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哦买噶,这可是稳坐1区的“水刊”之王Nature Communications!南医大这篇“以量取胜”的孟德尔随机化,值得一看

哦买噶,这可是稳坐1区的“水刊”之王Nature Communications!南医大这篇“以量取胜”的孟德尔随机化,值得一看 生信日报
2025-03-31
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提到“顶刊中的水刊,水刊中的顶刊”,大家想到的是不是就是Nature Communications了?但是真别瞧不上它啊,虽然它发文量大的惊人,还被列为了“Mega Journal”,但中科院分区出来,它还是稳稳的坐在1区宝座!你说“水”,又有几个期刊能达到它的水平?又有多少人能发到这本杂志上呢?如果能发上一篇14.7分的文章,还有Nature子刊的头衔,岂不是做梦都要笑醒!

小记者这次就带来一篇南京医科大学尹先勇教授联合国外团队新发表的NC文章,孟德尔随机化主题,但这篇与咱们常规MR分析文章有所不同,它是“以量取胜”的,下面来一起看看吧~

该文章评估1099种血浆代谢物对2099种二元疾病终点的潜在因果影响

首先从题目中就可以看出这个选题之大:涉及1099种血浆代谢物和2099种疾病性状,代谢组学数据的应用和选题都非常新颖,同时也具有较高的研究意义,以量取胜的MR选题比较少见,创新性高,也奠定了发高分的基础;分析上就只用了双样本MR分析(包括单变量和多变量MR分析),就是最基础的MR分析,难度较低,选题好的情况下仅用了MR分析就NC上,这性价比可比生信高太多了,如果有数据,以量取胜的MR发文策略也挺香啊!

MR新思路已就位,科研党速度冲!单独MR分析发高分能以量取胜也不错!不论是选题拿不准,还是思路、分析搞不定都可以找小记者团队评估设计,经验丰富,尽量让你的发文少走点弯路,抓住风口赶紧发文! 

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题目:评估1099种血浆代谢物对2099种二元疾病终点的潜在因果影响

杂志:Nature Communications(IF=14.7)

发表日期:2025年3月

研究背景

代谢物是用于估计疾病风险和阐明疾病生物学的小分子,已经显示出预测未来疾病的潜力,然而,代谢物对人类疾病的因果影响尚未得到全面评估。

研究思路

该研究提取了来自METSIM代谢组学的1099代谢物的GWAS汇总统计数据和来自FinnGen release 8数据库的2099种疾病特征的GWAS汇总统计数据,使用双样本单变量和多变量MR分析系统地评估了1099种血浆代谢物对2099个疾病终点的潜在因果影响。(ps:大规模GWAS数据处理量和速度非常吃设备,小记者建议大家用上生信服务器,带有GPU可为分析加速,可共享或独享,附带一对一技术指导,有需要欢迎咨询小记者)

主要结果

1. 单变量MR分析鉴定出70种血浆代谢物对183种疾病特征的282种潜在因果效应,其中32个代谢物显示对一个以上的疾病性状有显著的推定因果效应,25种显示出对两种或两种以上疾病性状的显著潜在因果影响

图1:单变量MR分析

图2:70种代谢物对183种芬根病特征的282种潜在因果影响的热图

2. 计算了 70 个重要代谢物中每对代谢物的表型相关性和 IV 效应相关性(rIV),结果发现,一些潜在的致病代谢物对同一疾病性状有很强的相关性

图3:70种代谢物的表型相关性和共享IV

3. 同一疾病的潜在独立因果代谢途径

单变量MR确定了53种具有一种以上假定因果代谢物的疾病特征,多变量MR确定了17种代谢物对23种疾病特征的20种显著的假定因果效应。研究表明,对相同疾病特征具有显著单变量假定因果效应的代谢物可能通过单独的代谢途径或通过代谢级联在疾病发病机理中起作用。比如在房颤和焦虑性人格障碍的三种测试代谢物中确定了两种独立的代谢途径,突出了人类疾病中潜在因果代谢途径的异质性。

图4:焦虑型人格障碍的两条代谢途径

小结

4张结果图打下14.7分+江山,这等好事怎能错过!用上“以量取胜”选题的MR分析真的太太太能打了!并且全文只用了双样本MR分析方法,实操的难度不高,只是工作量稍大,但性价比确实高!目前想用MR分析发高分,除了走联合思路,以量取胜拼选题也不错,有数据有想法的朋友可以试试!MR分析可以找小记者来评估和设计选题,如果分析实现有难度,也就可以随时联系小记者帮忙!专业团队为你保驾护航,1V1定制创新思路和分析~


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