朋友们，小记者今天给大家分享一篇NC上的文章，跟咱们常见的套路有点点子不一样！
虽说NC总被大家调侃为“顶刊中的水刊，水刊中的顶刊”，但对文章质量的要求还是比较高的，纯生信想发NC难度很大，但今天这个文章就是纯生信，“共病分析”方向，有了新思路的加持，直接一把冲顶！下面咱们就来挖挖亮点~
该文章研究阿尔茨海默病和心血管性状之间的共有遗传结构和潜在治疗靶点
1.选题：定为“共病分析”这个热点方向，热度非常高够且研究意义也较高，阿尔茨海默病和心血管联合分析的创新性也不错，给发高分奠定了一个好的基础；
2.思路：设计为遗传相关分析+单细胞数据分析，共病分析一般套路是做常规生信分析（包括单细胞分析），MR分析和队列分析等，将遗传分析与单细胞等常规生信分析联合起来的思路还是比较少见的，创新性很强，对文章分数的拔高作用非常大！
共病分析热度不减，再与新颖的思路设计一结合，顶刊文章这不就到手了嘛！不过文章涉及到的遗传相关分析、单细胞分析对生信新手朋友估计稍有难度，自己搞不定的可以找小记者帮忙！做课题没想法？想实践没条件？小记者等你召唤！创新思路设计、个性化生信分析方案定制、生信服务器租赁，你所需的服务我应有尽有，欢迎来询~
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题目：多性状关联分析揭示了阿尔茨海默病和心血管性状之间的共有基因位点
杂志：Nature Communications（IF=14.7）
研究背景
阿尔茨海默病(AD)被认为是一种大脑特异性疾病，但越来越多的证据表明，广泛的心血管(CV)异常和AD之间存在联系。已有研究发现，AD和CV性状有共同的遗传决定因素，但调节AD和CV联系的精确机制和分子过程仍然难以捉摸。
研究思路
首先对AD和5个CV性状进行了五项成对多性状GWAS分析（MTAG），随后进行了遗传共定位分析，以突出候选多效性基因及其作用的组织位点。为了进一步描述这两种疾病中涉及的生物学途径，利用单细胞RNA测序数据进行疾病差异基因表达，以探索大脑和心血管组织中相关的基因共表达网络和蛋白质相互作用。（大规模GWAS分析、单细胞分析数据处理太慢？那是没用上带GPU的生信服务器，有需要可联系小记者，用它给你的分析提提速吧！）
图1：研究流程图
主要结果
1. 多性状遗传关联分析确定了5个新的AD基因座和9个AD和CV性状间的共有基因座
表1：在全基因组显著性水平上与所研究性状相关的新基因位点
2. 共定位分析鉴定出21个基因座共位于AD和CV性状之间，其中有3个位点的单个候选因果变异解释了很大一部分关联：rs11786896（PLEC，与 AD-AF 共定位）、rs7529220（HSPG2，与AD-AF共定位）和rs429358（APOE，与AD-CAD共定位）
图2：AD和CV性状之间共定位位点的分布
3. 随后的精细定位和共定位位点分析揭示了与AD和CV性状相关的16个遗传位点，优先考虑了rs11786896，它与AD、AF以及心脏左心室中PLEC的表达共定位；其次是rs7529220，它与阿尔茨海默病、心房颤动以及C1Q家族基因的表达共定位
图3：候选因果变异rs11786896（PLEC）的共定位位点分布
4. 单细胞分析、共表达网络和PPI分析发现，PLEC在AF左心室内皮细胞和心肌细胞中上调，在AD脑星形胶质细胞中上调。对于AF中的心脏巨噬细胞和AD中的脑小胶质细胞，C1Q也涉及类似的共同机制
图4：从心脏组织的单核转录组中寻找增加心肌病风险的基因
图5：从人类死后大脑的单核转录组中寻找增加AD风险的基因
小结
这篇文章“共病分析”热门方向与“遗传分析+单细胞分析”创新思路的搭配非常完美，创新性非常高，内容丰富，整体质量很高，具备纯生信拿NC的实力，想冲高分的朋友可以参考复现！其中GWAS、共定位、单细胞分析对于新手可能有一定的分析难度，有需要可以找小记者帮忙分析。联合思路设计有难度？选题方向搞不定拿不准？想不费力的发高分文章？找小记者！专业的思路设计和生信分析团队为您提供1V1的方案定制服务，有需要随时联系~
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