络药理学预测药物治疗疾病的关键靶点，再通过分子对接揭示药物与关键靶标的相互作用，最后通过分子动力学和实验进一步验证（加上了分子动力学这一大亮点，闪瞎审稿人的双眼~对了顺嘴一提，分子动力学模拟等计算量大的分析肯定是需要服务器的，有需要的朋友来找小记者哈，也可戳这里了解咋服务器具体详情~）；
③ 采用UHPLC-Q-TOF-MS/MS（或UPLC-Q-Exactive Orbitrap-MS）技术对药物的成分进行定性分析，然后用网药预测药物的作用靶点、潜在的信号转导通路，最后通过实验进一步验证（成分定性分析的相关文章小记者已经分享过很多了，还不了解的朋友往前翻翻哈~）；
④ 通过运用层次分析-熵权法（AHP-EWM）、建立某药物的指纹图谱，并结合网络药理学分析，预测药物中的质量标志物（Q-marker）（有没有觉得眼前一亮，趁着发文还少，朋友们用起来）；
⑤ 先通过实验验证药物治疗疾病有效，然后用网药加分子对接预测药物的作用靶点、潜在信号转导通路，最后用Western blot/qRT-PCR实验对核心靶点、通路相关蛋白进行验证（这套路小记者也是分享过的哦，速去往前看）；
⑥ 先通过网络药理学与多组学（如转录组学、脂质组学和蛋白质组学等）的整合探讨了药物作用的潜在机制，使用Western blot等实验验证相关信号通路，最后用分子对接进一步验证（组合拳走起拿高分哈~）；
⑦ 通过公共数据挖掘、网络药理学以及分子对接技术探讨药物治疗疾病的用药规律和作用机制（叠加临床公共数据库等buff，酷酷发高分）；
⑧ 通过网药筛选潜在活性成分及靶点，采用代谢组学筛选药物治疗疾病的关键代谢物，整合网络药理学与代谢组学研究结果得到药物治疗疾病的关键成分及靶点，最后通过分子对接进行验证（加入老朋友代谢组学锦上添花~）；
⑨ 网络毒理学（这你不会还不知道吧？最近可是有点子火的哦~）。
朋友们对这些思路有没有似曾相识的感觉？那是因为不少思路小记者早已经为大家分享过了，毕竟咋可是紧追热点思路的小能手~
今天呢就再带大家看一篇网络药理学+分子对接+体内外实验的干湿结合绝佳思路文章！
文章由中国药科大学团队发表在咋们的梦中情刊Phytomedicine上，研究运用网络药理学分析筛选药物靶点和通路，阐释了中药成分芦丁治疗糖尿病肾病（DN）的潜在机制；利用分子对接进行验证，保证了研究结果的可靠性；通过建立db/db小鼠模型和体外培养人足细胞（HPC）模型，在动物整体水平和细胞水平上进一步验证了芦丁对DN的治疗作用，为芦丁的临床应用提供了科学依据。
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一句话总结这篇文章：这篇文章通过整合网络药理学和实验验证的方法，研究了芦丁对糖尿病肾病模型小鼠的肾脏保护作用，发现芦丁通过抑制Src激酶阻断高血糖诱导的EGFR/ERK信号通路的激活，从而减轻足细胞损伤，表明芦丁可能作为一种有前景的治疗糖尿病肾病的药物。
研究方法
l网络药理学分析：通过TCMSP、PharmMapper、SuperPred和SwissTargetPrediction数据库获取芦丁的相关靶点；从GeneCards、TTD、DrugBank、DisGeNET和OMIM数据库中获取DN相关靶点。找出共同靶点。
lPPI网络构建：使用STRING数据库构建共同靶点的PPI网络，并使用Cytoscape软件进行可视化；通过CytoNCA插件分析网络的拓扑参数，选择度中心性(DC)等于或大于中位数的核心靶点。
lGO和KEGG富集分析：使用DAVID数据库对核心靶点进行GO和KEGG富集分析，以了解芦丁对DN的主要功能和途径。
l分子对接：从PDB数据库获取蛋白靶点的晶体结构，从PubChem数据库获取芦丁的三维结构；使用AutoDock软件进行分子对接，评估芦丁与蛋白靶点之间的相互作用。
l实验验证：
① 动物实验：使用db/db小鼠模型和正常血糖小鼠进行实验，评估芦丁对血糖、蛋白尿和肾功能的影响。
② 生化分析：检测尿液和血液中的微量白蛋白尿(MAU)、血糖、总胆固醇(T-CHO)、甘油三酯(TG)、肌酐、血尿素氮(BUN)和尿白蛋白肌酐比(UACR)。
③ 组织病理学研究：对肾脏组织进行H&E、PAS和Masson染色，观察肾脏的病理变化。
④ 氧化应激水平的检测：使用DHE染色测量肾脏组织中超氧化物的产生量，并检测肾脏组织中超氧化物歧化酶(SOD)的活性。
⑤ 免疫荧光分析：对肾脏组织切片和人类足细胞进行免疫荧光分析，评估足细胞损伤。
⑥ 西方印迹分析：检测肾脏组织和人类足细胞中相关蛋白的表达。
⑦ 细胞培养：使用人类足细胞(HPC)模型，评估高糖环境下芦丁对细胞活性、氧化应激水平和足细胞损伤的影响。
研究主要发现
1.网药分析
2.功能富集分析
3.分子对接
4.实验
文章小结
文章采用了网络药理学的方法来预测和分析芦丁可能的作用靶点和机制，然后通过实验验证这些理论预测，值得一提的是，不仅在细胞层面进行了验证，还在动物模型上进行了实验，多层面的实验验证可以更全面地评估芦丁的疗效和安全性。
此外，不仅研究了芦丁对糖尿病肾病的治疗效果，还深入探讨了其作用机制，特别是芦丁通过抑制Src激酶阻断高血糖诱导的EGFR/ERK信号通路的激活，为糖尿病肾病的治疗提供了新的视角。（PS：中药结合网络药理学等先进的生物信息学技术，可以让你的文章既富有创新性，又节省时间成本，感兴趣的小伙伴速速联系小记者吧！）
